Прогнозирование развития резистентности Staphylococcus aureus в экспериментах с линезолидом и его комбинацией с даптомицином в динамической системе in vitro
СОДЕРЖАНИЕ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1 Проблема устойчивости бактерий к антибиотикам: текущее состояние и пути решения
1.2 Динамическая система in vitro
1.2.1 Воспроизведение моноэкспоненциального фармакокинетического профиля антибиотика в динамической системе in vitro
1.2.2 Одновременное воспроизведение фармакокинетических профилей двух антибиотиков с различными периодами полувыведения
1.2.3 Возможности и ограничения исследований в динамической системе in vitro
1.3 Фармакокинетико-фармакодинамические исследования в динамических системах in vitro при моделировании режимов монотерапии
1.3.1 Зависимость между антимикробным эффектом и концентрацией антибиотика, прогнозирование эффективности антибиотиков в клинике
1.3.2 Изучение процессов развития резистентности бактерий к антибиотикам, применимость гипотезы окна селекции мутантов (ОСМ)
1.3.3 Фармакокинетико-фармакодинамические параметры для прогнозирования развития резистентности бактерий к антибиотикам
1.4 Фармакокинетико-фармакодинамические исследования в динамических системах in vitro при моделировании комбинированной терапии линезолидом и даптомицином
1.4.1 Применение линезолида и даптомицина в комбинации при лечении инфекционных заболеваний в клинике
1.4.2 Изучение фармакодинамики линезолида и даптомицина в комбинации in vitro и in vivo
1.4.3 Изучение эффекта комбинации линезолида и даптомицина в отношении устойчивых клеток бактерий in vitro
2
1.5 Линезолид и даптомицин: характеристика антибиотиков
1.5.1 Линезолид
1.5.2 Даптомицин
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
2.1 Питательные среды, вспомогательное оборудование, расходные материалы и антибиотики
2.2 Бактериальные штаммы
2.3 Оценка чувствительности S. aureus к антибиотикам. Определение МПК и МПКМ
2.4 Моделируемые фармакокинетические профили антибиотиков
2.5 Динамическая система in vitro
2.5.1 Динамическая система для воспроизведения фармакокинетического профиля антибиотика
2.5.2 Динамическая система для одновременного воспроизведения фармакокинетических профилей двух антибиотиков
2.6 Воспроизводимость фармакокинетических профилей линезолида и даптомицина
2.7 Регламент эксперимента. Оценка противомикробного эффекта и развития устойчивости
2.8 Анализ зависимости противомикробного эффекта и селекции устойчивых мутантов S. aureus от фармакодинамических параметров
РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
ГЛАВА 3. ФАРМАКОДИНАМИКА ЛИНЕЗОЛИДА В ОТНОШЕНИИ УСТОЙЧИВЫХ И ЧУВСТВИТЕЛЬНЫХ К НЕМУ КЛЕТОК STAPHYLOCOCCUS AUREUS
3.1 Лабораторная селекция устойчивых мутантов S. aureus
3.2 Определение МПК и МПКМ линезолида
3.3 Фармакодинамика линезолида в отношении устойчивых к нему клеток S. aureus
3
3.4 Поиск оптимального предиктора развития устойчивости S. aureus к линезолиду
3.5 Фармакодинамика линезолида в отношении общей популяции клеток S. aureus
ГЛАВА 4. ФАРМАКОДИНАМИКА ЛИНЕЗОЛИДА И ДАПТОМИЦИНА ПО ОТДЕЛЬНОСТИ И В КОМБИНАЦИИ В ОТНОШЕНИИ УСТОЙЧИВЫХ И ЧУВСТВИТЕЛЬНЫХ КЛЕТОК STAPHYLOCOCCUS AUREUS
4.1 Определение МПКМ и МПК линезолида и даптомицина
4.2 Фармакодинамика комбинации линезолида с даптомицином в отношении устойчивой субпопуляции S. aureus
4.3 Фармакодинамика линезолида, даптомицина и их комбинации в отношении общей популяции S. aureus
ГЛАВА 5. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
ВЫВОДЫ
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
ПРИЛОЖЕНИЯ
Глава 1. Обзор литературы
Рассмотрена проблема устойчивости бактерий к антибиотикам, её текущее состояние
и пути решения, отмечена важность грамотного и оправданного подхода к применению
антибактериальных средств для лечения инфекционных заболеваний. Описан принцип
моделирования фармакокинетики антибиотика и одновременного моделирования
фармакокинетики нескольких антибиотиков в динамической системе in vitro. Проведён
анализ результатов фармакокинетико-фармакодинамических исследований в динамических
системах in vitro, посвященных изучению фармакодинамики антибиотиков, процессов
развития резистентности бактерий к антибиотикам, взаимодействия линезолида с
даптомицином. Приведена характеристика линезолида и даптомицина: активность,
фармакокинетика, фармакодинамика и эффективность в клинике.
Глава 2. Материалы и методы
Питательные среды, вспомогательное оборудование, расходные материалы и
антибиотики.
При проведении экспериментов использовали жидкую и плотную питательную среду
– бульон Мюллера-Хинтон (МХБ) и агар Мюллера-Хинтон II (МХА II), соответственно, а
также ряд вспомогательных материалов. Линезолид был предоставлен компанией Pfizer
Corporation (Гротон, США), даптомицин – компанией Cubist Pharmaceuticals, Inc.
(Лексингтон, США). В питательных средах, используемых во всех исследованиях с
даптомицином, создавали концентрацию ионов Са2+, соответствующую физиологическому
значению в крови человека – 50 мг/л (Hanberger et al., 1991; Carpenter, Chambers, 2004).
Бактериальные штаммы.
В работе использовали 4 штамма S. aureus: 479, 688, 2061 и ATCC 700699 (GISA Mu-
50). Все штаммы были устойчивыми к метициллину (MRSA). Штамм S. aureus ATCC 700699
характеризовался сниженной чувствительностью к ванкомицину, остальные штаммы были
к нему чувствительны. Для каждого штамма провели лабораторную селекцию резистентных
мутантов путём многократных пересевов на среде с линезолидом при постепенном
повышении его концентрации. Методология селекции РМ и их генетического анализа
описана в: Струкова, 2010, Firsov et al., 2015b.
Оценка чувствительности S. aureus к антибиотикам. Определение МПК и
МПКМ.
Значения МПК антибиотиков устанавливали методом серийных разведений в МХБ,
обогащённом ионами Ca2+ и Mg2+, согласно методике CLSI. Значения МПКМ антибиотиков
устанавливали методом разведений в МХА II. Методология описана в: Firsov et al., 2015b.
Значения МПК и МПКМ линезолида и даптомицина в присутствии друг друга в отношении
штаммов S. aureus 2061 и S. aureus ATCC 700699 МПК и МПКМ определяли при
соотношении их концентраций 1:2 в МХБ и МХА II, соответственно. Такое же соотношение
ПФК данных антибиотиков моделировали в экспериментах в динамической системе in vitro.
Моделируемые фармакокинетические профили антибиотиков.
В динамической системе in vitro моделировали моноэкспоненциальное снижение
концентрации антибиотика с установленным в клинических исследованиях периодом
полувыведения: 6 ч для линезолида (Moellering, 1999; Stalker, Jungbluth, 2003), 9 ч для
даптомицина (Dvorchik et al., 2003). Воспроизведенные фармакокинетические профили
соответствовали реализуемым у человека при 5-дневном введении линезолида с интервалом
в 12 ч (10 введений) и 5-дневном введении даптомицина с интервалом в 24 ч (5 введений).
Моделируемые значения ПФК составили: 15, 30, 60, 120, 240 и 480 мкг/мл×ч для линезолида
(режимы Л15, Л30, Л60, Л120, Л240 и Л480, соответственно), 240 и 480 мкг/мл×ч для
даптомицина (режимы Д240 и Д480, соответственно). Значения ПФК линезолида и
даптомицина, равные 240 и 480 мкг×ч/мл, соответственно, были близки к клинически
реализуемым: ПФК ≈ 228 мкг×ч/мл при введении линезолида в дозе 600 мг каждые 12 ч
(Meagher et al., 2003) и ПФК ≈ 494 мкг×ч/мл при введении даптомицина в дозе 4 мг/кг
каждые 24 ч (Dvorchik et al., 2003).
Штаммы S. aureus 479, S. aureus 688 и S. aureus ATCC 700699 подвергали воздействию
линезолида при моделировании его ПФК в 32-кратных пределах (режимы Л15-Л480).
Штаммы S. aureus 2061 и S. aureus ATCC 700699 подвергали воздействию линезолида и
даптомицина в отдельности (режимы Л240 и Л120, Д480 и Д240) и в комбинации (режимы
Л240+Д480 и Л120+Д240).
Динамическаясистемаinvitro ивоспроизводимостьзаданных
фармакокинетических профилей антибиотиков.
С целью моделирования фармакокинетических профилей антибиотиков и изучения
их фармакодинамики использовали динамическую систему in vitro. Она состоит из
герметичных сосудов (камер) различного назначения, насосов для создания потоков
жидкостей между всеми компонентами и системы отбора проб (Рисунок 1). Устройство
системы описано в: Firsov et al., 2015b. Принцип работы системы объяснён в: Фирсов и
соавт., 1989. Для одновременного моделирования профилей линезолида и даптомицина
использовался принцип суперпозиции потоков (Blaser, 1985).
Рисунок 1. Схема динамической системы in vitro.
Воспроизводимость заданных фармакокинетических профилей антибиотиков
проверяли методом ВЭЖХ. Фактические значения периода полувыведения линезолида и
даптомицина при применении в отдельности и в комбинации были близки к заданным.
Регламент эксперимента. Оценка противомикробного эффекта и развития
устойчивости.
Центральную камеру заполняли МХБ с 18-часовой бактериальной культурой S. aureus
и инкубировали при 370С в течение ~2 ч, затем начинали периодическое введение одного
или двух антибиотиков. Все эксперименты проводили: со смешанным инокулятом
(соотношение количества РМ к общей численности стафилококков 1:108 КОЕ), в течение
120 ч, не менее чем в двух повторностях. Из ЦК отбирали биопробы, которые высевали на
чашки с МХА II без антибиотика, с 2×, 4× и 8×МПК линезолида, с 2× и 4×МПК линезолида
или даптомицина (при работе с комбинацией антибиотиков). Чашки инкубировали при
температуре 37°С в течение 24-48 ч и подсчитывали число колоний. Нижний предел
определения составлял 103 КОЕ/мл (3 lg КОЕ/мл) и 10 КОЕ/мл (1 lg КОЕ/мл) для
чувствительных и резистентных клеток S. aureus, соответственно.
При интегральной оценке процессов изменения численности чувствительных и
устойчивых бактериальных клеток под воздействием антибиотика использовали параметры
ППК (площадь под кинетической кривой изменения общей численности клеток) (Фирсов и
соавт., 1985) и ППКM (площадь под кинетической кривой изменения численности
резистентных к антибиотику мутантов) (Firsov et al., 2008a), соответственно. Значения ППК
и ППКM оценивали в интервале времени от начала опыта до его окончания и
корректировали, вычитая произведение численности клеток на уровне предела определения
на 120 ч.
Анализ зависимости противомикробного эффекта и селекции устойчивых
мутантов S. aureus от фармакодинамических параметров.
Зависимость ППКM от ПФК/МПК и от ПФК/МПКМ описывали модифицированной
функцией Гаусса
Y = Y0 + a exp (0,5(|x – x0|/b)c), (1)
где Y – ППКM, x – lg (ПФК/МПК) или lg (ПФК/МПКМ), Y0 – минимальное значение Y,
x0 – значение lg (ПФК/МПК) или lg (ПФК/МПКМ), которое соответствует максимальному
значению Y, a, b и c – параметры уравнения.
Зависимость ППКM от TОСМ, от T>МПКм и от ПОМПКМ описывали сигмоидальной
функцией
Y = Y0 + a/{1 + exp (– (x – x0)/b)}, (2)
где Y – ППКM или ППК, x – TОСМ, или T>МПКм, или lg (ПФК/МПК), или ПОМПКМ, Y0
– минимальное значение ППКM или ППК, a –максимальное значение ППКM или ППК, x0 –
значение x, соответствующее a/2, и b – параметр уравнения, отражающий степень
сигмоидности.
За пороговое «антимутантное» значение фармакокинетико-фармакодинамического
параметра принимали значение, соответствующее значению ППКM, равному 30 (lg КОЕ/мл)
× ч (Strukova et al., 2016b).
Глава 3. Фармакодинамика линезолида в отношении устойчивых и чувствительных
к нему клеток Staphylococcus aureus
Лабораторная селекция устойчивых мутантов S. aureus.
Устойчивые к линезолиду мутанты каждого штамма с целевым значением МПК
линезолида (8 мкг/мл) (Firsov et al., 2015b) были отобраны после 7-го (S. aureus 479, РМ7),
9-го (S. aureus 2061, РМ9), 23-го (S. aureus ATCC 700699, РМ23) и 28-го (S. aureus 688, РМ28)
пассажа. По результатам анализа нуклеотидных последовательностей участка V домена гена
23S рРНК лабораторные мутанты S. aureus 479 (РМ7) и S. aureus ATCC 700699 (РМ23)
содержали нуклеотидную замену G2576T (нумерация по E. coli) в одной из копий гена 23S
рРНК. Данная хромосомная мутация часто встречается у выделенных в клинике устойчивых
к линезолиду стафилококков.
Определение МПК и МПКМ линезолида.
Значение МПК линезолида составило 2 мкг/мл в отношении всех штаммов S. aureus
(все штаммы – чувствительные). Значения МПКМ линезолида составляли 5 (S. aureus 479),
6 (S. aureus 688) и 10 мкг/мл (S. aureus 2061 и S. aureus ATCC 700699). Значения, полученные
при использовании инокулята без РМ и с РМ совпадали. Все последующие исследования в
динамической системе in vitro проводились со смешанным инокулятом.
Фармакодинамика линезолида в отношении устойчивых к нему клеток S. aureus.
С целью установления зависимости между численностью устойчивых к линезолиду
клеток и режимом дозирования антибиотика моделировали его фармакокинетику в 32-
кратном диапазоне значений ПФК (от 15 до 480 мкг×ч/мл, режимы Л15-Л480) в отношении
штаммов с различными значениями МПКМ: S. aureus 479, S. aureus 688 и S. aureus ATCC
700699. Накопление устойчивых стафилококков происходило, когда концентрации
антибиотика находились в пределах ОСМ в течение большей части интервала дозирования.
Это можно проследить на примере трёх из моделируемых фармакокинетических профилей
линезолида и соответствующих им кинетических кривых изменения численности клеток S.
aureus ATCC 700699, устойчивых к 2×МПК антибиотика (Рисунок 2). Резистентность к
линезолиду развивалась, когда его фармакокинетический профиль находился в пределах
ОСМ (режим Л15; TОСМ = 99%, Т>МПКм = 0%), и подавлялась, когда уровни концентрации
антибиотика были ниже МПК (режим Л120; TОСМ = 99%, Т>МПКм = 0%) или выше МПКМ (
режим Л480; TОСМ = 4%, Т>МПКм = 96%).
В условиях, способствующих селекции мутантов, устойчивых к 2×МПК линезолида,
в популяции каждого штамма также шло накопление мутантов, устойчивых к 4×МПК
линезолида (интенсивность их роста зависела от штамма), а в популяции S. aureus АТСС
700699 – также к 8×МПК линезолида.
При моделировании терапевтического режима Л240 наблюдали селекцию мутантов
каждого штамма, наиболее интенсивную – у S. aureus ATCC 700699, причём были выявлены
мутанты данного штамма с уровнем устойчивости выше 2×МПК линезолида.
Рисунок 2. Моделируемые профили линезолида и кинетические кривые изменения
численности мутантов S. aureus ATCC 700699, устойчивых к 2×МПК линезолида. Моменты
введения линезолида обозначены стрелками. ОСМ обозначены закрашенными областями.
Поиск оптимального предиктора развития устойчивости S. aureus к линезолиду.
С целью установления зависимости «антимутантного» эффекта линезолида от
фармакокинетико-фармакодинамических параметров были рассчитаны значения
интегрального параметра ППКM для каждой кинетической кривой, отражающей изменения
численности устойчивых стафилококков во времени.
Минимальное расслоение индивидуальных кривых каждого штамма в системах
координат ППКM-ПФК/МПК и ППКM-ПФК/МПКМ позволяет объединить данные и описать
их уравнением Гаусса (Уравнение 1) с высокими коэффициентами корреляции (r2 = 0,89 и
0,81, соответственно) (Рисунок 3).
Пороговые значения параметров ПФК/МПК и ПФК/МПКМ составили 200 и 80 ч,
соответственно. Зависимость «ППКM – ПФК/МПК» была построена на основании данных,
полученных для штаммов с одинаковым значением МПК (2 мкг/мл), и вопрос о её
применимости для прогнозирования «антимутантного» эффекта линезолида в отношении
штаммов стафилококка с другими значениями МПК линезолида остаётся открытым. В этой
связи параметр ПФК/МПКМ следует считать предпочтительным для использования в
качестве предиктора развития резистентности S. aureus к линезолиду.
При анализе зависимостей ППКM-ПФК/МПК для индивидуальных штаммов S. aureus,
нисходящей половине каждой кривой соответствовали значения T>МПКм > 0. Использование
такого разделения при построении соответствующих графиков зависимости ППК M от TОСМ
позволяет увидеть петлю гистерезиса: для верхней части кривой выполняется условие
T>МПКм = 0, а для нижней – T>МПКм > 0. Гистерезис показан на примере штамма S. aureus
ATCC 700699 на Рисунке 4.
Рисунок 3. Зависимости ППКM для мутантов S. aureus, устойчивых к 2×МПК
линезолида (объединённые данные по трём штаммам), от ПФК/МПК и ПФК/МПКМ.
Рисунок 4. Зависимости ППКM для мутантов S. aureus ATCC 700699, устойчивых к
2×МПК линезолида, от ПФК24/МПК и TОСМ. Значения T>МПКм указаны в выносках.
Зависимость величин ППКM, относящихся к нижней кривой гистерезиса (T>МПКм > 0),
от TОСМ и зависимость ППКM от T>МПКм была описана сигмоидной функцией c r2 = 0,91
(Уравнение 2) (Рисунок 5).
Поскольку одному и тому же значению TОСМ могут соответствовать принципиально
разные уровни устойчивости, предпочтительным для прогноза развития резистентности S.
aureus к линезолиду представляется параметр T>МПКм.
Прогнозируемые пороговые «антимутантные» значения ПФК/МПКМ и T>МПКм
составили 80 ч и 100 % от интервала дозирования, соответственно. Такие значения могут
быть достигнуты при применении линезолида в терапевтической дозе в том случае, если
значение его МПКМ в отношении бактериального штамма не превышает 4 мкг/мл.
Рисунок 5. Зависимости ППКM для мутантов S. aureus, устойчивых к 2×МПК
линезолида (объединённые данные по трём штаммам), от TОСМ и T>МПКм.
Результаты анализа связи между фармакокинетико-фармакодинамическими
параметрами и резистентностью для мутантов S. aureus, резистентных к 4×МПК линезолида,
соответствовали вышеописанным.
Фармакодинамика линезолида в отношении общей популяции клеток S. aureus.
Антистафилококковый эффект линезолида зависел от режима его дозирования и был
качественно схожим в отношении всех изученных штаммов. Эффект отсутствовал при
режимах Л15-Л60 и был умеренным при режимах Л120-Л480, усиливаясь по мере
увеличения моделируемого значения ПФК. Между значениями ППК (объединённые данные
по трём штаммам) и ПФК/МПК была установлена зависимость, описываемая сигмоидной
функцией (Уравнение 2) с r2 = 0,82.
Глава 4. Фармакодинамика линезолида в комбинации с даптомицином в отношении
устойчивых и чувствительных клеток Staphylococcus aureus
С целью оценки возможности преодоления устойчивости S. aureus к линезолиду под
воздействием его комбинации с даптомицином проведены фармакодинамические
исследования cо штаммами S. aureus АТСС 700699 и S. aureus 2061, которые
характеризовались значением МПКМ линезолида, равным 10 мкг/мл.
Определение МПКМ и МПК линезолида и даптомицина.
Значение МПКМ линезолида составило 10 мкг/мл в отношении обоих штаммов,
даптомицина – 10 и 14 мкг/мл в отношении S. aureus 2061 и S. aureus ATCC 700699,
соответственно. Под действием даптомицина значения МПКМ линезолида в отношении
штаммов S. aureus АТСС 700699 и S. aureus 2061 снизились в 3,3 и 2,5 раза (с 10 до 3 и 4
мкг/мл, соответственно). Под влиянием линезолида произошло 2,3- и 1,25-кратное снижение
МПКМ даптомицина в отношении штаммов S. aureus АТСС 700699 и S. aureus 2061 (с 14 и
10 до 6 и 8 мкг/мл, соответственно).
Под влиянием даптомицина значения МПК линезолида в отношении штаммов S.
aureus 2061 и ATCC 700699 снижались в 16 раз (с 2 до 0,125 мкг/мл), а под влиянием
линезолида величина МПК даптомицина в отношении штамма S. aureus ATCC 700699
снизилась в 2 раза (с 0,5 до 0,25 мкг/мл) и не изменилась в отношении штамма S. aureus 2061
(0,25 мкг/мл).
Фармакодинамика комбинации линезолида с даптомицином в отношении
устойчивой субпопуляции S. aureus.
Для оценки «антимутантного» эффекта в отношении обоих штаммов S. aureus
моделировали фармакокинетические профили линезолида и даптомицина отдельно и в
комбинации при их соотношении 1:2. Моделировали режимы дозирования линезолида,
даптомицина и их комбинации при соответствующих терапевтическим (Л240, Д480 и
Л240+Д480, соответственно) и субтерапевтическим значениях ПФК (Л120, Д240 и
Л120+Д240, соответственно). Линезолид вводили каждые 12 ч, даптомицин – каждые 24 ч
на протяжении 5 дней. Сочетанное применение антибиотиков подавляло рост мутантов,
устойчивых к каждому их них, что можно увидеть на примере штамма S. aureus ATCC
700699 при режимах Л240, Д480 и Л240+Д480, (Рисунок 6). Подавление развитие
резистентности было связано с увеличением продолжительности пребывания профиля
антибиотика выше уровня МПКМ, что стало следствием снижения значений МПКМ
препаратов в отношении S. aureus под влиянием друг друга.
Сопоставление значений параметра ППКМ для линезолида (ППКМ(Л)) и даптомицина
(ППКМ(Д)) с соответствующими значениями Т>МПКм подтвердило наличие зависимости:
меньшим значениям площадей (менее выраженное развитие резистентности)
преимущественно соответствовали бόльшие значения Т>МПКм. Также значения ППКМ(Л) и
ППКМ(Д) сопоставляли с новым интегральным параметром ПОМПКМ: их снижение
согласовывалось с увеличением соответствующих значений ПОМПКМ.
С целью оценки надёжности параметров T>МПКм и ПОМПКМ как штаммонезависимых
предикторов «антимутантного» эффекта их значения были сопоставлены с величиной
ППКM(Л) или ППКM(Д) для S. aureus ATCC 700699 и S. aureus 2061 при использовании
антибиотиков отдельно и в комбинации. Расположение точек на графике зависимости
ППКM(Л) или ППКM(Д) от T>МПКм позволяет описать ее сигмоидной функцией (Уравнение 2) с
r2 0,97 или 0,78, соответственно. Та же функция описывает зависимость ППКM(Л) или
ППКM(Д) от ПОМПКМ (r2 0,95 или 0,73, соответственно). На основании зависимости ППКM(Л)
или ППКM(Д) от T>МПКм и ПОМПКМ можно прогнозировать «антимутантные» значения
T>МПКм и ПОМПКМ. Они составили, соответственно, 60% от интервала дозирования
линезолида и даптомицина и 80 мкг×ч/мл.
Рисунок 6. Моделируемые профили линезолида и даптомицина и кинетические
кривые изменения численности мутантов S. aureus ATCC 700699, устойчивых 2×МПК
соответствующего антибиотика, при применении их в отдельности и в комбинации при
терапевтически реализуемых значениях ПФК. ОСМ обозначены закрашенными областями.
Фармакодинамика линезолида, даптомицина и их комбинации в отношении
общей популяции S. aureus.
Эффект комбинации в отношении S. aureus АТСС 700699 и S. aureus 2061 при обоих
моделируемых режимах дозирования был выше эффекта линезолида. Эффект комбинации
линезолида с даптомицином в отношении обоих штаммов S. aureus при режимах Л240+Д480
и Л120+Д240 на протяжении всего периода наблюдения был схожим с эффектом
липопептида в отдельности при режимах Д240 и Д480, соответственно. По-видимому, эти
различия обусловлены значительно бóльшим снижением МПК линезолида под влиянием
даптомицина (16-кратные различия) по сравнению с минимальным снижением МПК
даптомицина под влиянием линезолида (2-кратное различие для S. aureus ATCC 700699 при
отсутствии различий в МПК для S. aureus 2061).
Глава 5. Обсуждение результатов
Антимикробный эффект линезолида в отношении общей популяции трёх изученных
штаммов S. aureus был качественно схожим и зависел от режима дозирования препарата.
Между ППК (объединённые данные по всем штаммам) и ПФК/МПК была установлена
зависимость, описываемая сигмоидной функцией (r2 = 0,82). Сигмоидные зависимости
между параметром, отражающим антибактериальный эффект, и ПФК/МПК прежде были
установлены для многих пар антибиотик-бактерия (Firsov et al., 1997, 2000a, 2001, 2002a,
2002b, 2003, 2006, 2013; MacGowan et al., 2000, 2001; Klepser et al., 2001; Lubenko et al., 2008;
Strukova et al., 2009; 2016a, 2016b).
Настоящая работа стала логическим продолжением исследования, посвящённого
изучению закономерностей развития резистентности S. aureus к линезолиду (Струкова,
2010; Firsov et al., 2015b). В предыдущем исследовании был разработан метод
искусственного обогащения бактериальной популяции стафилококка устойчивыми
клетками, который позволил изучить развитие резистентности к линезолиду у штаммов S.
aureus (Firsov et al., 2015b, 2017; Zinner et al., 2018), в том числе при его сочетанном
применении с рифампицином (Firsov et al., 2017) и гентамицином (Zinner et al., 2018).
Данный метод успешно применили и в настоящем исследовании.
По сравнению с упомянутой работой (Струкова, 2010; Firsov et al., 2015b), в
настоящем исследовании моделировали значительно более широкий диапазон значений
ПФК линезолида. В результате нам удалось установить куполообразные зависимости между
развитием резистентности S. aureus и параметрами ПФК/МПК или ПФК/МПКМ с высокими
коэффициентами корреляции. Подобные куполообразные кривые зависимости
«резистентность – концентрация», подтверждающие справедливость гипотезы ОСМ, ранее
были получены для антибиотиков других классов: фторхинолонов (Firsov et al., 2003, 2013,
2014, 2015a; Zinner et al., 2003, 2013; Croisier et al., 2004; Tam et al., 2007; Gebru et al., 2011;
Strukova et al., 2015, 2016b), гликопептидов (Firsov et al., 2006; Zhu et al., 2012), липопептидов
(Firsov et al., 2006) и бета-лактамов (Stearne et al., 2007). Примечательно, что диапазон
значений ПФК/МПК для S. aureus и линезолида, который соответствовал наиболее
интенсивному обогащению популяции бактерий мутантами (30-60 ч), оказался схожим с
таковыми для S. aureus в случае ванкомицина, даптомицина (20-60 ч) (Firsov et al., 2006) и
фторхинолонов (24-62 ч) (Firsov et al., 2003).
При анализе зависимости ППКМ от TОСМ отмечался гистерезис, связанный и
гетерогенностью ОСМ (Firsov et al., 2008a). Между ППКМ и параметром TОСМ при Т>МПКм =
0 или Т>МПКм были установлены сигмоидные зависимости с высокими коэффициентами
корреляции.
Параметры ПФК/МПКМ и T>МПКм были признаны наиболее надёжными для
прогнозирования селекции устойчивых к линезолиду мутантов S. aureus. Прогнозируемое
пороговое «антимутантное» значение ПФК/МПКМ и T>МПКм в отношении стафилококка
составило, соответственно, 80 мкг×ч/мл и 100% от интервала дозирования линезолида.
Спрогнозированное на основе каждого из параметров пороговое значение МПКМ
линезолида (для терапевтической дозы 600 мг каждые 12 ч) составило 4 мкг/мл.
Если штамм стафилококка, вызвавший заболевание, характеризуется значением
МПКМ линезолида выше порогового, то вероятно развитие резистентности этого штамма к
линезолиду в процессе терапии. Значения МПКМ изученных в фармакодинамических
экспериментах штаммов S. aureus 479, 688 и АТСС 700699, равные 5, 6 и 10 мкг/мл,
соответственно, оказались выше данного критического значения. Наибольшую «опасность»
с точки зрения развития резистентности представляет штамм S. aureus АТСС 700699
характеризующийся значением МПКМ в 2 раза выше порогового. В отношении данного
штамма, а также изолята S. aureus 2061 с таким же значением МПКМ линезолида, была
изучена перспективность применения линезолида в комбинации с даптомицином.
В настоящей работе применяли фармакокинетически-обоснованный подход к
прогнозированиюразвития резистентности бактерийнафонеприменения
комбинированной антибиотикотерапии: оценку значений МПКМ антибиотиков,
применяемых в комбинации, проводили при соотношении концентраций препаратов,
соответствующем соотношению значений ПФК антибиотиков, моделируемых в
фармакодинамических экспериментах (Firsov et al., 2017; Zinner et al., 2018; Golikova et al.,
2019). Под действием линезолида или даптомицина в отдельности при моделировании как
субтерапевтических, так и терапевтических значений ПФК, популяция каждого штамма S.
aureus обогащалась мутантами, устойчивыми к соответствующему антибиотику. При
применении антибиотиков в комбинации, рост клеток стафилококка, устойчивых к
линезолиду или даптомицину, подавлялся полностью или частично, соответственно.
Усиление «антимутантного» эффекта антибиотиков, используемых в комбинации, было
связано со снижением значений их МПКМ в присутствии друг друга.
В настоящей работе было показано соответствие между снижением значений МПК М
антибиотиков под влиянием друг друга, повышением значений T>МПКм или ПОМПКМ
препаратов при их применении в комбинации и возрастанием «антимутантного» эффекта в
отношении S. aureus. Как показал регрессионный анализ, параметры T>МПКм и ПОМПКМ
являются надёжными предикторами «антимутантного» эффекта комбинации линезолида с
даптомицином в отношении S. aureus: была установлена сигмоидная зависимость между
параметрами T>МПКм или ПОМПКМ и ППКM(Л). Ранее возможность использования T>МПКм для
прогнозирования развития резистентности золотистого стафилококка была установлена для
комбинаций линезолид-рифампицин (Firsov et al., 2017) и линезолид-гентамицин (Zinner et
al., 2018), ПОМПКМ – для комбинации даптомицин-рифампицин (Golikova et al., 2019).
Было отмечено усиление антистафилококкового эффекта комбинации по сравнению
с линезолидом, но не с даптомицином. Схожие результаты были получены в нескольких
работах, посвященных изучению эффекта данной комбинации в динамических системах in
vitro (Luther, LaPlante, 2015; Jørgensen et al., 2016). Предположительно, различия между
эффектом каждого из препаратов в отдельности и в комбинации связаны со снижением
значений МПК антибиотиков в присутствии друг друга. Похожая связь прослеживается для
других комбинаций с линезолидом или даптомицином и S. aureus (Firsov et al., 2017; Zinner
et al., 2018; Golikova et al., 2019, 2020). Комбинация линезолид-даптомицин может
представлятьинтересдлятерапиистафилококковыхинфекцийблагодаряеё
потенциальному «антимутантному» действию: возможность предотвратить или, по крайней
мере, отсрочить развитие резистентности бактерий при проведении антимикробной терапии
двумя препаратами повышает шанс успешного лечения.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Настоящая работа стала продолжением серии исследований, проводимых ранее в
динамических системах in vitro с антибиотиками разных групп. По результатам настоящего
исследования была подтверждена применимость гипотезы ОСМ к линезолиду при его
действии на штаммы Staphylococcus aureus. Между резистентностью S. aureus к линезолиду
ифармакокинетико-фармакодинамическимипараметрами,отражающимиего
концентрацию, были установлены зависимости, описываемые функцией Гаусса или
сигмоидной функцией.
До сих пор установить применимость гипотезы ОСМ и получить аналогичные
зависимости удалось применительно к антибиотикам групп фторхинолонов, липо- и
гликопептидов, цефалоспоринов. Результаты настоящего исследования позволяют
предполагать, что развитие резистентности бактерий к антибиотикам разных классов
происходит по одним и тем же законам. Установленные зависимости между
резистентностью S. aureus к линезолиду и фармакокинетико-фармакодинамическими
параметрамисталиоснованиемдля выбораоптимальныхпредикторов
антибиотикорезистентности.
Согласно полученным результатам, режим дозирования линезолида, применяемый
для терапии инфекционных заболеваний, не гарантирует предотвращения развития к нему
резистентности S. aureus. Мы установили, что сочетанное применение линезолида и
даптомицина позволяет предотвратить развитие резистентности S. aureus как к линезолиду,
так и к даптомицину, и обеспечивает антистафилококковый эффект, сравнимый с эффектом
даптомицина в отдельности. На основании полученных результатов можно сделать
заключение о перспективности применения данной комбинации антибиотиков в клинике
для терапии стафилококковых инфекций с целью снизить риск развития устойчивости
данного возбудителя к линезолиду и даптомицину.
ВЫВОДЫ
1. Подтверждена применимость гипотезы существования «окна селекции мутантов» к паре
«линезолид – S. aureus»: интенсивность селекции устойчивых к линезолиду мутантов
золотистого стафилококка зависит от положения фармакокинетического профиля
антибиотика относительно «окна селекции мутантов».
2. Установлены зависимости между развитием резистентности S. aureus к линезолиду и его
концентрацией, выраженной при помощи фармакокинетико-фармакодинамических
параметров. Согласно полученным результатам, наиболее надёжными для прогнозирования
эффекта линезолида в отношении резистентных мутантов S. aureus признаны параметры
ПФК/МПКМ и T>МПКм. Рассчитанное на основе этих параметров пороговое значение МПКМ
может быть использовано для оценки риска развития резистентности золотистого
стафилококка к линезолиду.
3. Показано, что линезолид при его применении в дозе, соответствующей терапевтической,
не гарантирует полного подавления селекции устойчивых мутантов S. aureus, что позволяет
сделать вывод о целесообразности применения линезолида в комбинации с другими
антибиотиками.
4. Показано, что сочетанное применение линезолида и даптомицина при моделировании
режимовихдозирования,соответствующихклиническим,характеризуется
«антимутантным» эффектом в отношении золотистого стафилококка. Отмечен сходный
антистафилококковый эффект комбинации линезолида и даптомицина и более
эффективного антибиотика из сочетаемых – даптомицина.
5. Показана применимость параметров T>МПКм и ПОМПКМ для прогнозирования
вероятности развития резистентности S. aureus к линезолиду и даптомицину при их
использовании в комбинации.
Актуальность исследования
Снижение чувствительности возбудителей инфекционных заболеваний к старым антибиотикам на фоне замедления темпов создания новых препаратов – это серьёзная проблема современного здравоохранения. Одним из путей предотвращения развития устойчивости бактерий к антибиотикам является оптимизация их применения. В основе оптимизации антибиотикотерапии лежит знание зависимости «резистентность – концентрация». До настоящего времени данные о развитии резистентности возбудителей инфекционных заболеваний, полученные в клинике, не удалось связать с фармакокинетическими параметрами антимикробных препаратов. Одним из перспективных направлений исследований, которое позволяет изучать такие зависимости, является фармакокинетико-фармакодинамическое моделирование, основным инструментом которого являются динамические системы in vitro. При помощи таких систем оказывается возможным изучать закономерности развития резистентности бактерий под воздействием антибиотика в условиях его меняющейся концентрации так, как это происходит у человека. Исследования в динамических системах позволяют: устанавливать зависимость между резистентностью и фармакокинетико- фармакодинамическими параметрами антибиотика, прогнозировать развитие резистентности бактерий при клинических режимах антибиотикотерапии, определять пороговые значения фармакокинетико-фармакодинамических параметров, при которых наблюдается подавление развития резистентности бактерий. На сегодняшний день наиболее подробно в этом аспекте были изучены антибиотики группы фторхинолонов. По результатам исследований с этими антибиотиками была выдвинута гипотеза существования «окна селекции мутантов» (Zhao, Drlica, 2001; Drlica, 2003) и неоднократно подтверждена ее применимость (Firsov et al., 2003, 2013; Zinner et al., 2003, 2013; Tam et al., 2007; Gebru et al., 2011). Согласно данной гипотезе обогащение микробной популяции устойчивыми клетками наиболее вероятно, когда концентрации воздействующего на неё антибиотика находятся в диапазоне, нижний предел которого – минимальная подавляющая концентрация препарата в отношении микроорганизма-мишени (МПК), а верхний – минимальная концентрация, предотвращающая рост устойчивых мутантов, присутствующих в бактериальной популяции (МПКМ). После того как гипотеза «окна селекции мутантов» (ОСМ) была сформулирована, в исследованиях с фторхинолонами впервые был установлен куполообразный вид зависимости между резистентностью и ПФК/ПМК или ПФК/МПКМ (площадью под фармакокинетической кривой изменения концентрации антибиотика, ПФК, отнесённой, соответственно, к МПК или МПКМ данного препарата в отношении микроорганизма-мишени) (Firsov 2003, Tam et al., 2007; Gebru et al., 2011; Firsov et al., 2013, 2014, 2015a; Strukova et al., 2015, 2016). Кроме того, были проведены многочисленные исследования, направленные на поиск оптимального фармакокинетико- фармакодинамического параметра, применимого для прогнозирования развития резистентности к фторхинолонам при разных режимах их применения, в том числе клинических (Homma et al., 2007; Firsov et al., 2008b, 2013; Liang et al., 2011; Gebru et al., 2011; Strukova et al., 2016a, 2016b). Применительно к антибиотикам других классов эти вопросы во многом остались нерешёнными. В этой связи проведение подобных исследований с другими препаратами, в частности, с антибиотиками новых классов, например, линезолидом, весьма актуально. Это приобретает особенную важность в связи с систематическим появлением новых сообщений о выделении в клинике резистентных к линезолиду энтерококков (Seedat et al., 2006; Knoll et al., 2013; de Almeida et al., 2014; Yu et al., 2014) и стафилококков (Locke et al., 2009a; Yoshida et al., 2009; Hill et al., 2010; Ikeda-Dantsuji et al., 2011). Комбинированное применение антибиотиков – один из путей борьбы с развитием резистентности к ним бактерий. Как было показано в ряде исследований, проведённых с применением динамических систем in vitro, использование комбинаций препаратов, в составе которых был линезолид, позволяет подавить развитие резистентности бактерий, наблюдаемое при применении линезолида в отдельности (Firsov et al., 2017; Zinner et al., 2018).
В связи с вышесказанным установление зависимости между развитием резистентности к линезолиду и его концентрацией, а также оценка возможности подавления селекции устойчивых мутантов на фоне комбинированного применения линезолида с антибиотиками других групп в динамических системах in vitro представляется весьма актуальным.
Цель работы
Прогнозирование риска развития резистентности S. aureus к линезолиду, а также изучение эффекта комбинации линезолида с даптомицином в отношении общей популяции и резистентной субпопуляции золотистого стафилококка в динамической системе in vitro.
Задачи исследования
1. Проверить применимость гипотезы существования «окна селекции мутантов» к паре «линезолид – S. aureus».
2. Установить зависимость между развитием резистентности золотистого стафилококка к линезолиду и его концентрацией, выраженной при помощи фармакокинетико-фармакодинамических параметров, и выбрать оптимальный параметр для прогнозирования селекции устойчивых к линезолиду мутантов S. aureus.
3. Оценить вероятность селекции устойчивых мутантов S. aureus при моделировании режима дозирования линезолида, соответствующего терапевтическому. 4. Оценить возможность подавления развития резистентности S. aureus при использовании линезолида в комбинации с даптомицином.
5. Оценить применимость различных фармакокинетико- фармакодинамических параметров для прогнозирования риска развития резистентности S. aureus на фоне применения линезолида в комбинации с даптомицином.
Научная новизна
Впервые установлены зависимости между селекцией устойчивых к линезолиду мутантов S. aureus и фармакокинетико-фармакодинамическими параметрами.
Впервые установлено, что для прогнозирования воздействия линезолида на устойчивые субпопуляции S. aureus наиболее применимы параметры ПФК/МПКМ и T>МПКм (время в % от интервала дозирования, в течение которого концентрация антибиотика превышает уровень МПКМ).
Впервые установлено, что применение линезолида и даптомицина в комбинации позволяет предотвратить селекцию устойчивых к ним мутантов S. aureus, наблюдаемую при использовании каждого из препаратов в отдельности.
Впервые доказана применимость параметра T>МПКм и интегрального параметра, определяемого как площадь, ограниченная фармакокинетическим профилем антибиотика и его МПКМ (ПОМПКМ), для прогнозирования вероятности развития резистентности S. aureus к линезолиду и даптомицину при их сочетанном применении.
Теоретическая и практическая значимость работы
Подтверждение применимости гипотезы существования «окна селекции мутантов» в отношении всё большего числа пар антибиотик-бактерия свидетельствует о том, что развитие резистентности бактерий к антибиотикам разных классов происходит в соответствии с одними и теми же закономерностями. Знание этих закономерностей, а также зависимостей «резистентность – концентрация», является основой оптимизации режимов антибиотикотерапии с целью предотвращения развития резистентности бактерий.
В настоящей работе была подтверждена применимость гипотезы «окна селекции мутантов» в отношении пары «линезолид – S. aureus». Кроме того, применимость данной гипотезы была впервые подтверждена в отношении комбинации линезолида с даптомицином и S. aureus. Установлены функциональные зависимости между развитием резистентности и фармакокинетико-фармакодинамическими параметрами. На основании анализа этих зависимостей выбраны параметры, которые можно использовать для прогнозирования развития резистентности золотистого стафилококка к линезолиду – ПФК/МПКМ и T>МПКм, и к комбинации линезолида с даптомицином – T>МПКм и ПОМПКМ. Определены пороговые значения МПКМ линезолида в отношении изученных штаммов золотистого стафилококка. Эти пороговые значения могут быть применены для оценки возможности развития резистентности у других штаммов этого вида при монотерапии линезолидом. Отмечен выраженный эффект сочетания линезолида и даптомицина в отношении резистентных клеток S. aureus («антимутантный» эффект). Как показало настоящее исследование, применение линезолида в комбинации с даптомицином при терапии стафилококковых инфекций может снизить риск развития устойчивости S. aureus.
Основные положения, выносимые на защиту
1. Гипотеза существования «окна селекции мутантов» применима к линезолиду и представителю грамположительных бактерий – S. aureus: интенсивность селекции устойчивых к линезолиду мутантов S. aureus зависит от положения фармакокинетического профиля антибиотика относительно «окна селекции мутантов». 2. Параметры ПФК/МПКМ и Т>МПКм являются оптимальными для прогнозирования развития резистентности золотистого стафилококка к линезолиду. Зависимость между развитием резистентности стафилококка к линезолиду и параметрами ПФК/МПКМ или Т>МПКм описывается функцией Гаусса или сигмоидной функцией, соответственно.
3. Развитие резистентности S. aureus к линезолиду, наблюдаемое при его применении в дозе, соответствующей терапевтической, можно предотвратить путём его сочетанного применения с даптомицином. Развитие резистентности S. aureus к даптомицину также подавляется под действием данной комбинации. Эффект комбинации в отношении общей популяции S. aureus сравним с таковым даптомицина.
4. Параметры T>МПКм и ПОМПКМ можно использовать для прогнозирования вероятности развития резистентности бактерий при комбинированном применении линезолида и даптомицина.
Личный вклад автора
Автор, Алиева Камилла Натиговна, провела обзор, анализ и систематизацию научно-методической литературы, посвященной проблематике работы. Автор определила значения МПК и МПКМ антибиотиков в отношении исследуемых штаммов S. aureus, провела лабораторную селекцию мутантов S. aureus, выполнила эксперименты с S. aureus в динамической системе in vitro, моделирующей фармакокинетику линезолида и даптомицина при их введении в отдельности или в комбинации. Обработала и проанализировала результаты экспериментов.
Разработка и постановка экспериментальных научных исследований, изложенных в диссертационной работе, а также анализ полученных результатов исследовательской работы были выполнены автором самостоятельно под руководством д.б.н., профессора Фирсова Александра Алексеевича и к.б.н. Голиковой Марии Владимировны. Апробация работы
Основные положения были представлены на международных конгрессах European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), проходивших в Амстердаме (2016 и 2019 г), Вене (2017 г), Мадриде (2018 г); международной онлайн конференции FEMS Online Conference on Microbiology 2020; Научно-практической конференции молодых учёных «Актуальные вопросы эпидемиологии, диагностики, лечения и профилактики инфекционных и онкологических заболеваний» (Москва, 2018); Научной конференции с международным участием «Вакцинология как ответ биологическим угрозам», посвящённой 100-летию основания НИИВС им. И.И. Мечникова, в секции «Наука в руках молодых учёных: Антибиотики» (Москва, 2019).
Публикации
По результатам приведённых в настоящей работе исследований опубликовано 6 научных статей, 5 из которых – в журналах, индексируемых Web of Science и Scopus, в том числе 2 статьи в изданиях, входящих в первый квартиль, и 1 статья в издании, входящем во второй квартиль по импакт- фактору согласно рейтингу научных журналов SCImago (SJR, SCImago Journal Rankings); 3 статьи – в рецензируемых журналах, рекомендованных ВАК Министерства науки и высшего образования РФ для публикации результатов диссертационных работ:
1. Firsov A. A., Alieva K. N., Strukova E. N., Golikova M. V., Portnoy Y. A., Dovzhenko S. A., Kobrin M. B., Romanov A V., Edelstein M V., Zinner S. H. Testing the mutant selection window hypothesis with Staphylococcus aureus exposed to linezolid in an in vitro dynamic model // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. – 2017. – Vol. 72. – No 11. – P. 3100-3107.
2. Alieva K. N., Strukova E. N., Golikova M. V., Portnoy Y. A., Zinner S. H., Firsov A. A. Time inside the mutant selection window as a predictor of staphylococcal resistance to linezolid // The Journal of antibiotics. – 2018. – Vol. 71. – No 5. – P. 514-521.
3. Zinner S. H., Alieva K. N., Strukova E. N., Golikova M. V., Portnoy Y. A., Firsov A. A. Anti-mutant efficacy of antibiotic combinations: in vitro model studies with linezolid and daptomycin // Journal of Antimicrobial Chemotherapy. – 2021.
4. Алиева К. Н., Струкова Е. Н., Голикова М. В., Портной Ю. А., Фирсов А. А. Зависимая от концентрации антибиотика селекция линезолидоусточивых стафилококков в динамической системе in vitro // Антибиотики и химиотерапия. – 2016. – Т. 61. – No 9-10. – С. 28-32.
5. Алиева К. Н., Фирсов А. А. Новое в фармакодинамике противобактериальных средств на 28-м конгрессе ECCMID // Эффективная фармакотерапия. – 2019. – Т. 15. – No 1. – С. 16-21.
6. Алиева К. Н., Голикова М. В., Портной Ю. А., Фирсов А. А. Комбинированная терапия как путь к предотвращению антибиотикорезистентности бактерий: линезолид—даптомицин против Staphylococcus aureus // Антибиотики и химиотерапия. – 2019. – Т. 64. – No 9- 10. – С. 8 -13.
Структура и объём работы
Диссертация состоит из следующих разделов: введения, обзора литературы, описания объектов и методов исследования, двух глав результатов исследований, обсуждения результатов, заключения, выводов, списка сокращений и условных обозначений, списка использованной литературы, приложений. Материалы диссертации изложены на 172 страницах, содержат 4 таблицы, 44 рисунка и 6 приложений. Список литературы включает 243 источника, в том числе 231 на иностранном языке.
Публикации автора в научных журналах
Помогаем с подготовкой сопроводительных документов
Хочешь уникальную работу?
Больше 3 000 экспертов уже готовы начать работу над твоим проектом!