Полиморфизм генов системы HLA II класса малой народности нагайбаков, проживающих в Челябинской области

Работа проводилась на кафедре микробиологии, иммунологии и общей биологии биологического факультета ФГБОУ ВО «ЧелГУ» на базе лаборатории иммунологических исследований ГБУЗ «Челябинская областная станция переливания крови»
Оценка распределения частот генов и гаплотипов системы HLA-II класса в популяции нагайбаков Челябинской области
В популяции нагайбаков обнаружено 13 аллельных семейств в локусе HLA-DRB1, 7 аллельных семейств в локусе HLA-DQA1 и 13 аллельных семейств в локусе HLA-DQB1.
Среди них с высокой частотой (gf≥0,17) встречались аллели DRB1*01, DRB1*07, DQA1*01:01, DQA1*05, DQB1*03:01 и DQB1*05:01. Распределение наблюдаемых частот аллелей локусов HLA-DRB1, -DQA1, -DQB1 соответствует ожидаемым, согласно закону Харди-Вайнберга [1,2,4,5,6,8,10,11,16].
При анализе частот встречаемости двух- и трехлокусных гаплотипов HLAII класса и параметров их сцепления в популяции нагайбаков было обнаружено: 23 варианта двухлокусных гаплотипов HLA-DRB1/DQB1 частота встречаемости 18 превышала HF≥0.010, из них 11 достоверно сцеплены (P value <0,0001; P value = 0,0001) [5,8,9,10,11,16]; 20 вариантов двухлокусных гаплотипов HLA-DRB1/DQA1 частота встречаемости 18 гаплотипов превышала HF≥0,010, из них 14 достоверно сцеплены (P value <0,0001; P value = 0,0001) [5,8,9,10,11,16]; 16 вариантов двухлокусных гаплотипов HLA- DQA1/DQB1 частота встречаемости 13 превышала HF≥0,010, из них 8 достоверно сцеплены (P value <0,0001; P value = 0,0001) [5,8,9,10,11,16]; 24 варианта трехлокусных гаплотипа HLA-DRB1/DQA1/DQB1, частота встречаемости 19 из них превышала HF≥0,010, из них 18 достоверно сцеплены (P value <0,0001; P value = 0,0001). В трех случаях встречается гаплотип DRB1*07-DQA1*03-DQB1*03:01 (HF=0,013), ранее не выявленный ни в одной из исследованных мировых популяций [5,8,9,10,11,16]. Среди высокочастотных двухлокусных гаплотипов отмечаются: гаплотипы DRB1*01-DQB1*05:01 (HF=0,168), DRB1*01-DQA1*01:01 (HF=0,174), DQA1*01:01- DQB1*05:01 (HF=0,193) характерные для финно-угорских народов и европейских популяций славянской семьи [5,8,9,10,11,16]; гаплотипы DRB1*07-DQB1*02:02 (HF=0,147), DRB1*07-DQA1*02 (HF=0,161), характерные для некоторых популяций средней полосы Евразии, в том числе башкир, удмуртов и бурятов [5,8,9,10,11,16]. Наиболее распространенный в популяции нагайбаков трехлокусный гаплотип HLA- DRB1*01-DQA1*01:01-DQB1*05:01 (HF=0,171) также характерен для популяций финской части финно-угорских народов (финны, марийцы, чуваши, саамы, удмурты). С высокой частотой в популяции нагайбаков встречается трехлокусный гаплотип HLA-DRB1*07- DQA1*02-DQB1*02:02 (HF=0,147), который встречается с высокой частотой в основных популяциях Челябинской области (башкир, всех субэтносов татар и казахов) Достаточно высокая в популяции нагайбаков частота трехлокусного гаплотипа HLA-DRB1*03- DQA1*05-DQB1*02:01 (HF=0,100), также как и типичных гаплотипов с аллелем DRB1*04, характерного для европейских популяций (белорусов, хорватов, поляков и т.д.) Четвертое место среди высокочастотных трехлокусных гаплотипов данной популяции занимает DRB1*11-DQA1*05-DQB1*03:01 (HF=0,070), наиболее характерный для южнославянских популяций, популяций Турции (Юг Европы близкий к Средиземноморью) [5,8,9,10,11,16]. Частоты трехлокусных гаплотипов, характерных для азиатских популяций у нагайбаков достаточно малы и составляют DRB1*09-DQA1*03-DQB1*03:03 – HF=0,047; DRB1*12-DQA1*05-DQB1*03:01 – HF=0,040; DRB1*14-DQA1*01:01-DQB1*05:02-04 – HF=0,009; DRB1*14-DQA1*01:01-DQB1*05:03 – HF=0,009 [5,8,9,10,11,16]. Обобщая полученные результаты распределения генных частот и гаплотипов системы HLA II класса в популяции нагайбаков, можно выделить: высокая частота типичных европейских и невысокая азиатских генов и гаплотипов системы HLA II класса показывает принадлежность к европейским популяциям с некоторыми особенностями; присутствие в генотипе нагайбаков особенных уникальных признаков, может свидетельствовать об открытости популяции в период ее формирования. 2. Сравнительный анализ частот генов и двухлокусных гаплотипов системы HLA II класса популяции нагайбаков с популяциями, проживающими в Челябинской области (русские, татары и башкиры) В ходе сравнения было определено, что популяция нагайбаков отличается от популяции русских Челябинской области: по 5 аллелям - DRB1*09 (gf=0,05 и gf=0,01 соответственно), DRB1*12 (gf=0,04 и gf=0,01 соответственно) у нагайбаков встречаются с более высокой частотой, чем у русских; DRB1*15 (gf=0,08 и gf=0,15) встречается в популяции нагайбаков значительно реже, чем в популяции русских, данный аллель имеет широкое распространение по всему миру, но у нагайбаков его частота встречаемости ниже средней; частота аллелей DQA1*01:02 и DQB1*06:02-08 в популяции нагайбаков средняя (gf=0,09 и gf=0,10 соответственно), а в популяции русских высокая (gf=0,18 и gf=0,21 соответственно), различия статистически значимы [11,14,15,17]; по 5 двухлокусным гаплотипам – гаплотипы DRB1*09-DQB1*03:03, DRB1*12-DQB1*03:01в популяции нагайбаков встречаются достоверно чаще (HF=0,05 и HF=0,04 соответственно), чем в популяции русских Челябинской области (HF=0,01 и HF=0,01 соответственно), гаплотип DRB1*15-DQB1*06:02 в популяции нагайбаков статистически значимо встречается реже, чем в популяции русских, так же достоверно реже встречаются в популяции нагайбаков гаплотипы DQA1*01:02-DQB1*06:02, DQA1*01:03-DQB1*06:03- 08. Различия в данных популяциях подчеркивают индивидуальные особенности популяции нагайбаков относительно низкой частоты аллелей DRB1*15, DQB1*06:02-08 и гаплотипов DRB1*15-DQB1*06:02, DQA1*01:02-DQB1*06:02, которые являются широко распространенными в большинстве мировых популяций [11,14,15,17]. Но при этом по ряду европейских аллелей и гаплотипов (DRB1*01, DQA1*01:01, DQA1*05, DQB1*05:01, DRB1*01-DQB1*05:01, DQA1*01:01-DQB1*05:01) в этих популяциях наблюдается схожая высокая частота, что отражает совместное формирование этих популяций в близкой географической зоне [11,14,15,17]. Согласно сравнительному анализу популяции нагайбаков с популяцией татар Челябинской области определяются близкие черты: высокие частоты по ряду аллелей: DRB1*07 (gf=0,17 и gf=0,20 соответственно), DRB1*01 (gf=0,18 и gf=0,11 соответственно) DRB1*13 (gf=0,09 и gf=0,14 соответственно), DQA1*05 (gf=0,28 и gf=0,24 соответственно), DQB1*02:01-02 (gf=0,25 и gf=0,23 соответственно), DQB1*03:01 (gf=0,22 и gf=0,19 соответственно); средняя частота аллеля DRB1*04 (gf=0,10 и gf= 0,09 соответственно) [11,14,15,17]. Различия определены: по 2 аллелям - значительно ниже в популяции нагайбаков встречаются DQA1*01:02, DQB1*06:02-08 по сравнению с частотой в популяции татар Челябинской области [11,14,15,17]; 3 двухлокусным гаплотипам - DRB1*15-DQB1*06:02, DQA1*01:03-DQB1*06:03-8 встречаются реже в популяции нагайбаков, а гаплотип DRB1*15-DQB1*06:01 не определен в популяции татар Челябинской области, а у нагайбаков представлен в низкой частоте (HF=0,03) [11,14,15,17]. Согласно полученным данным популяция нагайбаков имеет больше схожих иммуногенетических характеристик по генам и гаплотипам HLA II класса с популяцией татар Челябинской области, чем различий, в том числе это касается присутствия в высокой частоте аллеля DRB1*07 и гаплотипа 07-DQB1*02:01-02 определяющих тюркский вклад в обе популяции. Сравнивая популяцию нагайбаков с популяцией башкир Челябинской области было определено больше всего различий, чем с другими популяциями Челябинской области, а именно: по 6 аллелям - DRB1*01 и DRB1*03, DQA1*05, DQB1*05:01 встречаются значительно чаще в популяции нагайбаков, по сравнению с башкирской популяцией, DRB1*12 встречается достоверно реже в популяции нагайбаков (gf=0.04), по сравнению с башкирской популяцией (gf=0.08); аллель DQB1*06:02-08 достоверно реже встречается в популяции нагайбаков (gf=0.10), по сравнению с частотой встречаемости данного аллеля в популяции башкир (gf=0,23), следует отметить, что отличия по данному аллелю у нагайбаков характерны для всех, исследуемых авторами групп сравнения [11,14,15,17]; 7 двухлокусным гаплотипам - DRB1*01-DQB1*05:01, DRB1*03- DQB1*02:01 представлены в популяции нагайбаков с более высокой частотой (HF=0.17 и HF=0.010 соответственно), чем в популяции башкир (HF=0.07 и HF=0.05 соответственно), также гаплотип DQA1*01:01-DQB1*05:01 в популяции нагайбаков (HF=0.193) встречается значительно чаще, чем в популяции башкир (HF=0.079), вышеперечисленные гаплотипы характерны для европейских и финно-угорских популяций, гаплотипы DRB1*12-DQB1*03:01, DRB1*13-DQB1*06:03-08, DQA1*01:02-DQB1*06:02, DQA1*01:03-DQB1*06:03-08 в популяции нагайбаков встречаются достоверно реже, чем в популяции башкир [11,14,15,17]. На основании выявленных генетических характеристик популяции нагайбаков и проведенных сравнительных исследований нагайбаков с популяциями русских, татар и башкир Челябинской области можно сделать ряд заключений: 1) Популяция нагайбаков наряду с популяциями русских и татар Челябинской области имеет характерные признаки европеоидной популяции: высокая частота аллелей DRB1*01 (gf=0,179), DRB1*03 (gf=0,103), DRB1*04 (gf=0,098), DRB1*11 (gf=0,085), DQA1*01:01 (gf=0,214), DQA1*02 (gf=0,161), DQA1*03 (gf=0,161), DQA1*05 (gf=0,281) [11,14,15,17]; высокая частота двухлокусных гаплотипов DRB1*01-DQB1*05:01 (HF=0,168), DRB1*01-DQA1*01:01 (HF=0,174), DQA1*01:01-DQB1*05:01 (HF=0,193) [11,14,15,17]. 2) Меньше всего отличий по частотам генов и двухлокусных гаплотипов системы HLA II класса у популяции нагайбаков с популяцией татар. Данные популяции схожи по большинству частот аллелей и гаплотипов: DRB1*07 (gf=0,17 и gf=0,20 соответственно), DRB1*01 gf=0,18 и gf=0,11 соответственно), DRB1*13 (gf=0,09 и gf=0,14 соответственно), DQA1*05:01 (gf=0,28 и gf=0,24 соответственно), DQB1*02:01-02 (gf=0,25 и gf= 0,23 соответственно), DQB1*03:01 (gf=0,22 и gf=0,19 соответственно); средняя частота аллеля DRB1*04 (gf=0,10 и gf=0,09 соответственно), высокая частота встречаемости гаплотипа DRB1*07-DQB1*02:01-02 (HF=0,147 и HF=0,159 соответственно), средняя частота встречаемости DRB1*11-DQB1*03:01 (HF=0,083 и HF=0,104 соответственно) [11,14,15,17]. Возможно, это объясняется близким историческим формированием этнических групп кряшен и нагайбаков, имеющих общих предков с татарами и географической близостью популяций нагайбаков и татар Челябинской области. 3) Относительно высокая частота аллеля DRB1*07 (gf=0,17) и в частности гаплотипа DRB1*07-DQB1*02:01-02 (HF=0,147), схожего по частоте с популяцией татар Челябинской области, выявляет у нагайбаков черты тюркского происхождения. [11,14,15,17]. 4) Появление в генотипе нагайбаков аллеля DRB1*12, характерного для популяции башкир, также может быть от истоков формирования этнической группы нагайбаков, которая формировалась на территории Башкирии [11,14,15,17]. Популяции Нагайбаки ЧО Русские ЧО Марийцы Поляки Удмурты Чуваши Башкиры ЧО Татары ЧО Немцы Манси Калмыки Белорусы Хорваты Монголы Финны Ненцы Генетическое расстояние с нагайбаками, Da 0,00 0.066096 0.072238 0.078201 0.100396 0.101935 0.106936 0.117237 0.128361 0.157331 0.166675 0.176002 0.180445 0.205432 0.269463 0.300642 5) Для популяции нагайбаков характерно присутствие аллеля DRB1*09 в достоверно повышенной его частоте относительно популяции русских Челябинской области (gf=0,05 и gf=0,01), характерного для популяций азиатского происхождения (монгол, корейцев, китайцев, ненцев) [11,14,15,17]. Данный феномен можно объяснить, тем, что в состав нагайбакского казачества в середине 18 века была включена группа «пленных выходцев» из государств Центральной и Западной Азии или уровень этих генов и гаплотипов был того же уровня в основной популяции при образовании этноса. 6) В популяции нагайбаков выявлен гаплотип DRB1*07-DQA1*03-DQB1*03:01 (HF=0,013), ранее не встречавшийся ни в одной из исследованных мировых популяций, его появление можно объяснить рекомбинацией генов в достаточно географически и культурно изолированной популяции нагайбаков в период с конца XVIIII века по настоящее время [5,8,9,10,11,16]. 3.Анализ определения места популяции нагайбаков в генофонде евразийских популяций В рамках расчета генетических расстояний, построения дендрограммы и проведения анализа соответствий для 23 евразийских популяций, включая исследуемую популяцию нагайбаков Челябинской области (ЧО), были использованы данные по частотам генов локуса HLA-DRB1 системы HLA II класса [13,16,17]. В таблице 2 приведены генетические расстояния 22 популяций, относительно популяции нагайбаков. Таблица 2 - Генетические расстояния по Нею между нагайбаками и 22 популяциями Евразии, рассчитанные по генам локуса HLA-DRB1 Буряты Корейцы Тувинцы Саамы Россия Турки Кеты Эвенки 0.325440 0.326990 0.334595 0.341654 0.376925 0.467422 0.643171 Согласно данным генетических расстояний ближе всего к популяции нагайбаков по генам системы HLA II класса находится популяция русских Челябинской области, марийцев и поляков. Данные результаты говорят о возможном вкладе в формирование нагайбаков европейских и финно-угорских народов. На основе генных частот генов локуса HLA-DRB1 системы HLA II класса в 23 рассматриваемых популяций выполнен анализ соответствий. Результаты анализа соответствий представлены на рисунке 1 [13,16,17]. Рисунок 1 - Анализ соответствий для 23 популяций по первой и второй осям инерции на основе генов локуса HLA-DRB1 системы HLA II класса График построен по двум первым осям инерции (axis 1 – 35%, axis 2 – 15%). Анализ соответствий визуально показывает распределение частот генов между популяциями и выделяет группы, объеденные близкими частотами. Аллельные семейства локуса HLA-DRB1 распределились по уровню частот в популяциях, чем выше частота данного аллеля в популяции, тем ближе к ней точка аллеля На положительной стороне первой оси инерции выстроились европейские популяции: восточнославянские (русские и белорусы), центрально-славянская популяция поляков, немцы, а также популяции финно-угорской группы России, у которых более выражена финская компонента. Они имеют схожие частоты аллелей DRB1*01, DRB1*03, DRB1*07, DRB1*15, которые расположены на этом же регионе графика. На отрицательной стороне первой оси инерции расположились популяции азиатского населения Евразии (монголы, буряты, тувинцы). Эти популяции объединяют сходные частоты аллелей DRB1*09, DRB1*10, DRB1*12, DRB1*14 и ряд популяций смешанного происхождения, среди них башкиры Челябинской области и манси у которых. Они занимают промежуточное положение между европейскими популяциями и азиатскими популяциями восточной Евразии. Финны и саамы России в распределении популяций отдалились по второй оси инерции в крайнее отрицательное положение. На основе генетических расстояний, рассчитанных по частотам генов локуса HLA- DRB1, построена дендрограмма методом присоединения соседей (Neighbour Joining) для 23 популяций Евразии с помощью стандартизированной программы Phylip-3.68 (рисунок 2) [13,16,17]. Рисунок 2 - Дендрограмма по методу присоединения соседей на основе генетических расстояний 23 популяций Евразии На дендрограмме четко выделена группа, объединяющая нагайбаков Челябинской области, чуваш, проживающих на одноименной территории, популяций марийцев и удмуртов. Финны и саамы, объединяясь в отдельную группу, в данном случае выступают пограничной территорией между крупными объединениями популяций. Верхнее объединение дендрограммы представлено популяциями в большей степени азиатского происхождения и народами Севера: корейцы, эвенки, кеты, монголы, тувинцы, калмыки, буряты, ненцы. Нижнее объединение дендрограммы представлено популяциями восточной Европы (турки, поляки и хорваты), немцами, русскими Челябинской области, белорусами, чувашами, татарами, башкирами, финно-угорским народами (манси, марийцы, удмурты) и нагайбаками. Нижнее объединение распределилось на 5 подгрупп. В первую подгруппу (с нижней стороны дендрограммы) вошли популяции русских Челябинской области, немцев, белорусов и поляков. Во вторую – турки, хорваты. В третью вошла исследуемая нами популяция нагайбаков Челябинской области, чуваши, марийцы и удмурты. Отдельной переходной популяцией выступила популяция татар Челябинской области. Пятая подгруппа объединила популяции башкир и манси. Обсуждение Распределение частот генов и гаплотипов системы HLA II класса в популяции нагайбаков характеризует ее как популяцию смешанного типа. С одной стороны высокая и средняя частота аллелей DRB1*01 (gf=0.18), DRB1*03 (gf=0.10) и DRB1*11 (gf=0.09), а также высокие и средние частоты гаплотипов DRB1*01-DQA*01:01-DQB*05:01 (HF=0,171); DRB1*03-DQA1*05:01-DQB1*02:01 (HF=0,10); DRB1*11-DQA1*05:01- DQB1*03:01 (HF=0,07) говорят о европейском вкладе, и приближает популяцию нагайбаков к популяции русских Челябинской области [2,4,5,6,9,10]. Типичный европейский гаплотип DRB1*03-DQA*05-DQB*02:01 у нагайбаков встречается с частотой (HF=0,100), характерной для европейских популяций Евразии [16]. Особый интерес в этом плане представляет гаплотип DRB1*01-DQA*01:01- DQB*05:01 и аллели в него входящие. Он превалирует в популяции нагайбаков с частотой HF=0,174 [10,15,16]. Наибольшая частота этого гаплотипа зарегистрирована в популяции финнов, а также финно-угорских популяций России, отражающих финский вклад в этногенез, а именно мари (HF=0,228), удмурты (HF=0,131), саамы (HF=0,145) (Болдырева [и др.] HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. II. Народы европейской части. Иммунология. 2006. Т.27, No4. С. 198-202). Высока частота этого гаплотипа также во многих татарских субэтносах России. Интересно отметить, что у русских этот гаплотип встречается несколько чаще, чем в других европейских популяциях немцы, чехи, поляки (до HF=15 %). Данный гаплотип входит в пятилокусный анцестральный гаплотип А*3- В*35-DRB1*01:01-DQA1*01:01-DQB1*05:01, частота которого среди жителей Российских городов составляет (от HF= 0,070 и до HF=0,104), и позволяет этому гаплотипу входить в тройку наиболее распространённых гаплотипов России (Хамаганова Е.Г. [и др.] HLA- A*/B*C*/DRB1*/DQB1*-гены и гаплотипы у доноров костного мозга регистра ФГБУ «Гематологический научный центр» Минздрава России, самоопределившихся как русские. Гематология и трансфузиология. 2017. 62(2). С. 65-70). Другой распространенный в Европе гаплотип DRB1*15-DQA*01:02-DQB*06:02 у нагайбаков составляет HF=0,045. Это намного ниже, чем в ближайших популяциях, проживающих в Челябинской области русских, татар и башкир, в том числе сниженную частоту имеют аллели популяции нагайбаков, входящие в данный гаплотип. Этот гаплотип является высокочастотным для большинства европейских популяций, особенно высоки его частоты на севере Европы (поляки HF=13,6%). В популяциях юга Европы его частота варьирует от HF=0,038 (гагаузы, армяне) до HF=0,17 (белорусы) (Болдырева, М.Н. HLA–генетическое разнообразие населения России и СНГ. III. Народы Евразии. Иммунология. 2006. No 6. С. 324–329). У русских различных областей частота данного гаплотипа составляет HF=0,113 русские Челябинской области, HF=0,134 – русские Ростов-на-Дону, HF=0,082 – у башкир Челябинской области, HF=0,102 – у татар Челябинской области (Ищенкова И. В. [и др.] Гены HLA II класса DRB1 и DQB1 у доноров регистра гемопоэтических стволовых клеток г. Ростова–на–Дону. Вестник гематологии ФГБУ РосНИИГТ ФМБА России. 2018. Том XIV No 2.С. 4–11.; Suslova T. A. [et al]. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). International Journal of Immunogenetics. 2012. 39(5). P.394–408). Такое резкое снижение частоты гаплотипа DRB1*15-DQA*01:02- DQB*06:02 является характерной особенностью популяции нагайбаков, что отличает их от остальных популяций, проживающих на Южном Урале [15,16,17]. Вторым по частоте гаплотипом HLA-II класса в популяции нагайбаков является гаплотип DRB1*07-DQA1*02-DQB1*02:02 (HF=0,147). Данный гаплотип максимально распространён у удмуртов (HF=0,238), татар (HF=0.201 Кировская область HF=0,159 Челябинская область), башкир (HF=0,199), бурятов (HF=0,118), у русских Ростов-на-Дону (HF=0,096), русские Челябинской области (HF=0,108) (Ищенкова И. В. [и др.] Гены HLA II класса DRB1 и DQB1 у доноров регистра гемопоэтических стволовых клеток г. Ростова–на–Дону. Вестник гематологии ФГБУ РосНИИГТ ФМБА России. 2018. Том XIV No 2.С. 4–11.; Поздеева О.С. [и др.]. Гены гистосовместимости II класса в популяции удмуртов. Иммунология. 2014. No 2. С. 60–63; Кутявина С.С. [и др.] Генетические особенности HLA–аллелей у бурят, проживающих на территории Иркутской области. Гематология и трансфузиология. 2017. 62(3). С. 147–152.). В высоких частотах он представлен в популяциях Евразии, в истории которых был скотоводческий уклад ведения хозяйства, включая зороастрийцев Ирана и Пакистана (HF=0,154-0,149) [10,15,16,17]. Интересно отметить, что появление в популяции нагайбаков гаплотипа DRB1*07- DQA1*03-DQB1*03:01 говорит о формировании в популяции уникальных особенностей, характерных только для популяции нагайбаков. Хотя низкая частота встречаемости данного гаплотипа, может говорить о случайных рекомбинациях. Частота гаплотипа DRB1*12-DQA1*05-DQB1*03:01 составляет в популяции нагайбаков HF=0,040. Это выше, чем у европейцев (HF=0,010 – русские Челябинской области, HF=0,016 – русские Ростов-на-Дону, белорусы HF=0,01-0,03, украинцы HF=0,01- 0,02 , поляки HF=0,012), но величина не достигает уровня азиатских популяций, в которых эти частоты максимальны, к примеру, частота DRB1*12: ненцы (gf=0, 152), буряты (gf=0,62), башкиры (gf=0,051) (Болдырева, М.Н. HLA–генетическое разнообразие населения России и СНГ. III. Народы Евразии. Иммунология. 2006. No 6. С. 324–329) [10,15,16,17]. Такая же тенденция сохраняется в отношении гаплотипа DRB1*09-DQA1*03- DQB1*03:03, его частота у нагайбаков составляет HF=0,047. В то время как у русских Челябинской области – HF=0,014, у русских Ростов-на-Дону – HF=0,009, татар Челябинской области – HF=0,03, башкир Челябинской области – HF=0,034, максимальные частоты этого гаплотипа у ненцев – HF=0,163 и мари – HF= 0,114, частота на уровне HF=0,50 отмечена у калмыков, тувинцев, бурятов, коренных народов Сибири: ульчи, негидалы, эвенки охотские (Болдырева, М.Н. HLA–генетическое разнообразие населения России и СНГ. III. Народы Евразии. Иммунология. 2006. No 6. С. 324–329; Ищенкова И. В. [и др.] Гены HLA II класса DRB1 и DQB1 у доноров регистра гемопоэтических стволовых клеток г. Ростова–на–Дону. Вестник гематологии ФГБУ РосНИИГТ ФМБА России. 2018. Том XIV No 2.С. 4–11.) [10,15,16,17]. Таким образом, частота гаплотипов, характерных для азиатских популяций Евразии, у нагайбаков выше, чем у европейских популяций (русские, украинцы, белорусы, татары), но ниже, чем у популяций с азиатским вкладом в этногенез (буряты, башкиры, ненцы). Это может отражать как вклад азиатского происхождения при формировании популяции (башкиры, аравитяне, пакистанцы входили в число жителей нагайбакской крепости при формировании этноса), так и дальнейшее совместное проживание нагайбаков на территории Башкирии в течение 100 лет до их переезда на территории Челябинской области. Учитывая вышеперечисленные аргументы, с точки зрения общепопуляционных характеристик, популяция нагайбаков является стандартной популяцией, имеющей нормальное генетическое разнообразие, стандартное распределение гетерозигот и гомозигот в популяции и уникальные генетические особенности. По иммуногенетическим характеристикам в популяции нагайбаков преобладают черты европейских и финно- угорских популяций, несмотря на географическую удаленность населенных пунктов проживания нагайбаков. На основе генных частот локуса HLA-DRB1 рассчитаны генетические расстояния между нагайбаками и 22 популяциями Евразии. Генетические дистанции распределились в порядке увеличения от географически приближенных популяций в сторону европейских популяций, ближе всех согласно генетической дистанции к исследуемой стала популяция русских Челябинской области, а наиболее отдаленной от популяции нагайбаков, согласно генетическому расстоянию стали популяции эвенков и кет [12,13,17]. Анализ соответствий визуализировал взаимоотношения 23 евразийских популяций, включая популяции Челябинской области, распределил популяции по осям координат, которые выстроились приближенно к их географическому местоположению и относительно частоты аллельных семейств локуса HLA-DRB1 [12,13,17]. Дендрологический анализ методом присоединения соседей распределил популяции на два блока: верхний и нижний. Верхний блок объединил популяции азиатского происхождения – калмыков, кет, тувинцев, монголов, бурятов, корейцев, ненцев и эвенков. В нижнем блоке выстроились популяции по группам удаленности от верхнего блока: манси и башкиры Челябинской области; татары Челябинской области; группа нагайбаки Челябинской области совместно с чувашами, марийцами и удмуртами; хорваты и турки; русские Челябинской области, немцы, поляки, белорусы. Саамы России и финны объединились в группу между верхним и нижним блоком [12,13,17]. Заключение В ходе исследования был проведен анализ распределения генов и гаплотипов локусов HLA-DRB1, HLA-DQB, HLA-DQA в популяции нагайбаков Челябинской области в сравнении с основными популяциями Челябинской области русскими, татарами и башкирами. Данные по сравнительной характеристике основных популяций Челябинской области (нагайбаков, русских, татар и башкир) указывают на близость популяции нагайбаков к популяциям русских и татар. Наибольшие отличия регистрировались у нагайбаков с популяцией башкир. Применение современных методов оценки генетического родства между популяциями позволило установить место нагайбаков в структуре евразийских популяций: по результатам анализа популяция нагайбаков имеет близкие взаимоотношения на иммуногенетическом уровне с популяцией русских Челябинской области, рядом популяций финно-угорских народов и популяцией чуваш, а также входит в блок популяций европейского происхождения. Полученные данные помимо самостоятельного популяционно-генетического значения применяются в качестве контроля для исследований по проблеме «HLA и болезни» (туберкулез, ревматоидный артрит и др.). Важным результатом работы стало включение данных о протипированных индивидуумах в базу данных Регистра потенциальных доноров стволовой клетки Челябинской областной станции переливания крови. Проведенные исследования демонстрируют уникальные особенности популяции нагайбаков, проживающих на территории Южного Урала, что открывает возможности для поиска доноров внутри данной популяции для самых разнообразных этнографических групп во всем мире. Перспективы дальнейшей разработки темы Дальнейшая разработка темы связана с расширением регионального Регистра потенциальных доноров стволовой клетки и включает научно-исследовательскую работу по генотипированию реципиентов и поиску новых уникальных генетических данных в популяциях Челябинской области. Выводы 1. В популяции нагайбаков Челябинской области установлены генные частоты аллельных семейств HLA-DRB1, -DQA1, -DQB1, частоты двух и трехлокусных гаплотипов HLA II класса. Установленные в популяции нагайбаков Челябинской области высокие частоты аллельных семейств - DRB1*01, DRB1*07, DRB1*03, DRB1*04, DRB1*11, DQA1*01:01 DQA1*02, DQA1*03, DQA1*05, DQB1*03:01, DQB1*05:01 (gf=0,085-0,300) и гаплотипов HLA-DRB1*01-DQA1*01:01-DQB1*05:01, HLA-DRB1*07-DQA1*02-DQB1*02:02, HLA- DRB1*03-DQA1*05-DQB1*02:01, DRB1*11-DQA1*05-DQB1*03:01 (HF=0,070-0,171), характерные для европейских популяций и низкие частоты аллельных семейств DRB1*09, DRB1*12, DRB1*14 (gf<0,05) и гаплотипов DRB1*09-DQA1*03-DQB1*03:03 DRB1*12- DQA1*05-DQB1*03:01, DRB1*14-DQA1*01:01-DQB1*05:02-04, DRB1*14-DQA1*01:01- DQB1*05:03 (HF<0,049), типичные для азиатских популяций, позволяют отнести нагайбаков к европейским популяциям. Популяция нагайбаков имеет специфические особенности в распределении аллельных семейств DRB1*15, DQA*01:02, DQB*06:02, гаплотипа DRB1*15-DQA*01:02-DQB*06:02 (HF=0,045) и не встречающегося в других мировых популяциях гаплотипа DRB1*07- DQA1*03-DQB1*03:01. 2. Сравнительный анализ частот генов и двухлокусных гаплотипов HLA-DRB1, - DQA1, -DQB1 показал, что нагайбаки имеют отличия от популяций, проживающих в Челябинской области (русских, татар и башкир). Популяция нагайбаков имеет меньше достоверных отличий по генам и гаплотипам HLA-II класса с популяцией татар Челябинской области. Наибольшие статистически значимые различия отмечаются между популяцией нагайбаков и башкир Челябинской области. 3. Рассчитанная по частотам генов HLA-DRB1 генетическая дистанция между популяцией нагайбаков и европейскими популяциями русских, марийцев, поляков, удмуртов, чуваш, татар, башкир и немцев (Da=0,060 – 0,128) меньше, чем с азиатскими популяциями монгол, ненцев, бурят, корейцев, тувинцев, кетов, эвенков (Da=0,205 – 0,640). 4. С помощью анализа соответствий и дендрологического анализа показано, что популяция нагайбаков входит в блок популяций европейского происхождения и демонстрирует родственные отношения с популяциями татар, чуваш, удмуртов, марийцев и русских Челябинской области.