Моделирование структурно-функциональных особенностей кожи пациентов с врожденным буллезным эпидермолизом с использованием пациент-специфических клеток

Бесплатно
Работа доступна по лицензии Creative Commons:«Attribution» 4.0
Бейлин Аркадий Константинович
Бесплатно
Работа доступна по лицензии Creative Commons:«Attribution» 4.0

ОГЛАВЛЕНИЕ 2
ВВЕДЕНИЕ 7
Актуальность и современное состояние проблемы 7

Цели и задачи исследования 8

Научная новизна исследования 9

Практическая значимость 9

Положения, выносимые на защиту 9

Методы исследования 10

Степень достоверности и апробация работы 10

Перечень публикаций 12

Личный вклад автора 13

Структура и объем диссертации 14

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 15
1. Врожденный буллезный эпидермолиз 15

1.1 Классификация типов врожденного буллезного эпидермолиза 15

1.2 Генетика врожденного буллезного эпидермолиза 15

1.3 Распространенность буллезного эпидермолиза 17

1.4 Диагностика буллезного эпидермолиза 17

1.5 Ранозаживление, фиброз и рубцевание при буллезном эпидермолизе 19

1.6 Нарушения коллагена VII типа при дистрофическом буллезном эпидермолизе 20

1.7 Нарушение сети кератиновых филаментов при простом буллезном эпидермолизе 21

2. Разрабатываемые варианты терапии буллезного эпидермолиза 23

2.1 Белковая терапия 23

2.2 Клеточная терапия 24

2.3 Редактирование генома 24

3. Модельные системы буллезного эпидермолиза 25
4. Стратификация эпидермиса 25

5. Эквиваленты кожи 27

6. Иммортализация кератиноцитов 29

6.1 Существующие иммортализованные линии кератиноцитов 29

6.2 Системы иммортализации кератиноцитов 30

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 32
8.1 Методы генетического клонирования 32

8.1.1 Метод A/T-клонирования 32

8.1.1.1 Амплификация геномной ДНК 32

8.1.1.2 Лигирование 32

8.1.1.3 Химическая трансформация клеток E. coli и скрининг клонов 32

8.1.2 Клонирование гидовых РНК для Cas9 33

8.1.3 Анализ наличия инсерций и делеций 33

8.2 Методы культивирования эукариотических клеток 34

8.2.1 Общие методы культивирования эукариотических клеток 34

8.2.1.1 Используемые культуры 34

8.2.1.2 Заморозка клеток 34

8.2.2 Получение биопсий кожи и образцов крови 35

8.2.3 Выделение первичных фибробластов человека 35

8.2.4 Выделение первичных кератиноцитов человека 36

8.2.5 Условия культивирования использованных клеточных культур 36

8.2.5.1 Условия культивирования кератиноцитов 36

8.2.5.2 Условия культивирования фибробластов 36

8.2.5.3 Условия культивирования HaCaT 37

8.2.5.4 Условия культивирования HeLa и 3T3 37

8.2.6 Реконструкция эпидермиса человека in vitro 37

8.3 Методы генетической модификации культур клеток 38
8.3.1. Липофекция 38

8.3.2 Электропорация 38

8.3.3 Редактирование генома с помощью системы CRISPR/Cas9 39

8.3.4 Получение моноклональных линий клеток 39

8.3.5 Использованные в работе плазмиды 39

8.4 Пробоподготовка материалов эукариотических клеток 40

8.5 Методы цитологии и гистологии 41

8.5.1 Получение криосрезов 41

8.5.2 Окраска гематоксилин-эозином 41

8.5.3 Иммунохимическая окраска гистологических срезов 41

8.5.4 Иммуноцитохимическая окраска клеточных культур 42

8.5.5 Микроскопия 43

8.5.5.1 Световая микроскопия 43

8.5.5.2 Фазово-контрастная микроскопия 43

8.5.5.3 Флуоресцентная микроскопия 43

8.5.5.4 Конфокальная микроскопия 43

8.5.5.5 Анализ изображений 44

8.5.6 Проточная цитометрия и клеточный сортинг 44

8.5.7 Цитогенетический анализ 44

8.5.8 STR типирование 45

8.6 Функциональные тесты и процедуры для клеточных культур 45

8.6.1 Стрессовое воздействие на сеть кератиновых филаментов 45

8.6.2 Тест на ранозаживление 45

8.6.3 МТТ-тест 46

8.6.4 Оценка морфологии фибробластов и кератиноцитов 46

8.6.5 Полуколичественный анализ экспрессии при иммунофлуоресцентной окраске 46

8.6.6 Оценка контракции коллагенового геля фибробластами 47
8.6.7 Тест на туморогенность 47

8.6.8 Определение активности β-галактозидазы 47

8.6.9 Определение пролиферации 48

8.6.10 Вырезание hTERT с помощью Cre 48

8.6.11 Анализ на микоплазму 49

8.7 Статистический анализ 49

8.8 Программное обеспечение 50

РЕЗУЛЬТАТЫ 51
9.1 Получение и анализ модели буллезного эпидермолиза простого типа на базе линии
иммортализованных кератиноцитов человека HaCaT с помощью системы редактирования
генома CRISPR/Cas9 51

9.1.1 Геномное редактирование HaCaT и анализ полученных мутаций 51

9.1.2 Анализ нарушения сети кератиновых филаментов в клетках HaCaT 54

9.1.3 Исследование влияния фосфорилирования на агрегацию сети кератинов в клетках
HaCaT. 57

9.1.4 Миграционная активность клеток HaCaT, мутантных по кератину 5 59

9.2 Характеристика пациентов с рецессивным дистрофическим буллезным эпидермолизом 60

9.2.1. Описание экспериментального материала 60

9.2.2. Состояние здоровья и генетика РДБЭ пациентов 62

9.2.3. Анализ выявленных мутаций в гене col7a1 63

9.2.4 Экспрессия коллагена VII типа в коже РДБЭ пациентов 66

9.3 Реконструкция эпидермиса человека in vitro 68

9.4 Оценка иммортализации первичных кератиноцитов и фибробластов 69

9.4.1 Особенности использованных генетических конструкций 69

9.4.2 Иммуноцитохимический анализ экспрессии hTERT и BMI-1 в иммортализованных
линиях клеток 70

9.5 Характеристика первичных и иммортализованных фибробластов, полученных от
пациентов с рецессивным дистрофическим буллезным эпидермолизом 72
9.5.1 Характеристика линий фибробластов 72

9.5.2 Анализ экспрессии маркеров фибробластами 72

9.5.3 Анализ морфологии фибробластов 77

9.5.4 Анализ контракции коллагенового геля фибробластами 81

9.5.5 Анализ окрашивания фибробластов на ассоциированную со старением активность β-
галактозидазы 84

9.5.6 Анализ последствий Cre-опосредованного удаления трансгенов 85

9.6 Характеристика первичных и иммортализованных кератиноцитов полученных от
пациентов с рецессивным дистрофическим буллезным эпидермолизом 88

9.6.1 Характеристика линий кератиноцитов 88

9.6.2 Анализ экспрессии маркеров кератиноцитами 88

9.6.3 Анализ морфологии кератиноцитов 89

9.6.4 Анализ стратификации иммортализованных линий кератиноцитов in vitro 92

9.6.5 Определение пролиферативно-возрастного статуса кератиноцитов 94

9.6.6 Анализ туморогенности иммортализованных кератиноцитов in vivo 97

ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ 100
10.1 Моделирование буллезного эпидермолиза простого типа 100

10.2 Роль выявленных мутаций в структуре и функционировании гена col7a1 101

10.3 Свойства клеток, полученных от пациентов с рецессивным дистрофическим буллезным
эпидермолизом 102

10.4 Подтверждение иммортализации клеточных культур 104

10.5 Cre-опосредованное удаление трансгенов 105

10.6 Свойства иммортализованных кератиноцитов и их стратификация 106

ЗАКЛЮЧЕНИЕ 108
ВЫВОДЫ 111
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 112
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 117
ПРИЛОЖЕНИЕ 132

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ
Для внесения мутаций в ген krt5 линии клеток HaCaT использовали систему редактирования генома CRISPR/Cas9, включающую молекулярное клонирование, ПЦР, трансфекцию, клеточный сортинг, клонирование клеток, Т7E1 анализ, секвенирование. Для характеристики первичных и иммортализованных клеточных линий кератиноцитов и фибробластов использовали методы секвенирования, ПЦР, прижизненной фазово-контрастной микроскопии, иммунного окрашивания клеток и тканей, криотомии, классической гистологической окраски, светлопольной микроскопии, флуоресцентной микроскопии, конфокальной микроскопии, цейтраферной съемки, проточной цитометрии, цитогенетического анализа, STR-типирования, функционального анализа (осмотический и тепловой стрессы, ранозаживление, контракция коллагенового геля, стратификация в составе трехмерного эквивалента кожи, активность β-галактозидазы, опухолеобразование, скорость пролиферации) и компьютерной обработкой полученных изображений с помощью программного пакета FiJi с дальнейшей статистической обработкой полученных данных.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ
1. Получение и анализ модели буллезного эпидермолиза простого типа на базе линии иммортализованных кератиноцитов человека HaCaT с помощью системы редактирования генома CRISPR/Cas9
Для создания модели ПБЭ было решено внести мутации в экзон 7 гена krt5
в линии клеток HaCaT. После осуществления процедуры редактирования было проведено исследование мутаций в полученных клонах, а также исследованы проявления данных мутаций, характерные для кератиноцитов ПБЭ в культуре.
Из полученных библиотек клонов было выделено две линии: 2B4 содержала инсерцию в 19 п.н. за 2 кодона перед областью TYRKLLEGE; D7 являлась смешанной популяцией, состоящей из нескольких клонов. Среди них варианты, несущие инсерцию длиной 5 нуклеотидов и 1 нуклеотид в 7 экзоне гена krt5.
Обе линии демонстрировали агрегацию К5 в нормальных условиях культивирования (Рис. 1), а D7 также демонстрировал ускоренную миграцию в модели раны, что согласуется с данными относительно кератиноцитов с тяжелыми формами ПБЭ (Letai, 1993; Morley, 2003) и может быть следствием известной активации стресс-активируемых киназных путей в этих клетках.
Ингибирование киназ кофеином и связывание субстрата мутантной фосфотазой PTP1B привело к уменьшению количества агрегатов и снижению экспрессии К5. Так как фосфорилирование предотвращает убиквитинирование кератина, возможно, что снятие локального фосфорилирования, как защитного механизма, способствовало ускоренной деградации белка, вследствие чего экспрессия кератина могла быть снижена.
Рисунок 1. Иммуноцитохимическая окраска клеток HaCaT антителами против кератина 5 (зеленый) и DAPI (синий). WT – клетки HaCaT «дикого типа». 2B4 и D7 – мутантные клоны HaCaT. Конфокальная микроскопия.
2. Характеристика пациентов с рецессивным дистрофическим буллезным эпидермолизом
В работе использовали клетки от 4 пациентов с РДБЭ (д1-д4). Для них
были определены мутации и подтип заболевания (Табл. 1), а также выявлено нарушение распределения коллагена VII типа (C7) в коже (Рис. 2). Также в работе использовали клетки от 6 здоровых доноров (ФЗК1, иммФЗК1, ФЗК2, иммФЗК2, ФЗК3, ФЗК4, ФЗК5, КЗК5, иммКЗК5, КЗК8, иммКЗК8).
Таблица 1. Список пациентов с РДБЭ: пол, возраст, пациент-специфические клеточные линии, мутации, выявленные в гене col7a1, и подтип РДБЭ.
Пацие Форма РДБЭ нт
д1 генерализованный РДБЭ тяжелый
Пол/ Клеточные Мутация 1 Возр линии
аст
М/8 ФЭБ1 c.425A > G иммФЭБ1 (p.K142R)
Мутация 2
c.425A > G (p.K142R)
c.6205 C > T (p.R2069C)
c.8245G > A (p.G2749R)
нет данных *—Пробанд имел гетерозиготную мутацию c.1054C > T (p.R352C) в гене krt5.
3. Оценка иммортализации первичных кератиноцитов и фибробластов
Иммортализация линий ФЭБ и ФЗК, а также КЗК5, была достигнута за счет стабильной экспрессии кДНК hTERT. КЭБ и КЗК8 были иммортализованы сверхэкспрессией hTERT и BMI-1.
Иммортализация была подтверждена иммуноцитохимической окраской.
4. Характеристика первичных и иммортализованных фибробластов, полученных от пациентов с рецессивным дистрофическим буллезным эпидермолизом
4.1. Анализ экспрессии маркеров фибробластами
Микоплазмы и кросс-контаминации по данным тестов на микоплазму и STR- профилирования культур не было обнаружено. Цитогенетическое исследование подтвердило отсутствие хромосомных аберраций после 10 пассажей.
Для установления природы клеток и выявления различий здоровые и РДБЭ фибробласты проанализировали на экспрессию маркеров фибробластов: S100A4, трансгелина, коллагена IV типа, коллагена I типа, фибронектина, альфа- гладкомышечного актина (α-SMA), сегмента ED-A фибронектина (FN ED-A) и
ORPHA 79408 КЭБ1 иммКЭБ1
д2 инвертированный РДБЭ ORPHA 79409
д3* генерализованный РДБЭ тяжелый
М/16 ФЭБ2 c.682 + 1G > A иммФЭБ2
КЭБ2 иммКЭБ2
М/5 ФЭБ3 c.8245G > A иммФЭБ3 (p.G2749R)
ORPHA 79408 КЭБ3 иммКЭБ3
д4 генерализованный РДБЭ умеренный
М/21 ФЭБ4 иммФЭБ4
c.520G > A (p.G174R)
ORPHA 89842
8

С7. Клетки демонстрировали одинаковую экспрессию маркеров, за исключением C7, α-SMA и FN ED-A.
Метод полуколичественного сравнения данных ИЦХ применили для сравнения уровней экспрессии C7, αSMA и FN ED-A. Интенсивность окрашивания для C7 измеряли для ФЭБ (1–3) и ФЗК (1–4). Средние значения этих групп сравнивали с помощью вложенного t-теста. Результаты показывают, что клетки ФЭБ имеют сниженную интенсивность окрашивания C7 по сравнению с клетками ФЗК (p <0,001). Интенсивность окрашивания для α-SMA и FN ED-A измеряли для ФЭБ (1–4) и ФЗК1. Образцы сравнивали с использованием однофакторного дисперсионного анализа с использованием критерия Тьюки. Уровни экспрессии α-SMA и FN ED-A каждой линии ФЭБ были значимо (p <0,05) выше, чем у ФЗК. 4.2. Анализ морфологии фибробластов Мы предположили, что состояние РДБЭ и иммортализация могут отразиться на морфологии фибробластов в культуре. Для проверки гипотезы был произведен комплексный количественный анализ ряда морфологических параметров. Все первичные дермальные фибробласты имели нормальную веретенообразную морфологию. Для морфологического анализа измеряли от 43 до 127 клеток у каждой клеточной линии. Для сравнения ФЭБ и ФЗК использовали комбинированные данные морфологии из ФЭБ (1–4) и ФЗК1. Морфологические параметры сравнивали с помощью двухвыборочного t-теста. Данные проточной цитометрии с прямым рассеянием и боковым рассеянием сравнивали с помощью сравнения хи-квадрат FlowJo. ФЗК1 сравнивали с Рисунок 2. Иммуногистохимическое окрашивание криосрезов кожи. (A) Кожа здорового донора д6. (Б) Кожа пациента д2 с инвертированным РДБЭ. (В) Кожа пациента д3 с генерализованным тяжелым РДБЭ. (Г) Отрицательный контроль вторичных антител на срезе кожи. Зеленый канал - коллаген VII типа. Синий канал - ДНК (DAPI). Флуоресцентная микроскопия. дубликатами ФЭБ (1–4). Фоновый уровень T (x) был получен сравнением ФЗК1 с повтором ФЗК1 плюс ФЗК3 в двух экземплярах. Результаты показали, что ФЭБ в среднем имеют большую площадь, периметр, минимальную ось вписанного эллипса и минимальный диаметр, измеренный штангенциркулем. Кроме того, клетки ФЭБ оказались менее кругообразными и компактными. Не было обнаружено значимых различий в боковом светорассеянии (SSC) между комбинированными ФЭБ и ФЗК, но сравнение прямого светорассеяния (FSC) показало, что клетки ФЭБ в среднем больше чем ФЗК (T (x) = 868, фоновый уровень T (x) = 215). Аналогичным образом было исследовано влияние иммортализации на морфологию фибробластов. Несмотря на то, что некоторые клеточные линии демонстрируют различия в некоторых морфологических параметрах, нет четкой зависимости ни по одному параметру между морфологией и иммортализацией, поэтому можно сказать, что иммортализация не оказывает значительного влияния на морфологию фибробластов и сохраняет различия между ФЭБ и ФЗК. 4.3. Анализ контракции коллагенового геля фибробластами Было сделано предположение, что нарушение C7 приведет к изменению активности перестройки ВКМ фибробластами. Для проверки данной гипотезы был поставлен тест на скорость контракции коллагенового гидрогеля. Контракцию четырех коллагеновых гелей измеряли для каждой линии ФЭБ (1, 2, 3 и 4), иммФЭБ (1, 2, 3 и 4) и ФЗК1. Данные первичных клеток были объединены в две группы (ФЭБ и ФЗК) и сравнены с помощью теста Манна- Уитни. Было показано, что вызванная фибробластами контракция коллагена значимо выше в клетках ФЭБ по сравнению с клеточными линиями ФЗК (p<0,05). Сравнение с помощью теста Манна-Уитни первичных и иммортализованных клеток не показало значимых различий между ними в индуцированной фибробластами контракции коллагенового геля. 4.4. Анализ окрашивания фибробластов на ассоциированную со старением активность β-галактозидазы Для анализа влияния иммортализации на старение фибробластов первичные и иммортализованные пары фибробластов окрашивали X-gal для сравнения в них активности связанной со старением β-галактозидазы (SA-β-gal). Результаты показывают, что после иммортализации интенсивность окрашивания фибробластов становится ближе к первичным фибробластам от молодого донора и в большинстве случаев значимо ниже, чем в парных первичных клетках (Рис. 3). 4.5. Анализ последствий Cre-опосредованного удаления трансгенов Присутствие пары повторов LoxP в использованных для иммортализации ленти-плазмидах позволяет применять Cre-опосредованную сайт-направленную рекомбинацию для вырезания окруженной повторами вставки, то есть BMI-1, hTERT, а идущий за LoxP повторами флуоресцентный белок с ядерной локализацией TurboFP635NLS является индикатором прохождения рекомбинации. Чтобы проверить различия в экспрессии TurboFP635NLS в клетках до и после Cre-опосредованной рекомбинации, использовали временную трансфекцию этих клеток плазмидой pCre-eGFP. Популяция клеток с красными флуоресцентными ядрами появилась через сутки после трансфекции и стала доминирующей через несколько дней. Мы проверили старение клеток после удаления кассеты hTERT, сравнив их с первичными клетками. Чтобы получить более надежную и точную оценку старения, окрашивание на SA-β-gal было дополнено ИЦХ окраской на ki67. Эксперимент проводили на клетках иммФЭБ1 и иммФЭБ4 до и после трансфекции плазмидой, кодирующей рекомбиназу Cre. Была показала повышенная интенсивность окрашивания SA-βgal в клетках, трансфицированных Cre, которые получили визуальное свидетельство нокаута hTERT - появление красных флуоресцентных ядер после трансфекции. Процент клеток с красными флуоресцентными ядрами был подсчитан после нескольких раундов трансфекции Cre и составил 41% для иммФЭБ1 и 13% для иммФЭБ4. Пролиферацию иммФЭБ с красными флуоресцентными ядрами оценивали на основании окрашивания ИЦХ против ki67. ИммФЭБ1 и иммФЭБ4 с красными флуоресцентными ядрами показали сниженную пролиферацию по сравнению с ФЭБ и иммФЭБ без трансфекции Cre. Количество пассажей было 15 - для линии ФЭБ и 30 - для иммФЭБ, как с трансфекцией Cre, так и без нее. Рисунок 3. Окрашивание фибробластов на активность ассоциированной со старением β- галактозидазы (SA-β-gal). Наиболее интенсивно окрашенные клетки принимали за 100%. Звездочки (*) указывают на значимую разницу (p <0,05) между первичными и иммортализованными клеточными линиями при сравнении с использованием критерия Манна- Уитни. Среднее значение нормализованной интенсивности окрашивания и 95% доверительный интервал приведены для каждой клеточной линии. 3T3 (NIH) - положительный контроль. 5. Характеристика первичных и иммортализованных кератиноцитов полученных от пациентов с рецессивным дистрофическим буллезным эпидермолизом 5.1. Характеристика линий кератиноцитов Все культуры первичных кератиноцитов были проверены на наличие микоплазмы, и было выполнено STR профилирование. Микоплазмы и кросс- контаминации не было обнаружено. Цитогенетическое исследование подтвердило отсутствие хромосомных аберраций после 10 пассажей у всех линий, кроме иммКЗК5. В результате цитогенетического исследования в 100% клеток иммКЗК5 выявлен гипердиплоидный набор хромосом (модальное число хромосом 55–69) с множественными хромосомными аномалиями: дупликацией участков р31-р32, р12-р36, q25-q44 1-ой хромосомы, делеции участков q23-qter длинного плеча 3- ей хромосомы и q31-qter длинного плеча 7-ой хромосомы, дополнительные материалы неизвестного происхождения на р-плече 4- ой хромосомы и на q- плече 13-ой хромосомы, от 4-х до 8-и маркерных хромосом. Также, как и у других иммортализованных линий кератиноцитов, таких как NM1 и NIKs, у данной клеточной линии наблюдается трисомия 8 хромосомы (у HaCaT тетрасомия), увеличение числа генов которой, предположительно, ответственно за спонтанную иммортализацию кератиноцитов . 5.2. Анализ экспрессии маркеров кератиноцитами В связи с аномалиями хромосомного состава была изучена экспрессия маркеров кератиноцитов линией иммКЗК5. В результате ИЦХ окрашивания иммКЗК5 была выявлена экспрессия маркера базальных кератиноцитов – K14, причем в паттерне экспрессии К14 практически отсутствует сеть филаментов. Также клетки показывают отрицательную окраску по К5. Ранее сообщалось, что экспрессия этих кератинов является маркером онкотрансформации и оба кератина являются активными участниками сохранения способности к активной пролиферации, поэтому пути, способствующие трансформации полученных клеток еще предстоит выяснить в последующих работах. Клетки также имеют негативное окрашивание по К10 и транскрипционному фактору p63. 5.3. Анализ морфологии кератиноцитов Также, как и для фибробластов была выдвинута гипотеза, что состояние РДБЭ и иммортализация могут оказать влияние на морфологию кератиноцитов в культуре. В связи с чем, был проведен комплексный анализ морфологии клеток. КЗК5 перед процедурой иммортализации имели типичную для кератиноцитов морфологию “булыжной мостовой”. После лентивирусной трансдукции и селективного отбора в среде с антибиотиком в культуре появилась популяция клеток с измененной морфологией, они были меньше в диаметре, имели округлую форму и формировали небольшое число крупных отростков. После образования монослоя иммКЗК5 демонстрировали отсутствие контактного торможения. После нескольких пассажей данные клетки полностью вытеснили другие кератиноциты, образовав морфологически гомогенную популяцию, сохранившуюся на протяжении более 20 пассажей. В среде DMEM/F12 с сывороткой, содержащей более высокую концентрацию ионов кальция, чем среда CnT-07, используемая на первых этапах работы, произошло изменение морфологии и особенностей роста: клетки стали более распластанными, при этом, несмотря на продолжающийся рост, не образовывали монослоя, оставляя промежутки между островками клеток соединенными перешейками, а также обладали пониженной адгезией к пластику. Мы исследовали влияние иммортализации на морфологию кератиноцитов КЭБ1, КЭБ2 и КЗК8 от доноров д1, д2 и д12 соответственно. Для морфологического анализа было измерено от 193 до 455 клеток из каждой клеточной линии. Морфологические параметры первичных и иммортализованных клеток от одних и тех же доноров сравнивали с помощью двухвыборочного t-критерия. Данные проточной цитометрии FSC и SSC сравнивали с помощью критерия хи-квадрат FlowJo. На момент эксперимента иммортализованные клетки прошли на 12-18 пассажей больше, чем первичные. Статистически значимых различий по каким-либо морфологическим параметрам между линиями кератиноцитов при анализе морфологии в 2D культуре на фазово-контрастных изображениях не обнаружено. Данные проточной цитометрии показали, что во всех трех случаях иммортализованные клетки были немного меньше по FSC (T (x) = 651-1253, фоновый уровень T (x) = 10-46) и менее гранулярными по SSC (T (x) = 463-1518, фоновый уровень T (x) = 4-29), чем их первичные предшественники. Также было выявлено две популяции клеток по SSC в иммортализованных культурах и одна популяция в первичных культурах. Сравнение РДБЭ кератиноцитов со здоровым контролем не выявило различий как для первичных, так и для иммортализованных клеток (T (x) <354). 5.4. Анализ стратификации иммортализованных линий кератиноцитов in vitro Для проверки влияния иммортализации на способность кератиноцитов к дифференцировке, а также выявления различий между здоровым и РДБЭ эпидермисом, из полученных линий иммортализованных кератиноцитов были получены эквиваленты кожи по методике, разработанной ранее для первичных кератиноцитов. При создании РЭ иммКЗК5 ведут себя схожим образом вне зависимости от используемой среды. Они образуют пласт, состоящий из 15– 30 слоев клеток. Все клетки в пласте экспрессируют К14, а клетки в верхних слоях и отдельные клетки в толще экспрессируют К10 подобно клеткам HaCaT. При этом наблюдается нормальная экспрессия C7 в районе базального слоя. При реконструкции эпидермиса из иммКЭБ2 и иммКЗК8 в каждом случае был получен полностью стратифицированный эпидермис. Базальные и супрабазальные кератиноциты экспрессируют К14. Кератиноциты гранулярного слоя экспрессируют лорикрин и расположены рядом со слущивающимися клетками. Экспрессия плектина находится в основном вблизи базальной зоны. Окрашивание против C7 выявляет различия в уровне экспрессии. Линия иммКЭБ2 была получена из кератиноцитов кожи донора с инвертированной формой РДБЭ, для которых было показано остаточное количество белка C7 (Рис. 4). 5.5. Определение пролиферативно-возрастного статуса кератиноцитов Скорость пролиферации и активность SA-β-gal еще одни из показателей трансформации и старения клеточных культур, поэтому полученные линии кератиноцитов сравнили по данным параметрам. Было показано, что иммКЭБ1, иммКЗК8 и иммКЭБ2 имеют повышенную пролиферацию по сравнению с их первичным состоянием, что было показано с помощью EdU метки и проточной цитометрии. Скорость пролиферации иммортализованных клеток была на 20%, 16% и 13% выше для иммКЭБ1, иммКЭБ2 и иммКЗК8, соответственно, по сравнению с их первичными клетками. Также провели окрашивание первичных и иммортализованных кератиноцитов на активность SA-β-gal. Для каждой клеточной линии было проанализировано более четырех тысяч клеток. Было показано, что иммКЭБ1, иммКЗК8 и иммКЭБ2 увеличили, уменьшили или не изменили интенсивность окрашивания по сравнению с соответствующими первичными клетками. 5.6. Анализ туморогенности иммортализованных кератиноцитов in vivo Поскольку иммортализация работает с механизмами, часто задействованными в онкотрансформации, и для полученных иммортализованных линий кератиноцитов было показано изменение морфологии и скорости пролиферации, провели тест на способность иммортализованных кератиноцитов образовывать опухоли in vivo. Клетки трансплантировали в семенники иммунодефицитных мышей. У всех трех мышей контрольной группы с трансплантатами контрольных опухолевых клеток HeLa в течение 3-4 недель после операции образовались опухоли. Размер яичек достигал 3,2 см в диаметре, первичный анализ тканей показал наличие кист с жидкостью. Кроме того, подтвердили наличие морфологических изменений в тканях семенников с помощью окрашивания гематоксилин-эозином. Окрашивание на ядра человека методом ИГХ доказало, что именно клетки HeLa образуют опухоли. При трансплантации иммКЗК5 образовывали опухоли, в которых были обнаружены клетки, экспрессирующие теломеразу. Среди них присутствовали клетки, экспрессирующие К14 и K10, а также маркер поздней стратификации эпидермиса – лорикрин (Рис. 5). Также наблюдали большие тканевые образования без выраженных ядерных структур, но положительные при окраске антителами против материала ядер человека, что может быть следствием терминальной дифференцировки клеток в опухоли. Такая особенность в стратификации отмечалась исследователями ранее для спонтанно иммортализованной линии клеток кератиноцитов – HaCaT в условиях трансплантации иммунодефицитным мышам (Breitkreutz, 1998). Семенники с трансплантатами клеток иммКЭБ2 собирали через 10 недель после операции. Обследование показало, что семенники имеют нормальные размеры. Анализ тканей также не выявил структурных изменений органов. Небольшое количество живых клеток трансплантата было обнаружено при окрашивании на ядра человека. Рисунок 4. Иммуногистохимия реконструированного эпидермиса из иммКЭБ2 (инвертированный РДБЭ) и иммКЗК8. Ядра окрашены DAPI (синий). Маркеры (зеленые). Конфокальная микроскопия. Масштабный отрезок - 50 мкм. Гистограмма показывает интенсивность окрашивания C7 в базальном слое иммКЭБ по сравнению с иммКЗК8. Рисунок 5. ИГХ исследование среза семенника мыши после трансплантации в него иммКЗК5. Конфокальная микроскопия. Синий – ДНК (DAPI). Зеленый – человеческие ядра. Красный – кератин 14 (а), кератин 10 (б), лорикрин (в), теломераза (г). Белые стрелки указывают на клетки с тройным окрашиванием. ЗАКЛЮЧЕНИЕ Полученные мутантные линии HaCaT демонстируют свойства кератиноцитов ПБЭ в культуре, что указывает на адекватность полученных линий HaCaT как модели ПБЭ. Разработанная модель позволит в дальнейшем продолжить изучение особенностей формирования кератиновых агрегатов, влияния стрессовых условий и различных фармацевтических препаратов на их распределение в клетке, применение системы CRISPR/Cas9 позволит провести генетическую терапию введенных мутаций. Установление детальной колокализации кератиновых промежуточных филаментов с PTP1B требует проведения новых экспериментов и использования микроскопии более высокого разрешения. Детализация потенциальных мишеней фосфорилирования в сети промежуточных филаментов К5 позволит приблизиться к пониманию роли сигнальных путей в ее формировании и реорганизации и, основываясь на этом, разработать возможный вариант лечения. Были выявлены и подтверждены мутации четырех пациентов с РДБЭ. Полученные данные расширяют знания относительно распространенности мутаций в популяции, а также демонстрируют случаи комбинации нескольких мутаций в рамках одного генома, что демонстрирует важность исследования генома для установления причин заболевания. Исследование выявило присутствие, в случае гомозиготной мутации c.425A>G, наличие последовательности PAM рядом с областью мутации, что потенциально может быть использовано в разработке генной терапии данного типа мутаций с помощью системы редактирования генома CRISPR/Cas9.
Как для фибробластов, так и для кератиноцитов полученных от пациентов с РДБЭ было показано значительное снижение экспрессии С7, но не полное его отсутствие. Тот факт, что на ИЦХ и в клеточных лизатах обнаруживались мишени связывания антител против наиболее иммунореактивной части C7 свидетельствует о том, что данные пациенты могут быть иммунотолерантны к введению здорового C7 в организм, что открывает широкие возможности относительно доступных для них вариантов терапии.
У фибробластов, полученных от пациентов с РДБЭ было обнаружено присутствие миофибробластов и черт характерных для стареющих клеток, что
указывает на наличие воспалительных и фиброзных процессов в коже. При этом признаков онкотрансформации обнаружено не было. Полученные данные указывают на вклад процессов воспаления и фиброза в приобретение фенотипа РДБЭ. Дальнейшие исследования данного направления могут открыть новые способы коррекции симптомов и улучшения состояния пациентов с РДБЭ не связанные напрямую с исправлением структурной составляющей заболевания.
Путем трансформации первичных кератиноцитов человека от здорового донора с помощью hTERT получена новая стабильная клеточная линия. Данная клеточная линия может стать ценным инструментом во многих исследованиях, связанных с изучением механизмов межклеточных взаимодействий, опухолеобразования и клеточной дифференцировки.
Получены новые стабильные клеточные линии из фибробластов и кератиноцитов полученных от пациентов с РДБЭ. Морфологические и функциональные тесты иммортализованных клеточных линий подтвердили фенотипы, сходные с фенотипами первичных клеток, для панелей фибробластов и кератиноцитов. Новые иммортализованные hTERT и BMI-1 линии кератиноцитов, как нормальные, так и РДБЭ, были способны образовывать in vitro многослойные стратифицированные эпидермальные эквиваленты с адекватным распределением маркеров дифференцировки. Новые иммортализованные панели клеточных линий полезны для замены первичных клеточных линий, тем самым представляя биологическую релевантную модель для исследования in vitro процессов, участвующих в развитии РДБЭ.
ВЫВОДЫ
1. Получена новая модель ПБЭ с мутациями в экзоне 7 гена krt5, демонстрирующая свойства кератиноцитов ПБЭ, а именно агрегацию кератиновой сети и ее зависимость от фосфорилирования, а также увеличение скорости миграции при зарастании раны.
2. Получено 4 новых линии фибробластов и 2 линии кератиноцитов от пациентов с ВБЭ, для которых были выявлены мутации (в т.ч. новые) приводящие к фенотипу РДБЭ. Характеристика данных линий привела к обнаружению сниженной, но не отсутствующей экспрессии C7 во всех линиях, а также фиброзного и стареющего фенотипа фибробластов без признаков онкотрансформации.
3. Подтверждена иммортализация новых линий кератиноцитов и фибробластов от пациентов с РДБЭ и здоровых доноров. Иммортализация фибробластов hTERT, а кератиноцитов hTERT и BMI-1 не оказывает существенного влияния на морфологию клеток и экспрессию клетками специфических белковых маркеров. Также не обнаружено приобретение данными клетками туморогенных свойств. Однако, иммортализация линии здоровых кератиноцитов hTERT привела к получению новой клеточной линии с множеством аберраций хромосомного состава, измененными морфологией, экспрессией маркеров, ростом в культуре и составе РЭ, а также проявляющей туморогенные свойства.
4. Cre-опосредованное удаление hTERT в линиях иммортализованных фибробластов приводит к восстановлению в них части свойств первичных клеток.
5. Получена модель ороговевающего эпидермиса человека in vitro как из первичных кератиноцитов, так и из иммортализованных. При этом РЭ из кератиноцитов иммортализованных hTERT и BMI-1 не имел существенных отличий от РЭ из первичных клеток. РЭ из кератиноцитов РДБЭ демонстрировал пониженную экспрессию С7.

Актуальность и современное состояние проблемы
Врожденный буллезный эпидермолиз (ВБЭ) – это группа тяжелых наследственных
генодерматозов. Лечение ВБЭ в настоящее время носит лишь симптоматический характер [1]. В
то же время генетический характер заболеваний и современное развитие генно-инженерных и
клеточных технологий требует от исследователей в области регенеративной медицины
разработки современных модельных систем для изучения патогенеза и создания методов
специфического воздействия на мутации. Это свидетельствует об актуальности и
фундаментальной значимости проблемы, лежащей в основе исследования, и подходов к
изучению механизмов ВБЭ на основе клеточного моделирования.
В России молекулярно-генетический анализ мутаций, определяющих развитие ВБЭ,
проводится мало, нет официальной статистики по распространенности разных типов
заболевания, в то время как на фоне общей гетерогенности популяций и этнического
разнообразия существует, по всей видимости, обширное разнообразие генетических мутаций. В
настоящее время во всем мире создаются базы данных, содержащие информацию о мутациях, их
наследовании и патогенезе. Изучение особенностей мутационного разнообразия ВБЭ может
существенным образом расширить имеющиеся мировые базы данных. Например, по данным
исследования, проведенного в Краснодарском крае, частота встречаемости простых и
дистрофических с полидиспластическими форм буллезного эпидермолиза за последние 10 лет
увеличилась, в 2 и 7 раз, соответственно, в сравнении с данными предыдущих исследований [2;
3], что, однако, может быть связано с улучшением учета пациентов и диагностики.
Основным методами диагностики ВБЭ являются иммунофлюоресцентное картирование
антигенов (ИКА) и просвечивающая электронная микроскопия (ПЭМ), определяющие основной
поврежденный белок и уровень образования пузырей в коже [4; 5]. Однако быстрое развитие
методов высокопроизводительного секвенирования позволяет надеяться на то, что в будущем
генетический анализ с определением типа мутации, ее локализации и типа наследования станет
доступным для медицинской практики не только за рубежом, но и на территории России. Из
опубликованных данных известно, что в результате секвенирования может быть уточнен или
даже изменен диагноз, например, в сложных случаях смешанных форм ВБЭ [6].
Помимо диагностики и развития методов функциональной терапии существует проблема
недостаточной изученности клеточных механизмов, тех искажений в нормальном
функционировании каскадов реакций в клетках, которые возникают в результате мутаций ВБЭ.
Больные ВБЭ часто оказываются подвержены онкологическим заболеваниям кожи, для
некоторых форм ВБЭ – это карцинома кожи, встречаются меланомы и плоскоклеточный рак. Для
простой формы ВБЭ показана связь между нарушениями в кератиновой сети и способностью
клеток к апоптозу – мутации в генах кератинов приводят к искажению в ответе клетки на
повреждения ДНК, активации в клетках экспрессии анти-апоптотических генов [7]. Для
дистрофической формы ВБЭ влияние некоторых ключевых факторов в этом процессе лишь
предполагается, но еще не показано или изучено недостаточно, в частности активация TGF-β
(transforming growth factor beta) сигнального пути [8]. Больные с этим типом заболевания имеют
наиболее тяжелые клинические проявления и часто страдают от возникновения
плоскоклеточного рака кожи. Молекулярные механизмы, приводящие к предрасположенности
клеток к онкологической трансформации, также недостаточно изучены.

Цели и задачи исследования
Целью исследования являлось создание новых клеточных моделей ВБЭ,
воспроизводящих основные структурно-функциональные особенности кожи пациентов с ВБЭ,
что необходимо для разработки новых подходов к лечению, в частности с использованием
редактирования генома клеток пациентов.
Задачи:
1. Разработать и охарактеризовать модель простого буллезного эпидермолиза (ПБЭ) на базе
клеточной линии HaCaT с использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9.
2. Получить и провести характеристику первичных культур фибробластов и кератиноцитов
от пациентов с дистрофическим буллезным эпидермолизом (ДБЭ).
3. Охарактеризовать полученные иммортализованные линии фибробластов и кератиноцитов
в качестве модельных объектов.
4. Создать и охарактеризовать трехмерные модели кожи на основе полученных
иммортализованных линий кератиноцитов и фибробластов и подтвердить
воспроизведение структурно-функциональных особенностей кожи ДБЭ.
Научная новизна исследования
Была получена и охарактеризована новая модель ПБЭ на базе клеточной линии HaCaT с
использованием системы редактирования генома CRISPR/Cas9. Получены и охарактеризованы
новые клеточные линии от пациентов с ДБЭ, несущие уникальные мутации. Были
охарактеризованы новые иммортализованные линии кератиноцитов, полученные с помощью
новых методов иммортализации, которые позволили сохранить свойства клеток близкими к
первичным, что позволит использовать данные клеточные линии как замену первичным
кератиноцитам в модельных системах. Были получены новые трехмерные модели кожи,
моделирующие ВБЭ, в том числе из иммортализованных клеток.

Практическая значимость
Полученные в работе модели ВБЭ позволяют обойти ограничения и недостатки,
связанные с первичными культурами клеток [9–11] и животными моделями [12] ВБЭ в контексте
изучения механизмов заболевания и разработки новых видов терапии. На данных моделях
возможно тестирование различных новых методов лечения ВБЭ, таких как воздействие
низкомолекулярных веществ [13], ретровирусной терапии [14; 15], терапии с использованием
аденоассоциированных вирусов [16], генетического редактирования [17], транс-сплайсинга РНК
[18].
Полученные клеточные линии c возможностью к обратимой иммортализации [19] могут
быть использованы в качестве альтернативы индуцированным плюрипотентным стволовым
клеткам (иПСК) для генетической модификации и создания клеточного продукта для
аутологичной трансплантации, что ранее было применено для клеток предшественников
миобластов [20].

Положения, выносимые на защиту
1. Внесенные генетические изменения в клетки HaCaT с помощью системы редактирования
генома CRISPR/Cas9 моделируют клеточные процессы, наблюдаемые при ПБЭ.
2. Кератиноциты и фибробласты, полученные от пациентов с РДБЭ, отличаются от здоровых
клеток по экспрессии специфических маркеров и морфологии.
3. Полученные иммортализованные линии кератиноцитов и фибробластов от пациентов с РДБЭ
и здоровых доноров не имеют существенных отличий от первичных культур и сохраняют
особенности, характерные для клеток РДБЭ.
Методы исследования
Для внесения мутаций в ген krt5 использовали систему редактирования генома
CRISPR/Cas9, включающую молекулярное клонирование, полимеразную цепную реакцию
(ПЦР), трансфекцию, клеточный сортинг, клонирование клеток, Т7E1 анализ, секвенирование.
Для характеристики первичных и иммортализованных клеточных линий использовали методы
секвенирования, ПЦР, прижизненной фазово-контрастной микроскопии, иммунного
окрашивания клеток и тканей, криотомии, классической гистологической окраски,
светлопольной микроскопии, флуоресцентной микроскопии, конфокальной микроскопии,
цейтраферной съемки, проточной цитометрии, цитогенетического анализа, STR-типирования,
функционального анализа (осмотический и тепловой стрессы, ранозаживление, контракция
коллагенового геля, стратификация в составе трехмерного эквивалента кожи, активность β-
галактозидазы, опухолеобразование, скорость пролиферации) и компьютерной обработкой
полученных изображений с помощью программного пакета FiJi с дальнейшей статистической
обработкой полученных данных.

Степень достоверности и апробация работы
Достоверность полученных результатов обеспечивается использованием
стандартизированных методик и протоколов, качественных реактивов и материалов. Все
эксперименты проведены со всеми надлежащими техническими контролями и биологическими
повторами. Полученные данные обрабатывались соответствующими статистическими методами.
Основные материалы, изложенные в диссертации, были доложены и обсуждены на 8
конференциях:
1. A.K. Beilin, N.V. Andreeva, N.G. Gurskaya, E.A. Vorotelyak. Development of a model system
for epidermolysis bullosa simplex in HaCaT cells by mutagenesis of keratin 5 with
CRISPR/cas9 technology. The second international conference “Cell technologies at the edge:
from research to practice” (CTERP) “Translational research in cell therapy”. Москва, 13
апреля 2018 г.
2. Н.В. Андреева, А.К. Бейлин. Создание модели болезни буллезного эпидермолиза
простого типа на культуре клеток HaCaT. Международная (XXII Всероссийская)
Пироговская научная медицинская конференция студентов и молодых ученых. Москва,
15 марта 2018 г.
3. Н.В. Андреева, Н.Г. Гурская, А.К. Бейлин, Е.А. Воротеляк. Создание модели болезни
буллезный эпидермолиз простого типа на культуре клеток HaCaT с использованием
системы редактирования генома CRISPR/Cas9. Международный конгресс CRISPR‑2018.
Новосибирск, 10–14 сентября 2018 г.
4. Nadya G.Gurskaya, Arkady K Beilin, Natalya V Andreeva, Ekaterina A Vorotelyak. Modelling
epidermolysis bullosa simplex with CRISPR/Cas9 system. Cold Spring Harbor Laboratory
Meetings& Courses Program, Genome engineering: the CRISPR-Cas revolution. Нью-
Йорк, США, 22-25 августа 2018 г.
5. A. Beilin, N. Gurskaya, E. Vorotelyak. Establishing a model of epidermolysis bullosa simplex
via CRISPR/Cas9 editing in HaCaT cells. 44th FEBS Congress. Краков, Польша, 6–11 июля
2019 г.
6. A Beilin, N Evtushenko, N Murashkin, K Savostyanov, A Fisenko, E Ambarchian, E
Vorotelyak and N Gurskaya. The new cell cultures from dystrophic epidermolysis bullosa
patients in Russia. ESDR 2019 Annual Meeting. Бордо, Франция, 18 – 21 сентября 2019 г.
7. Н. Гурская, А. Бейлин, Н. Евтушенко, К. Азимов, Н. Мурашкин, К. Савостьянов, Э.
Амбарчян, А. Фесенко, Е. Воротеляк, А. Васильев. Новые подходы к терапии
врожденного буллезного эпидермолиза (вбэ): получение пациент-специфических
клеточных линий, несущих мутации в гене, кодирующим col7a1, перспективы
использования модельных систем для изучения механизмов заболевания и генетической
терапии. II объединенный научный форум VI съезд физиологов СНГ VI съезд
биохимиков россии IX российский симпозиум «белки и пептиды». Сочи, 1–6 октября
2019 г.
8. N.G.Gurskaya A.Beilin N.Evtushenko E.Vorotelyak. Inherited epidermolysis bullosa: creation
a desease model with CRISPR/Cas9 system. European Biotechnology Congress 2019. Прага,
Чехия, 15 ноября 2019 г.
Перечень публикаций
По материалам диссертации опубликовано 12 печатных работ, из них 4 статьи
опубликованы в рецензируемых научных изданиях, входящих в международные реферативные
базы данных и систем цитирования (WoS, Scopus) и соответствуют Перечню ВАК, тезисов
докладов и материалов конференций 8.
Список публикаций:
1. Бейлин А.К., Гурская Н.Г., Воротеляк Е.А. Методы генной терапии для лечения
врожденного буллезного эпидермолиза // Вестник Московского университета. Серия 16:
Биология. 2018. Т. 73. № 4. С. 233-241. DOI: 10.3103/S0096392518040016
2. Бейлин А.К., Гурская Н.Г., Евтушенко Н.А., Алпеева Е.В., Косых А.В., Терских В.В.,
Васильев А.В., Воротеляк Е.А. Иммортализация кератиноцитов человека с помощью
каталитической субъединицы теломеразы // Доклады Российской Академии Наук. Науки
О Жизни. – 2021. – Т. 496. – № 1. DOI: 10.31857/S2686738921010042
3. Beilin, A.K.; Evtushenko, N.A.; Lukyanov, D.K.; Murashkin, N.N.; Ambarchian, E.T.; Pushkov,
A.A.; Savostyanov, K.V.; Fisenko, A.P.; Rogovaya, O.S.; Vasiliev, A.V.; Vorotelyak, E.A.;
Gurskaya, N.G. Signatures of dermal fibroblasts from RDEB pediatric patients // Int. J. Mol. Sci.
2021, 22, 1792. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms22041792
4. Nadezhda A. Evtushenko, Arkadii K. Beilin, Erdem B. Dashinimaev, Rustam H. Ziganshin,
Anastasiya V. Kosykh, Maxim M. Perfilov, Alexandra L. Rippa, Elena V. Alpeeva, Andrey V.
Vasiliev, Ekaterina A. Vorotelyak and Nadya G. Gurskaya. hTERT-driven immortalization of
RDEB fibroblast and keratinocyte cell lines followed by Cre-mediated transgene elimination //
Int. J. Mol. Sci. 2021, 22(8), 3809. DOI: https://doi.org/10.3390/ijms22083809
Личный вклад автора
Формирование общего направления исследований в выбранной тематике работы, выбор
моделей и методов исследования, руководство проведением экспериментальных работ
осуществлялись Гурской Н.Г. и Воротеляк Е.А. Дизайн экспериментов по иммортализации
клеточных линий дермальных фибробластов и кератиноцитов разработан Гурской Н.Г.
Культивирование клеток HaCaT, проведение процедуры редактирования и селекция
мутантных клонов проводились совместно с Евтушенко Н.А. Эксперименты с фосфатазой PTP1B
проводились совместно с Петрусенко Ю.С. Анализ скорости заживления раны, МТТ-тест,
эксперименты со стрессом сети кератинов и воздействием кофеина, иммуноцитохимическая
окраска и микроскопия клеток HaCaT проводились лично автором.
Работа с пациентами, получение биопсий кожи и образцов крови осуществлялись в
НМИЦ Здоровья детей Амбарчаном Э.Т. Секвенирование осуществляли Савостьянов К.В.,
Фисенко А.П. и Евтушенко Н.А. Анализ FASTQ для пациентов д1, д2 и д3 был выполнен
Савостьяновым К.В. в НМИЦ Здоровья детей, анализ других FASTQ проводился Гурской Н.Г.
Иммунофлуоресцентный анализ (криотомия, окраска и микроскопия) биопсий кожи пациентов и
здоровых доноров производился лично автором.
Выделение культур первичных дермальных фибробластов и кератиноцитов
производилось совместно с Евтушенко Н.А. Селекция и культивирование иммортализованных
клеток после трансдукции проводились совместно с Евтушенко Н.А. Разработка протоколов
культивирования и криоконсервации кератиноцитов была осуществлена лично автором. Анализ
экспрессии маркеров, анализ морфологии клеток, определение контракционной активности
клеток, количественный анализ активности SA-β-gal, анализ пролиферативной активности,
клеточный сортинг и проточная цитометрия, микроскопия (световая, фазово-контрастная,
флуоресцентная, конфокальная и цейтраферная съемка) осуществлялись лично автором.
Разработка протокола и получение эквивалентов кожи, а также иммунофлуоресцентный
анализ (криотомия, окраска и микроскопия) осуществлялся лично автором.
Иммуногистохимический анализ, классическая гистология и световая микроскопия эквивалентов
кожи производились совместно с Риппой А.Л.
Трансплантация клеток в семенники мышей проводилась совместно с Роговой О.С.,
Косых А.В. и Гурской Н.Г. Иммунофлуоресцентный анализ опухолей (криотомия, окраска и
микроскопия) осуществлялись лично автором.
Пробоподготовка к цитогенетическому анализу и STR-профилированию, а также
определение наличия микоплазмы осуществлялись в Коллекции клеточных культур ИБР РАН.
Методы количественного анализа морфологии фибробластов и кератиноцитов на фазово-
контрастных микроскопических изображениях и количественной оценки активности β-
галактозидазы на световых микроскопических изображениях были разработаны лично автором.
Анализ микроскопических изображений производился лично автором. Статистический анализ
данных и подготовка изображений осуществлялись лично автором.
Все разделы диссертации были написаны лично автором или при его непосредственном
участии. Правка осуществлялась Воротеляк Е.А. и Гурской Н.Г.

Структура и объем диссертации
Текст диссертации приведен на 131 странице, содержит 32 рисунка, 3 таблицы и
дополнен 1 приложением. В работе процитированы 246 литературных источника.

Заказать новую

Лучшие эксперты сервиса ждут твоего задания

от 5 000 ₽

Не подошла эта работа?
Закажи новую работу, сделанную по твоим требованиям

    Нажимая на кнопку, я соглашаюсь на обработку персональных данных и с правилами пользования Платформой

    Читать

    Читать «Моделирование структурно-функциональных особенностей кожи пациентов с врожденным буллезным эпидермолизом с использованием пациент-специфических клеток»

    Помогаем с подготовкой сопроводительных документов

    Совместно разработаем индивидуальный план и выберем тему работы Подробнее
    Помощь в подготовке к кандидатскому экзамену и допуске к нему Подробнее
    Поможем в написании научных статей для публикации в журналах ВАК Подробнее
    Структурируем работу и напишем автореферат Подробнее

    Хочешь уникальную работу?

    Больше 3 000 экспертов уже готовы начать работу над твоим проектом!

    Шагали Е. УрГЭУ 2007, Экономика, преподаватель
    4.4 (59 отзывов)
    Серьезно отношусь к тренировке собственного интеллекта, поэтому постоянно учусь сама и с удовольствием пишу для других. За 15 лет работы выполнила более 600 дипломов и... Читать все
    Серьезно отношусь к тренировке собственного интеллекта, поэтому постоянно учусь сама и с удовольствием пишу для других. За 15 лет работы выполнила более 600 дипломов и диссертаций, Есть любимые темы - они дешевле обойдутся, ибо в радость)
    #Кандидатские #Магистерские
    76 Выполненных работ
    Татьяна П. МГУ им. Ломоносова 1930, выпускник
    5 (9 отзывов)
    Журналист. Младший научный сотрудник в институте РАН. Репетитор по английскому языку (стаж 6 лет). Также знаю французский. Сейчас занимаюсь написанием диссертации по и... Читать все
    Журналист. Младший научный сотрудник в институте РАН. Репетитор по английскому языку (стаж 6 лет). Также знаю французский. Сейчас занимаюсь написанием диссертации по истории. Увлекаюсь литературой и темой космоса.
    #Кандидатские #Магистерские
    11 Выполненных работ
    Ольга Р. доктор, профессор
    4.2 (13 отзывов)
    Преподаватель ВУЗа, опыт выполнения студенческих работ на заказ (от рефератов до диссертаций): 20 лет. Образование высшее . Все заказы выполняются в заранее согласован... Читать все
    Преподаватель ВУЗа, опыт выполнения студенческих работ на заказ (от рефератов до диссертаций): 20 лет. Образование высшее . Все заказы выполняются в заранее согласованные сроки и при необходимости дорабатываются по рекомендациям научного руководителя (преподавателя). Буду рада плодотворному и взаимовыгодному сотрудничеству!!! К каждой работе подхожу индивидуально! Всегда готова по любому вопросу договориться с заказчиком! Все работы проверяю на антиплагиат.ру по умолчанию, если в заказе не стоит иное и если это заранее не обговорено!!!
    #Кандидатские #Магистерские
    21 Выполненная работа
    Антон П. преподаватель, доцент
    4.8 (1033 отзыва)
    Занимаюсь написанием студенческих работ (дипломные работы, маг. диссертации). Участник международных конференций (экономика/менеджмент/юриспруденция). Постоянно публик... Читать все
    Занимаюсь написанием студенческих работ (дипломные работы, маг. диссертации). Участник международных конференций (экономика/менеджмент/юриспруденция). Постоянно публикуюсь, имею высокий индекс цитирования. Спикер.
    #Кандидатские #Магистерские
    1386 Выполненных работ
    Яна К. ТюмГУ 2004, ГМУ, выпускник
    5 (8 отзывов)
    Помощь в написании магистерских диссертаций, курсовых, контрольных работ, рефератов, статей, повышение уникальности текста(ручной рерайт), качественно и в срок, в соот... Читать все
    Помощь в написании магистерских диссертаций, курсовых, контрольных работ, рефератов, статей, повышение уникальности текста(ручной рерайт), качественно и в срок, в соответствии с Вашими требованиями.
    #Кандидатские #Магистерские
    12 Выполненных работ
    Катерина В. преподаватель, кандидат наук
    4.6 (30 отзывов)
    Преподаватель одного из лучших ВУЗов страны, научный работник, редактор научного журнала, общественный деятель. Пишу все виды работ - от эссе до докторской диссертации... Читать все
    Преподаватель одного из лучших ВУЗов страны, научный работник, редактор научного журнала, общественный деятель. Пишу все виды работ - от эссе до докторской диссертации. Опыт работы 7 лет. Всегда на связи и готова прийти на помощь. Вместе удовлетворим самого требовательного научного руководителя. Возможно полное сопровождение: от статуса студента до получения научной степени.
    #Кандидатские #Магистерские
    47 Выполненных работ
    Елена Л. РЭУ им. Г. В. Плеханова 2009, Управления и коммерции, пре...
    4.8 (211 отзывов)
    Работа пишется на основе учебников и научных статей, диссертаций, данных официальной статистики. Все источники актуальные за последние 3-5 лет.Активно и уместно исполь... Читать все
    Работа пишется на основе учебников и научных статей, диссертаций, данных официальной статистики. Все источники актуальные за последние 3-5 лет.Активно и уместно использую в работе графический материал (графики рисунки, диаграммы) и таблицы.
    #Кандидатские #Магистерские
    362 Выполненных работы
    Сергей Е. МГУ 2012, физический, выпускник, кандидат наук
    4.9 (5 отзывов)
    Имеется большой опыт написания творческих работ на различных порталах от эссе до кандидатских диссертаций, решения задач и выполнения лабораторных работ по любым напра... Читать все
    Имеется большой опыт написания творческих работ на различных порталах от эссе до кандидатских диссертаций, решения задач и выполнения лабораторных работ по любым направлениям физики, математики, химии и других естественных наук.
    #Кандидатские #Магистерские
    5 Выполненных работ
    Юлия К. ЮУрГУ (НИУ), г. Челябинск 2017, Институт естественных и т...
    5 (49 отзывов)
    Образование: ЮУрГУ (НИУ), Лингвистический центр, 2016 г. - диплом переводчика с английского языка (дополнительное образование); ЮУрГУ (НИУ), г. Челябинск, 2017 г. - ин... Читать все
    Образование: ЮУрГУ (НИУ), Лингвистический центр, 2016 г. - диплом переводчика с английского языка (дополнительное образование); ЮУрГУ (НИУ), г. Челябинск, 2017 г. - институт естественных и точных наук, защита диплома бакалавра по направлению элементоорганической химии; СПХФУ (СПХФА), 2020 г. - кафедра химической технологии, регулирование обращения лекарственных средств на фармацевтическом рынке, защита магистерской диссертации. При выполнении заказов на связи, отвечаю на все вопросы. Индивидуальный подход к каждому. Напишите - и мы договоримся!
    #Кандидатские #Магистерские
    55 Выполненных работ

    Последние выполненные заказы

    Другие учебные работы по предмету

    Экспрессия нейротрофинов в новой коре крыс и их цитопротективные эффекты при фокальной церебральной ишемии
    📅 2022 год
    🏢 ФГБОУ ВО «Тихоокеанский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
    Морфофункциональная характеристика мужских половых желез потомства самок крыс с экспериментальным сахарным диабетом 1 типа
    📅 2022 год
    🏢 ФГБОУ ВО «Оренбургский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
    Морфофункциональная характеристика большого сальника при опухолевом поражении яичников
    📅 2022 год
    🏢 ФГБОУ ВО «Оренбургский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
    Реорганизация гиппокампа белых крыс после 20-минутной окклюзии общих сонных артерий
    📅 2021 год
    🏢 ФГБОУ ВО «Новосибирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
    Морфология орбитальной культи, сформированной с применением никелида титана и аутологичных мононуклеарных клеток крови
    📅 2021 год
    🏢 ФГБОУ ВО «Сибирский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации