Лазерно-индуцированный перенос гелевых микрокапель с микроорганизмами

Бесплатно
Работа доступна по лицензии Creative Commons:«Attribution» 4.0
Жигарьков Вячеслав Сергеевич
Бесплатно
Работа доступна по лицензии Creative Commons:«Attribution» 4.0

ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ЛИТЕРАТУРНЫЙ ОБЗОР
1.1. Методы переноса и печати биоматериалов
1.2. Методы лазерно-индуцированного переноса вещества
1.2.1. Лазерное осаждение пленок биоматериалов
1.2.2. Позиционирование микрообъектов оптическим пинцетом
1.2.3. Лазерно-индуцированный прямой перенос микрообъектов
1.3. Перенос микроорганизмов методом LIFT
1.3.1. Биологическая лазерная печать (BioLP)
1.3.2. Лазерная инженерия микробных систем (ЛИМС)
1.3.3. Лазерно-индуцированный перенос эукариотических микроорганизмов
1.4. Заключение к Главе 1
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1. Основные компоненты экспериментальной лазерной системы
2.2. Подготовка образцов и используемые материалы
2.3. Методы анализа образцов
2.4. Компоненты анаэробного бокса
2.5. Оценка импульсного давления при моделировании процесса лазерного переноса
2.5.1. Параметры экспериментальной установки
2.5.2. Калибровка широкополосного акустического гидрофона
2.6. Динамика изменения морфологии и разрушение металлических пленок донорной подложки при импульсном лазерном воздействии
2.6.1. Параметры экспериментальной установки
ГЛАВА 3. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ДАВЛЕНИЯ В ОБЛАСТИ ИМПУЛЬСНОГО ЛАЗЕРНОГО ВОЗДЕЙСТВИЯ
3
3.1. Введение
3.2. Регистрация акустического сигнала и расчет давления
3.3. Экспериментальная зависимость давления от энергии лазерного импульса
3.4. Уточнение экспериментальных результатов
3.5. Заключение к Главе 3
ГЛАВА 4. РАЗРУШЕНИЕ ПОГЛОЩАЮЩЕЙ МЕТАЛЛИЧЕСКОЙ ПЛЕНКИ ПРИ ИМПУЛЬСНОМ ЛАЗЕРНОМ ВОЗДЕЙСТВИИ
4.1
4.2
4.3
лазерным импульсом с пороговым значением плотности энергии
4.4. Оптические свойства пленок
4.5. Динамика изменения отражательной способности пленки Au
4.6. Динамика изменения отражательной способности пленки Ti
4.7. Заключение к Главе 4
ГЛАВА 5. ОПТИМИЗАЦИЯ ПАРАМЕТРОВ ЛАЗЕРНОЙ СИСТЕМЫ ДЛЯ ПЕРЕНОСА МИКРООРГАНИЗМОВ
5.1. Введение
5.2. Режимы переноса
5.3. Возникающие температурные скачки и частицы металлов в геле
5.4. Возможное влияние излучения на живые объекты
5.5. Лазерно-индуцированный перенос микроорганизмов
5.5.1. Перенос почвенных микроагрегатов
5.5.2. Перенос экстремофильных прокариот
5.5.3. Перенос эукариотических микроорганизмов
5.5.4. Перенос гелевых микрокапель с микроорганизмами на электропроводные чипы
5.6. Заключение к Главе 5
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
Введение
Пороговые значения разрушения пленок Au и Ti
Адгезия металлических пленок и изменение их морфологии при воздействии

4
БЛАГОДАРНОСТИ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

Во Введении сформулирована актуальность темы диссертационной работы, показано её научно-практическое значение, а также обсуждены объекты и задачи исследования.
В Главе 1 представлен обзор различных методов, позволяющих осуществлять перенос биоматериалов, находящихся в жидких средах различной вязкости на акцепторные объекты. Проанализированы достоинства и недостатки представленных методов. Рассмотрены современные методы переноса и манипулирования различными микрообъектами (клетки, биомолекулы) с использованием устройств квантовой электроники. Отдельно рассмотрены существующие методы лазерно-индуцированного прямого переноса (LIFT) микроорганизмов в гелевых микрокаплях. Обоснованы и сформулированы основные цели и задачи настоящей работы, заключающиеся в использовании метода LIFT для исследования микробного разнообразия различных экосистем путем выделения отдельных клеток микроорганизмов из комплексных субстратов с их последующим культивированием. Сделан вывод о необходимости оптимизации процессов лазерного переноса клеток в различных газовых условиях, а также об исследовании физических факторов, влияющих на выживаемость и функциональность переносимых клеток и клеточных агломератов.
Глава 2 посвящена описанию материалов и методов исследования. В разделе 2.1 описываются основные компоненты экспериментальной лазерной системы для переноса гелевых микрокапель, включающие импульсный лазер на волокне, легированном ионами Yb+3, с длиной волны λ=1064 нм, длительностью импульсов =4-200 нс и энергией =0.02-1 мДж, системы позиционирования и скоростной съемки. Общая схема установки представлена на рисунке 1.
В разделе 2.2 описан процесс подготовки донорных подложек (предметные стекла с металлическими пленками) и геля на основе водного раствора гиалуроновой кислоты (ГК), в который вносятся биологические клетки и почвенные частицы. В разделе 2.3 описываются методы анализа металлических пленок и геля. В разделе 2.4 перечислены основные компоненты анаэробного бокса для лазерного переноса гелевых микрокапель как в стерильных условиях, так и в специально подобранной газовой среде.
Рисунок. 1. Схема установки. 1 – импульсный лазер, 2 – гальваносканирующая головка с объективом,
3 – вертикальный моторизированный транслятор, 4 – донорная подложка с металлической пленкой и слоем геля, 5 – акцепторная подложка, 6 – система позиционирования акцептора, 7 – скоростная камера, 8 – подсветка камеры, 9 – компьютер. На вставке – изображение акцепторного стекла с высохшими микрокаплями геля, полученное с помощью сканирующего электронного микроскопа (СЭМ).
В процессе LIFT возникают скачки давления, которые возбуждаются в результате нагрева металлической пленки. С целью оценки этих давлений в разделе 2.5 описана методология эксперимента по измерению акустического поля в дальней зоне с помощью широкополосного гидрофона на основе ниобата лития LiNiO3 (рисунок 2). Описана методика калибровки используемого гидрофона.
Рисунок 2. Схема экспериментальной установки для регистрации акустического сигнала широкополосным гидрофоном.
В разделе 2.6 приведено описание компонентов экспериментальной системы для оценки степени разрушения металлических пленок путем изучения динамики отражательной способности поглощающей пленки с помощью зондирующего пучка He-Ne лазера (рисунок 3).
Рисунок 3. Изображение основных компонентов экспериментальной установки по исследованию динамики отражательной способности металлической пленки донорной подложки в результате импульсного воздействия.
Глава 3 посвящена определению давления в области импульсного лазерного воздействия в слое жидкости, прилегающем к металлическое пленке. В разделе 3.1 приведены общие сведения о проводимых экспериментах.
В разделе 3.2 определены давления в области импульсного лазерного воздействия.
Лазерное воздействие на поглощающий слой донорной подложки приводит к генерации
широкополосного акустического сигнала. Для оценки амплитуды давления вблизи пленки а
(рисунок 4) данные пересчитывались по формуле для гауссового пучка [10]:
9

√ 0 2
= 1+( 2) (1) а
где ~15 мкм – радиус лазерной перетяжки; – давление в дальней зоне; = – характерная 0 00
длина волны акустического излучения, c0 =1500 м/с – скорость звука в воде, z=28 мм – расстояние от металлической пленки до гидрофона.
В разделе 3.3 для серии акустических измерений получены зависимости амплитуды давления от энергии лазерных импульсов для металлических плёнок Ti толщиной 50 нм и Cr
толщиной 50 и 100 нм: [бар]=3.7·(E[мкДж]-1) для пленки Ti и [бар]=6.2·(E[мкДж]-6.5) для аа
Cr. Максимальная зарегистрированная амплитуда давления составила ~700 бар в случае использования поглощающих пленок из хрома. Для плоской волны в воде такие амплитуды соответствуют нелинейному режиму распространения.
Было обнаружено, что при E>15 мкДж эффективность преобразования лазерной энергии в механическую для пленки Cr выше по сравнению с пленкой Ti. При этом эффективность для покрытий из хрома не зависит от толщины пленки (рисунок 5).
а
Рисунок 4. Фрагмент акустического сигнала при воздействии лазерным импульсом τl=8 нс с E=47 мкДж на слой Ti донорной подложки. Показаны значения амплитуд давления непосредственно вблизи металлического слоя. Стрелкой отмечен основной импульс.
Рисунок 5. Зависимость амплитуды акустического давления вблизи металлической пленки от энергии лазерных импульсов (τl=8 нс, диаметр пучка ~30 мкм) для плёнок Ti и Cr. Показаны линейные тренды. Отмечено критическое давление для воды Pc= 218 бар.
В разделе 3.4 приводится уточнение полученных экспериментальных зависимостей скачков давления (рисунок 5). Для этой цели рассмотрены физические процессы, происходящие при наносекундном лазерном воздействии на тонкую металлическую пленку и приводящие к образованию ударных волн, на различных временных масштабах. Величины оцененных по скорости распространения ударной волны скачков давлений сравнивались с акустическими измерениями в дальней зоне [12].
На рисунке 6 приведены профили скачков давления в воде вблизи поглощающей пленки Ti для
энергий лазерных импульсов E=20 и 75 мкДж 8 нс. Для получения этих кривых зарегистрированные в
дальней зоне величины давления были пересчитаны по закону 1/r, где r – расстояние от поверхности
пленки. При таком пересчете вблизи поверхности металла скачки давления значительно превышают
критическое давление для воды Pc= 218 бар. На рисунке 6, б нанесена кривая для E=1 мДж. При этом
значении энергии распределение давления на расстояниях менее 200 мкм хорошо аппроксимируется
законом1/r1.05.Приr<200мкм(когда >600бар)измеренныезначенияамплитуддавлений вударной
волне лежат выше этого тренда, постепенно удаляясь от него с уменьшением r. Вблизи области лазерного воздействия при r=20 мкм согласно тренду 1/r1.05 ~6 кбар.
На рисунке 6, б к трендам 1/r для 20 и 75 мкДж добавлены кривые 2 и 3, полученные путем
смещения кривой 1, взятой из [12], по вертикали. Выполненные построения показывают, что для
лазерного импульса E=75 мкДж отличие в ударной волне от тренда 1/r проявляется на удалении от
поглощающего слоя Ti до 40 мкм. При этом в непосредственной близости к пленке металла согласно тренду 1/r составляет ~3 кбар, а с учетом более сильного затухания ударной волны достигает ~10
кбар. Для лазерного импульса с E=20 мкДж отличие в ударной волне от тренда 1/r проявляется на
удалении от поглощающего слоя Ti только до 15 мкм. При этом в непосредственной близости к пленке металласогласнотренду1/r составляет~800бар,асучетомболеесильногозатуханияударнойволны
достигает ~1.5 кбар.
Рисунок 6. Профили скачков давления в воде вблизи поглощающей пленки Ti толщиной ~50 нм для энергий лазерных импульсов E=20 и 75 мкДж с τl =8 нс в линейном (а) и логарифмическом (б) масштабах. Желтым прямоугольником условно показан слой геля на донорной подложке.
В условиях лазерно-индуцированного переноса гелевых микрокапель близлежащий к
поглощающей пленке слой толщиной ~200 мкм занят гелем (показан на рисунке 6). Выполненные
измерения показывают, что при использовании донорной подложки с пленкой Ti при воздействии
лазерных импульсов с τl =8 нс и Е=20 мкДж амплитуда вызванного скачка давления постепенно
уменьшается от 1.5 кбар (r=10 мкм) до 30 бар (r=200 мкм). При увеличении E до 75 мкДж в этом слое
будет постепенно уменьшаться от 10 кбар до 100 бар.
Рабочий диапазон используемых энергий лазерных импульсов длительностью 8 нс для геля
толщиной 200 мкм составляет 15-30 мкДж. Оценки, полученные при пересчете измеренных в дальней зоне амплитуд давления к r=0 по формуле для гауссового пучка являются заниженными, поскольку не

учитывают затухание акустических и ударных волн. Учет полученных в [12] результатов позволяет получить более правильную картину распределения давлений.
Заштрихованная область на рисунке 6, б показывает область скачков давлений в слое геля в рабочем диапазоне лазерных энергий E=15-30 мкДж. Амплитуда скачка давления постепенно
уменьшается от 0.5 кбар (r=10 мкм) до 20 бар (r=200 мкм). При этом давление, необходимое для
существования ударной волны (600 бар), в толще геля не достигается. На верхней границе этого
диапазона(приE=30мкДж) вслоегелябудетпостепенноуменьшатьсяот5кбардо100бар.Вэтом
случае ударная волна будет существовать и перейдет в обыкновенную акустическую на удалении r~25 мкм.
В разделе 3.5 представлено заключение к Главе 3. Оценки амплитуд давления, возникающих при лазерном импульсном воздействии, приведены для пленок Ti и Cr толщиной 50-100 нм, находящихся на донорной стеклянной подложке в контакте с жидкостью. Установлено, что при E>15 мкДж эффективность оптоакустического преобразования для Cr выше, чем для Ti, что, вероятно, связано с различной адгезией металлических пленок к поверхности стеклянной подложки.
В диапазоне энергий лазерных импульсов 15-30 мкДж скачки давления в слое жидкости толщиной 200 мкм (10 – 200 мкм от поверхности пленки) составляют от 20 бар до 5 кбар при использовании пленки Ti и от 20 бар до 10 кбар – пленки Cr.
Глава 4 посвящена исследованию разрушения металлических пленок донорных стеклянных подложек. В разделе 4.1 приведены общие сведения и параметры проводимых экспериментов.
В разделе 4.2 экспериментально определены пороги разрушения металлических пленок Au
и Ti толщиной ~50 нм на стеклянных подложках. Для этих целей были оценены диаметры
образованных в результате лазерного воздействия отверстий. В предположении, что
распределение интенсивности лазерного излучения в сечении пучка описывается функцией
Гаусса, измеренные диаметры отверстий 2 в металлических плёнках связаны с пороговым
значением плотности энергии h
соотношением:
2 = 2 2 ln ( ),
(2) где – плотность энергии лазерного импульса, – радиус отверстия в плёнке, – радиус
0
h
лазерной перетяжки.
На рисунке 7 приводятся зависимости квадрата диаметра отверстий в плёнках Au и Ti от
величины логарифма плотности энергии. По полученным зависимостям оценены пороговые значения плотности энергии в случае сухих (без геля) плёнок, составившие Fth ~180 мДж/см2
для золота и Fth ~60 мДж/см2 для титана.
h
0

Рисунок 7. Зависимость квадрата диаметра полученных отверстий в плёнках Au и Ti без слоя геля от натурального логарифма плотности энергии. Показаны линейные тренды. На вставках приведены оптические микрофотографии отверстий в проходящем свете.
Раздел 4.3 посвящен оценке величины
стеклянной подложки. Экспериментальные оценки величины адгезии плёнок показали, что для Au давление отрыва составляет ~500 кПа, а для Ti оно превышает 1 МПа. На примере пленки Ti показано, что наличие гелевого слоя на металлической пленке приводит к увеличению порога разрушения пленки (рисунок 8).
Рисунок 8.
СЭМ – изображения поверхности плёнки Ti при разных значениях плотности энергии: а – без геля, б – со слоем геля на поверхности пленки.
Кроме того, показан различный характер разрушения пленок из Au и Ti при плотностях энергии, близких к пороговым. Так, в титановой пленке образуются трещины нерегулярной структуры. В случае же золотой плёнки (рисунок 9) в центре лазерного пятна наблюдается деформация в области ~15 мкм и небольшое разрушение с образованием разрыва ~1 мкм, что, вероятно, вызвано достижением в центре температуры плавления, а также её ударного отслоения от подложки. Дальнейшее увеличение плотности энергии до 210 мДж/см2 приводит к образованию отверстия в плёнке, связанного с образованием нескольких радиальных разрывов (из-за крайне слабой адгезии плёнки Au к стеклянной подложке) и отслоением лепестков.
адгезии металлических пленок к поверхности
Рисунок 9. Изображения поверхностей золотой плёнки в области импульсного лазерного воздействия при плотности энергии, близкой к пороговой:
a – СЭМ-изображение металлической плёнки,
б – топографическая картина поверхности.
В разделе 4.4 произведена оценка оптических свойств используемых пленок с учетом геометрии эксперимента для отраженного от поверхности подложек пучка He-Ne лазера с λ~630 нм. Коэффициенты отражения интактных пленок составили ~90% для Au и ~50% Ti.
В разделах 4.5-4.6 приводятся экспериментальные результаты по изменению динамики отраженного от пленок Au и Ti на стеклянных подложках пучка He-Ne лазера, сфокусированного в область импульсного лазерного воздействия.
В разделе 4.5 приведены результаты для пленки Au, представленные на рисунке 10. Показано, что при 180 мДж/см2 в случае сухой плёнки золота и при 350 мДж/см2 при наличии геля уровень сигнала зондирующего пучка He-Ne-лазера после импульсного лазерного воздействия снижается примерно на 6%, а затем вновь выходит на начальный уровень. Согласно полученной в работе температурной зависимости R, температура золотой плёнки достигает в этих случаях плавления. При этом времена, за которые отражательная способность R(t) возвращается к первоначальному значению, различаются незначительно: без геля это время составляет t~40 нс, а в присутствии гелевого слоя – t~60 нс.
Рисунок 10. Динамика отражательной способности поверхности золотой плёнки на стеклянной подложке, вызванная воздействием лазерного импульса длительностью τ =8 нс при различных значениях плотности энергии: а – сухая металлическая плёнка, б – плёнка с гелевым слоем. Горизонтальные точечные линии соответствуют первоначальному уровню отраженного сигнала и снижению этого уровня на 6%. Вертикальная точечная линия соответствует времени достижения максимума лазерного импульса.
В разделе 4.6 представлены результаты по изменению динамики отраженного сигнала пучка He-Ne лазера для пленки Ti (рисунок 11). Показано, что в этом случае, начиная с пороговой плотности энергии, происходит необратимое уменьшение отражательной способности пленки R(t). Увеличение плотности энергии приводит к снижению отражённого сигнала, которое вызвано как, вероятно, увеличением рассеяния на поверхности титана в связи с образованием трещин, так и образованием отверстия в пленке. Установлено, что разрушение сухой плёнки Ti по сравнению с плёнкой с нанесенным гелевым слоем происходит при меньшей плотности энергии. С помощью рентгенофазового анализа продемонстрировано, что в процессе лазерного воздействия на пленку Ti с плотностью энергии, близкой к пороговой, происходит термическое окисление пленки с образованием оксидных пиков титана.
Рисунок 11. Динамика отражательной способности поверхности плёнки Ti на стеклянной подложке, вызванная воздействием лазерного импульса τ =8 нс при различных значениях плотности энергии: а – сухая плёнка, б – плёнка с гелевым слоем. Горизонтальная точечная линия соответствует начальному уровню отраженного сигнала. Вертикальная точечная линия соответствует времени достижения максимума лазерного импульса.
В разделе 4.7 сформулированы основные выводы. Показано, что наличие на металлических пленках слоя геля приводит к увеличению порога их разрушения. Установлено, что для плёнки Au лазерный нагрев вплоть до температуры плавления не приводит к разрушению ее структуры. В случае плёнки Ti воздействие с пороговой плотностью энергии носит необратимый характер и ведет к деградации материала плёнки с образованием оксидных форм. Полученные результаты могут быть использованы в части выбора материала поглощающих пленок и подбора рабочих режимов лазерного воздействия.
В Главе 5 представлены результаты по отработке оптимальных режимов лазерного- индуцированного переноса гелевых микрокапель, по влиянию некоторых физических факторов, возникающих в процессе переноса, а также по оценке эффективности данной лазерной системы при решении ряда микробиологических задач. В разделе 5.1 представлены основные преимущества и недостатки ЛИМС.
В разделе 5.2 описаны возможные режимы переноса гелевых микрокапель. Показана зависимость объема микрокапель от плотности энергии лазерного импульса и концентрации гиалуроновой кислоты (ГК) (рисунок 12).
Рисунок 12. Зависимость объема микрокапли V от плотности энергии лазерных импульсов F и оптическое изображение микрокапель на поверхности стеклянной акцепторной подложки для двух концентраций геля: а – 1% ГК, б – 2% ГК. Для лучшей визуализации в гель был добавлен краситель (метиленовый синий).
Так как в процессе переноса находящиеся в геле живые клетки могут испытывать высокие динамические нагрузки (что сказывается на их функциональности и выживаемости), то методом скоростной съемки произведена оценка возникающих в процессе лазерного переноса ускорений (рисунок 13). Показано, что в рабочем диапазоне плотностей лазерной энергии 1.8-3.7 Дж/см2 при толщине гелевого слоя ~200 мкм достижимы оптимальные режимы переноса с ускорением, не превышающим 104 м/с2.
Рисунок 13. Снятый на высокоскоростную камеру
процесс
микрокапли
акцепторной
режиме стабильного переноса (F~3 Дж/см2). Промежуток между кадрами составляет ~50 мкс.
Немаловажным фактором при переносе живых клеток являются возникающие температурные скачки, а также возможное токсическое воздействие наночастиц, образованных в результате лазерного воздействия на материал поглощающей пленки. В разделе 5.3 проведена численная оценка температурного скачка в области лазерного воздействия, показавшая, что к концу лазерного импульса =8 нс температурный скачок в геле толщиной ~34 нм может
образования 2% ГК на подложке в

составить 1000-2000 К, однако, в основной части геля температура соответствует первоначальной.
Методами атомно-силовой микроскопии (АСМ) и СЭМ установлены размеры металлических частиц, образованных в процессе воздействия на металлические пленки донорных подложек, которые составляют от сотен нанометров (рисунок 14) в случае пленки Ti до единиц микрон в случае Au.
Рисунок 14. АСМ-изображения поверхности пленки Ti на стеклянной донорной подложке после лазерного воздействия F=3 Дж/см2: а –вид отверстия в пленке; б, в – увеличенные изображения в области воздействия. По линии L построен профиль сечения, показавший, что размеры частиц по ширине и длине не превышают 300 нм, а их высота составляет~50 нм.
В разделе 5.4 экспериментально оценен коэффициент пропускания металлической пленки в зависимости от плотности энергии лазерного импульса, максимальное значение которого в случае пленки Au составило ~30 %. Большая плотность проходящей через пленку энергии в принципе может привести к термическому повреждению живых микроструктур. Однако, проведенные биологические исследования показали, что однократное воздействие лазерного импульса с =8 нс, как правило, осуществляемого в узком диапазоне плотности энергии 1.8-3.7 Дж/см2 не оказывает ощутимого негативного влияния на жизнеспособность клеток.
Раздел 5.5 посвящен непосредственно лазерному переносу гелевых микрокапель, содержащих живые микроорганизмы (ЛИМС), на подобранных режимах используемой лазерной системы.
На примере лазерного переноса почвенных микроагрегатов и сопоставления полученных результатов со стандартным микробиологическим посевом, показано существенное увеличение разнообразия культивируемых микроорганизмов. Наиболее значительный результат в этой части: выделение нового вида бактерий, отнесенного к редкому роду Nonomuraea.
Показана применимость ЛИМС для выделения монокультур экстремофильных микроорганизмов, полученных из горячих природных источников. Наиболее значительный результат: успешное разделение устойчивой аэробной бинарной культуры микроорганизмов из
некультивируемой ранее филогенетической группы. Новому микроорганизму было присвоено наименование Tepidiforma bonchosmolovskayae.
При пересеве эукариотических микроорганизмов (дрожжевые штаммы) обнаружено влияния лазерного переноса на количество получаемых колоний в сравнении со стандартными микробиологическими методами посева. В случае пересева на плотные питательные среды продемонстрировано увеличение числа колоний в несколько раз в пользу лазерного метода.
В настоящее время актуальным направлением исследований является перенос гелевых микрокапель с микроорганизмами на электропроводные чипы. Это необходимо для массового скрининга культур микроорганизмов на способность к прямому внеклеточному переносу электронов, а также имеет практическое значение, направленное на отбор культур, пригодных, в частности, для дальнейшего использования в микробных топливных элементах с целью генерации электричества. В пилотном эксперименте удалось осуществить анаэробный перенос гелевых микрокапель, содержащих культуру клеток Carboxydothermus ferrireducens, и вырастить биопленку на поверхности чипа (рисунок 15).
Рисунок 15. а – чип с напечатанной матрицей гелевых микрокапель, содержащих культуру микроорганизма Carboxydothermus ferrireducens, в анаэробном боксе; б – чипы, помещенные в стеклянные флаконы с питательной средой и подключенные к потенциостату; в – эпифлуоресцентная микроскопия с окраской (краситель акридиновый оранжевый) биопленки микробной культуры, выращенной на микроэлектродах чипа (овалом отмечена область с биопленкой).
В разделе 5.6 представлено заключение, содержащее основные выводы к Главе 5.
Заключение и выводы
Диссертационная работа направлена на расширение областей применения устройств и приборов квантовой электроники на основе развития новых подходов к лазерно- индуцированному переносу (LIFT) гелевых микрокапель, содержащих живые микроорганизмы. Разработан новый подход, заключающийся в поддержании внешних газовых условий с помощью специального анаэробного бокса.
Проведены исследования влияния некоторых физических факторов, возникающих в процессе лазерного воздействия, на переносимые микроорганизмы. Одним из таких факторов
являются возникающие в слое геля скачки давления. Экспериментальная оценка показала, что в жидкости на расстоянии 10-200 мкм от поверхности металлических пленок для рабочего диапазона энергий 15-30 мкДж (1.8-3.7 Дж/см2) скачки давления составляют от 20 бар до 5 кбар для пленки Ti и от 20 бар до 10 кбар – пленки Cr.
С использованием зондирующего пучка He-Ne лазера с наносекундным разрешением выявлена динамика разрушения пленок Au и Ti как без слоя геля на них, так и со слоем геля при плотностях энергии, близких к пороговому значению разрушения пленок. Показано, что наличие слоя геля на поглощающей металлической пленке донорной подложки приводит к увеличению порога разрушения пленки. По характеру отражения пучка He-Ne лазера установлено, что при достижении в области воздействия температуры плавления пленки, коэффициент отражения уменьшается на ~6%. Такое воздействие может носить обратимый характер, однако, из-за слабой адгезии золотой пленки также может происходить ее отслоение с последующим выбросом частей пленки микронных размеров. При импульсном воздействии с плотностью энергии ~60 мДж/см2 на пленку Ti происходят необратимые изменения в структуре пленки, связанные с образованием трещин и отверстий диаметром до 1-2 мкм, что приводит к уменьшению отраженного сигнала. Разрушение пленки Ti сопровождается, как правило, термическим окислением и образованием наночастиц размером до 300 нм.
В целях обеспечения возможности переноса как отдельных клеток, так и клеточных агломератов и частиц почв размером до 100-200 мкм была выбрана толщина гелевого слоя ~200 мкм. Экспериментально для геля на основе 2% раствора ГК были определены оптимальные параметры лазерного воздействия: τl =8 нс и диапазон плотности энергии от 1.8 до 3.7 Дж/см2. При данных режимах отрыв струи от гелевого слоя на донорной подложке достигается практически в 100% случаев. Также в диапазоне от 1.8 до 3.0 Дж/см2 возможен однокапельный перенос, что обеспечивает более низкие значения ускорений струй до ~104 м/с2.
Произведенные теоретические и экспериментальные оценки температурного скачка показали, что его величина к концу лазерного импульса находится в диапазоне 1000-2000 К. Однако за это время до таких температур успевает прогреться слой геля толщиной ~ 34 нм. При этом, в основной толще геля температура не превышает первоначальную.
В ряде биологических экспериментов с использованием технологии ЛИМС продемонстрировано выделение из природных сред большего микробного разнообразия по сравнению со стандартными методами. Кроме того, осуществлено выделение редких микроорганизмов без подбора селективных сред, а также выделен симбионт из устойчивой бинарной культуры микроорганизмов. Предварительные результаты, связанные с переносом гелевых микрокапель с микроорганизмами на поверхность электропроводных чипов, продемонстрировали возможность формирования устойчивых микробных биопленок, что в дальнейшем может найти широкое практическое применение.

Идеи и фундаментальные разработки Н. Басова, А. Прохорова и Ч. Таунса в области квантовой электроники, отмеченные Нобелевской премией по физике в 1964 году, привели к массовому созданию генераторов и усилителей света. С момента первой демонстрации Т. Мейманом работы рубинового лазера в 1960 году и до сегодняшних дней достигнуты колоссальные успехи в науке и технике, медицине, повседневной жизни благодаря широкому внедрению и совершенствованию лазерных технологий. Применение импульсного лазерного излучения для прямого переноса вещества впервые было осуществлено в середине 80-х годов прошлого века. Тогда группа авторов Bohandy et. al. [1] показала в своей статье возможность осаждения внутри вакуумной камеры с поверхности кремневой подложки фрагментов тонкой медной пленки толщиной 0,41 мкм на акцепторную мишень, находящуюся практически в контакте с металлической пленкой (расстояние менее 10 мкм), с помощью импульсного эксимерного лазера (λ=193 нм, τ =15 нс). Этот метод впоследствии был назван лазерно- индуцированным прямым переносом вещества LIFT (laser-induced forward transfer). Тогда же был исследован механизм LIFT: в результате импульсного лазерного нагрева передней поверхности металлической пленки на подложке образуется фронт расплава, который распространяется через пленку до тех пор, пока не достигнет свободной поверхности, возникающее давление паров металла на передней перегретой поверхности пленки выбрасывает материал пленки на акцепторную подложку [2].
Впоследствии возможности LIFT [3] (также встречается название «прямая лазерная запись» LDW (laser direct-write) [4]) стали использоваться для целого ряда высокотехнологических приложений, например, для переноса различных электрохимических материалов, таких как многокомпонентные наноструктурированные оксиды с высокой пористостью с сохранением их электрохимических и физических характеристик [4]. С помощью метода LIFT было осуществлено нанесение экранов из порошкового люминофора для дисплеев высокого разрешения [5]. Кроме того, был осуществлен перенос крайне хрупких и чувствительных материалов органических тонкопленочных резисторов [6,7], органических светодиодов [8,9].
Также возможности LIFT используются для переноса и осаждения различных биоматериалов: белков, молекул ДНК, бактериальных и стволовых клеток [4]. В настоящее время метод применяется для решения целого ряда медицинских задач, в частности, для тканевой инженерии [10–12].
Отдельное направление LIFT связано с микробиологическими задачами, чему способствует ряд положений. Так, бурное развитие генетических технологий последних десятилетий привело к появлению новых методов секвенирования биополимеров, расширивших возможности для исследования микроорганизмов [13]. По оценкам, более 99% микроорганизмов остаются некультивируемыми стандартными лабораторными методами [14]. Поэтому одним из важнейших направлений современной микробиологии является поиск новых подходов к выделению, культивированию и позиционированию микроорганизмов [15]. Связано это с тем, что возможное использование неизвестных ранее микроорганизмов может помочь в решении целого ряда глобальных задач: синтез новых природных антибиотических веществ [16], производство биологически активных веществ с использованием новых продуцентов, а также создание банка микроорганизмов как с целью сохранения биоразнообразия, так и для сохранения оригинальных штаммов микроорганизмов без изменений их первоначальных свойств [17].
Для перечисленных задач в настоящее время предложены два направления, основанные на LIFT. Так в биологической лазерной печати BioLP (Biological Laser Printing) [18,19] применяются УФ-лазеры с длиной волны λ=248 нм, излучение которых является довольно жестким по отношению к биологическим клеткам. Поэтому научной группой ИФТ РАН был предложен метод лазерной инженерии микробных систем ЛИМС (или в англ. варианте LEMS – Laser engineering of microbial systems), где перенос клеточного субстрата в геле осуществляется посредством лазера ближнего ИК-диапазона (λ=1064 нм) [20]. Механизм процесса переноса заключается в том, что лазерное излучение, сфокусированное на поглощающей металлической пленке, на которой распределен гель с клетками, приводит к нагреванию пленки и возникновению быстро расширяющегося парогазового пузыря, при расширении которого возникают струи жидкости [20,21]. Перенос малого количества геля с отдельными клетками позволяет получить чистые бактериальные культуры из сложных гетерогенных сред. За счет этого растет вероятность выделения отдельных ранее не культивируемых или трудно культивируемых микроорганизмов, чего не удается достигнуть, используя традиционные методы микробиологического посева [18,22–24]. Однако, несмотря на заявленные преимущества, существует целый ряд ограничений: в области лазерного воздействия возникают ударные акустические волны и высокие температуры, развиваются большие ускорения гелевых струй, из-за разрушения поглощающей пленки вместе с каплями переносятся металлические наночастицы, которые могут оказывать цитотоксическое воздействие.
Для дальнейшего развития и совершенствования данного направления LIFT необходимо разработать лазерную систему, позволяющую осуществлять перенос в гелевых микрокаплях как аэробных, так и анаэробных микроорганизмов. Кроме того, необходимо провести исследования, направленные на уточнение взаимодействия излучения как с материалом пленки и геля, так и с биологическими микрообъектами.
В настоящей работе описана разработанная лазерная система на основе иттербиевого импульсного волоконного лазера с длиной волны 1064 нм, которая позволяет производить контролируемый перенос гелевых микрокапель при заданных условиях газовой среды на плотные и жидкие питательные среды. Также был применен ряд методов как для оценки давления в области лазерного воздействия в воде, так и для оценки степени разрушения и эффективности абляции металлических пленок в воздухе и водном растворе гиалуроновой кислоты. Проведенные оценки важны для оптимизации технологии лазерного переноса живых микрообъектов. Цель и задачи
При микробиологическом выделении микроорганизмов подавляющая их часть остается некультивируемой. Это связано с множеством факторов, к которым в том числе относятся: разрушение микробной среды обитания при выделении отдельных микроорганизмов и разовое выделение нескольких антагонистических групп, внутри которых начинает делиться самый устойчивый вид. Некультивируемые микроорганизмы могут находиться в пассивном состоянии в виде спор и покоящихся клеток, а также могут быть представлены в виде симбиотических микробных сообществ. В связи с этим предлагаются новые методы и подходы, которые позволили бы культивировать большее разнообразие микроорганизмов.
Целью работы является разработка лазерной системы, позволяющей осуществлять контролируемый перенос живых микробных объектов в гелевых микрокаплях на различные акцепторные среды в задаваемых газовых условиях. Это должно способствовать выделению трудно культивируемых микроорганизмов и увеличению культивируемого разнообразия микроорганизмов.
Для достижения поставленных целей были сформулированы следующие задачи.
1. Разработать лазерную систему, позволяющую осуществлять
контролируемый перенос гелевых микрокапель с микроорганизмами.
2. Установить пороги разрушения нанесенных на стеклянные подложки
металлических пленок.
3. Определить диапазон параметров лазерного воздействия, обеспечивающий
стабильный перенос одиночных микрокапель.
4. Произвести оценку скачков давления, возникающих в примыкающем к
металлической пленке слое жидкости в результате импульсного лазерного
воздействия.
5. Осуществить лазерный перенос гелевых микрокапель с микробными
объектами на различные акцепторные среды при заданных контролируемых
условиях и произвести сравнение полученных результатов со стандартными микробиологическими методами.
Научная новизна
1. Создана лазерная система для печати гелевыми микрокаплями на основе импульсного волоконного лазера, позволяющая осуществлять перенос гелевых капель в контролируемых газовых условиях. Найдены оптимальные параметры для переноса клеточных объектов в гелевых микрокаплях на различные приемные среды.
2. Осуществленакомплекснаяоценкарядафизическихфакторов,возникающих в процессе лазерного переноса живых микрообъектов в гелевых микрокаплях: импульсное давление, скачок температуры, ускорения гелевых
струй, образующиеся наночастицы из материала поглощающих металлических пленок.
3. Из сложного природного консорциума микроорганизмов удалось выделить штамм редкого рода Nonomuraea без использования специальных селективных сред. Впервые удалось осуществить лазерный перенос и разделение устойчивой бинарной микробной культуры из термального источника. Выделенный новый штамм был отнесен к новому классу с присвоением ему названия Tepidiforma bonchosmolovskayae.
Практическая значимость
Разработанные системы лазерного переноса гелевых микрокапель с анаэробным боксом показали свою эффективность для выделения при заданных условиях ранее некультивируемых или трудно культивируемых микроорганизмов из природных сред или клеточных консорциумов. Эти системы успешно используются для задач, поставленных в Институте микробиологии им. С.Н.
Виноградского РАН (г. Москва) и на факультете почвоведения МГУ им. М.В. Ломоносова.
Достоверность работы
Достоверность представленных результатов подтверждается проверочными физическими экспериментами, согласованием полученных результатов с результатами других исследований, систематическим характером проведенных исследований, использованием современной аппаратуры и методов исследования. Результаты работы опубликованы в международных журналах, индексируемых в базах Web of Science и Scopus, а также в журналах из списка ВАК. Результаты работы были доложены и обсуждены на семинарах и на международных конференциях.
Защищаемые положения
1. Разработана система на основе иттербиевого волоконного лазера с длиной волны 1064 нм и длительностью импульса 8 нс, которая позволяет осуществлять перенос при контролируемых условиях одиночных гелевых микрокапель, содержащих живые микроорганизмы.
2. Порог разрушения нанесенных на стеклянную подложку пленок Au и Ti толщиной 50 нм, покрытых слоем геля, для лазерных импульсов составляет 350 и 130 мДж/см2, соответственно.
3. Стабильный перенос одиночных микрокапель при толщине слоя геля на основе 2% водного раствора гиалуроновой кислоты ~200 мкм происходит в диапазоне плотностей энергии 1.8-3.7 Дж/см2.
4. При лазерном воздействии на нанесенные на стеклянные подложки пленки Ti и Cr в примыкающем к ним водном слое, удаленном от поверхности пленки на 10-200 мкм, возникают скачки давления от 20 до 5000 и 10000 бар, соответственно.
5. Лазерный перенос гелевых микрокапель позволяет значительно увеличить разнообразие культивируемых микроорганизмов в сравнении со стандартными методами микробиологического посева, а также позволяет выделять монокультуры ранее не описанных или трудно культивируемых микроорганизмов из природных консорциумов без использования специально подобранных селективных сред.
Личный вклад автора
Изложенные в работе результаты исследований выполнены лично автором или при его непосредственном участии. Личный вклад автора состоит в создании и отладке лазерных установок, подборе оптимальных параметров для лазерного переноса гелевых микрокапель в контролируемых условиях, моделировании описываемых процессов, обработке и интерпретации полученных результатов. Также автором проведена основная часть биологических экспериментов, связанных с переносом биологических микрообъектов.
Структура и объём диссертации
Диссертация состоит из введения, пяти глав и заключения. Работа содержит 146 страниц печатного текста, 49 рисунков и 2 таблицы. В библиографическом списке содержится 145 ссылок на источники.
Апробация работы и публикации
Основные результаты работы опубликованы в 11 научных статьях в рецензируемых научных журналах, входящих в перечень ВАК, 8 из которых индексируемы в базах WoS и Scopus. Результаты работы также представлены в 14 материалах научных конференций.
Изложенные в работе результаты докладывались автором на следующих конференциях: международная научно-техническая конференция «Фундаментальные проблемы радиоэлектронного приборостроения» (INTERMATIC – 2018), г. Москва; «Международная конференция по фотонике и информационной оптике» (2019-2021), г. Москва; X Научно-практическая конференция с международным участием «Сверхкритические флюиды: фундаментальные основы, технологии, инновации» (2019), г. Ростов-на-Дону; Пятый междисциплинарный научный форум с международным участием «Новые материалы и перспективные технологии» (2019), г. Москва; VII Троицкая конференция с международным участием “Медицинская физика” (2020), г. Троицк, г .Москва; VII Международная конференция «Лазерные, плазменные исследования и технологии – ЛаПлаз 2021», г. Москва.
Также результаты диссертационной работы были доложены на научных семинарах в Институте фотонных технологий РАН ФНИЦ «Кристаллография и фотоника» РАН.
Автор являлся руководителем гранта РФФИ No 18-32-00607-мол-а «Лазероиндуцированный перенос гелевых микрокапель для клеточной печати». Проводимые исследования были поддержаны грантами РФФИ No 18-29-06056 «Лазерное структурирование материалов с использованием сверхкритических флюидов» и РНФ No 20-14-00286 «Лазерная инженерия микробных систем и расширение сфер ее применения», а также поддержаны стипендией Правительства РФ 2019/2020 (Приказ Министерства образования и науки РФ от 31 августа 2019 г. No 661).

Заказать новую

Лучшие эксперты сервиса ждут твоего задания

от 5 000 ₽

Не подошла эта работа?
Закажи новую работу, сделанную по твоим требованиям

    Нажимая на кнопку, я соглашаюсь на обработку персональных данных и с правилами пользования Платформой

    Читать

    Читать «Лазерно-индуцированный перенос гелевых микрокапель с микроорганизмами»

    Публикации автора в научных журналах

    Оценка скачков давлений при лазерной печати гелевыми микрокаплями
    Сборник тезисов конференции «ХI Научно-практическая конференция с международным участием «Сверхкритические флюиды: фундаментальные основы, технологии, инновации» - 2- С. 432

    Помогаем с подготовкой сопроводительных документов

    Совместно разработаем индивидуальный план и выберем тему работы Подробнее
    Помощь в подготовке к кандидатскому экзамену и допуске к нему Подробнее
    Поможем в написании научных статей для публикации в журналах ВАК Подробнее
    Структурируем работу и напишем автореферат Подробнее

    Хочешь уникальную работу?

    Больше 3 000 экспертов уже готовы начать работу над твоим проектом!

    Шиленок В. КГМУ 2017, Лечебный , выпускник
    5 (20 отзывов)
    Здравствуйте) Имею сертификат специалиста (врач-лечебник). На данный момент являюсь ординатором(терапия, кардио), одновременно работаю диагностом. Занимаюсь диссертац... Читать все
    Здравствуйте) Имею сертификат специалиста (врач-лечебник). На данный момент являюсь ординатором(терапия, кардио), одновременно работаю диагностом. Занимаюсь диссертационной работ. Помогу в медицинских науках и прикладных (хим,био,эколог)
    #Кандидатские #Магистерские
    13 Выполненных работ
    Дмитрий М. БГАТУ 2001, электрификации, выпускник
    4.8 (17 отзывов)
    Помогаю с выполнением курсовых проектов и контрольных работ по электроснабжению, электроосвещению, электрическим машинам, электротехнике. Занимался наукой, писал стать... Читать все
    Помогаю с выполнением курсовых проектов и контрольных работ по электроснабжению, электроосвещению, электрическим машинам, электротехнике. Занимался наукой, писал статьи, патенты, кандидатскую диссертацию, преподавал. Занимаюсь этим с 2003.
    #Кандидатские #Магистерские
    19 Выполненных работ
    Елена Л. РЭУ им. Г. В. Плеханова 2009, Управления и коммерции, пре...
    4.8 (211 отзывов)
    Работа пишется на основе учебников и научных статей, диссертаций, данных официальной статистики. Все источники актуальные за последние 3-5 лет.Активно и уместно исполь... Читать все
    Работа пишется на основе учебников и научных статей, диссертаций, данных официальной статистики. Все источники актуальные за последние 3-5 лет.Активно и уместно использую в работе графический материал (графики рисунки, диаграммы) и таблицы.
    #Кандидатские #Магистерские
    362 Выполненных работы
    Мария А. кандидат наук
    4.7 (18 отзывов)
    Мне нравится изучать все новое, постоянно развиваюсь. Могу написать и диссертацию и кандидатскую. Есть опыт в различных сфера деятельности (туризм, экономика, бухучет... Читать все
    Мне нравится изучать все новое, постоянно развиваюсь. Могу написать и диссертацию и кандидатскую. Есть опыт в различных сфера деятельности (туризм, экономика, бухучет, реклама, журналистика, педагогика, право)
    #Кандидатские #Магистерские
    39 Выполненных работ
    Мария М. УГНТУ 2017, ТФ, преподаватель
    5 (14 отзывов)
    Имею 3 высших образования в сфере Экологии и техносферной безопасности (бакалавриат, магистратура, аспирантура), работаю на кафедре экологии одного из опорных ВУЗов РФ... Читать все
    Имею 3 высших образования в сфере Экологии и техносферной безопасности (бакалавриат, магистратура, аспирантура), работаю на кафедре экологии одного из опорных ВУЗов РФ. Большой опыт в написании курсовых, дипломов, диссертаций.
    #Кандидатские #Магистерские
    27 Выполненных работ
    Дарья П. кандидат наук, доцент
    4.9 (20 отзывов)
    Профессиональный журналист, филолог со стажем более 10 лет. Имею профильную диссертацию по специализации "Радиовещание". Подробно и серьезно разрабатываю темы научных... Читать все
    Профессиональный журналист, филолог со стажем более 10 лет. Имею профильную диссертацию по специализации "Радиовещание". Подробно и серьезно разрабатываю темы научных исследований, связанных с журналистикой, филологией и литературой
    #Кандидатские #Магистерские
    33 Выполненных работы
    Кормчий В.
    4.3 (248 отзывов)
    Специализация: диссертации; дипломные и курсовые работы; научные статьи.
    Специализация: диссертации; дипломные и курсовые работы; научные статьи.
    #Кандидатские #Магистерские
    335 Выполненных работ
    Дмитрий Л. КНЭУ 2015, Экономики и управления, выпускник
    4.8 (2878 отзывов)
    Занимаю 1 место в рейтинге исполнителей по категориям работ "Научные статьи" и "Эссе". Пишу дипломные работы и магистерские диссертации.
    Занимаю 1 место в рейтинге исполнителей по категориям работ "Научные статьи" и "Эссе". Пишу дипломные работы и магистерские диссертации.
    #Кандидатские #Магистерские
    5125 Выполненных работ
    Анастасия Б.
    5 (145 отзывов)
    Опыт в написании студенческих работ (дипломные работы, магистерские диссертации, повышение уникальности текста, курсовые работы, научные статьи и т.д.) по экономическо... Читать все
    Опыт в написании студенческих работ (дипломные работы, магистерские диссертации, повышение уникальности текста, курсовые работы, научные статьи и т.д.) по экономическому и гуманитарному направлениях свыше 8 лет на различных площадках.
    #Кандидатские #Магистерские
    224 Выполненных работы

    Последние выполненные заказы