Новые подходы к получению некоторых люминесцентных и плазмонных меток для иммуноанализа: возможности и ограничения
ОГЛАВЛЕНИЕ
СПИСОК УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ И СОКРАЩЕНИЙ
ВВЕДЕНИЕ
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Углеродные наноструктуры
1.1.1. Методы синтеза сверху-вниз
1.1.2. Методы синтеза снизу-вверх
1.1.3. Фракционирование углеродных наноструктур
1.1.4. Применение УНС в иммунохимическом анализе
1.2. Наночастицы золота
1.2.1. Функционализация поверхности наночастиц золота
1.2.2. Применение наночастиц золота в иммунохимическом анализе
ГЛАВА 2. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ
2.1. Реагенты и материалы
2.2 Оборудование
2.3. Методики проведения экспериментов
ГЛАВА 3. СИНТЕЗ УГЛЕРОДНЫХ НАНОСТРУКТУР НА ОСНОВЕ ДЕКСТРАН СУЛЬФАТА НАТРИЯ
3.1. Гидротермальный синтез УНС на основе декстран сульфата натрия
3.2. Фракционирование УНС на основе декстран сульфата натрия, полученных гидротермальным методом
ГЛАВА 4. СИНТЕЗ УГЛЕРОДНЫХ НАНОСТРУКТУР ИЗ ЛИМОННОЙ КИСЛОТЫ И 1,2-ЭТИЛЕНДИАМИНА
4.1. Получение УНС из лимонной кислоты и 1,2-этилендиамина
4.2. Получение и характеристика конъюгатов УНС со вторичными антителами
ГЛАВА 5. РАЗРАБОТКА ПОДХОДА ДЛЯ СИНТЕЗА БИОТИНИЛИРОВАННЫХ НАНОЧАСТИЦ ЗОЛОТА И ДЕТЕКТИРОВАНИЯ С–РЕАКТИВНОГО БЕЛКА ЧЕЛОВЕКА ИММУНОХИМИЧЕСКИМ МЕТОДОМ
5.1. Разработка метода одностадийной модификации ЗНЧ биотином
5.2. Взаимодействие ЗНЧ@биотин со стрептавидином
3
5.3. Определение аналитических параметров для разработанного иммунохимического анализа
5.4. Определение СРБ в образцах плазмы крови человека
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ
Во Введении обоснована актуальность проведенных исследований, сформулированы основные цели и задачи, описана научная новизна и практическая значимость полученных результатов, а также сформулированы основные положения, выносимые на защиту.
В Главе 1 представлен критический обзор литературных данных, описывающий последние достижения в области синтеза, фракционирования и применения УНС. Подробно рассмотрены свойства ЗНЧ, подходы к их получению и модификации. Приведены основные преимущества и недостатки исследуемых наноструктур, устранение которых составило основу данной диссертационной работы. Представлена общая информация о подходах конъюгации УНС и ЗНЧ с антителами, подробно описаны характеристики конъюгатов и пути их применения.
В Главе 2 собраны исчерпывающие сведения об использованных реагентах и материалах для экспериментальной части научного исследования. Подробно описаны методики синтеза УНС, их очистки и фракционирования, а также конъюгации с антителами. Представлены методики синтеза ЗНЧ, одноэтапно модифицированных биотином, подходы к созданию меток на основе ЗНЧ@биотин:стрептавидин со специфическими антителами, проведения иммуноанализа и расчета аналитических характеристик.
Глава 3 посвящена синтезу УНС из ДСН ГТ методом с целью оптимизации подхода для получения стабильных и ярких УНС для их последующего аналитического применения.
Одним из важнейших
параметров при синтезе УНС ГТ
методом в автоклаве является
температура синтеза. В целях
оптимизации свойств УНС был исследован температурный интервал нагрева 160- 300oС, а также продолжительность гидротермальной обработки – 1-6 часов при постоянной концентрации ДСН – 7 мг/мл.
Показано, что увеличение температуры синтеза УНС (при постоянном времени нагрева – 3 часа) приводит к значительному сдвигу максимумов поглощения (рис. 1А) и люминесценции (рис. 1Б) в более длинноволновую область спектра. Максимум испускания при температурах синтеза 180-200oС был
Рисунок 1. Спектры поглощения (А) и люминесценции (Б) УНС, полученных ГТ методом в течение 3 часов: 1 – 160 ̊C (λвозб. = 344 нм), 2 -180 ̊C (λвозб. = 344 нм) 3 – 200 °C (λвозб. = 344 нм), 4 – 220 ̊C (λвозб. = 390 нм), 5 – 250 ̊C (λвозб. = 390 нм), 6 – исходный раствор ДСН
зарегистрирован в области 440 нм, при увеличении температуры до 220oС сместился в область 500 нм с увеличением интенсивности люминесценции, что может свидетельствовать об увеличении уровня сопряжения в полученных структурах. Кроме того, стоит отметить, что УНС имеют широкий спектр люминесценции (ширина спектрального пика, зафиксированная на половине максимальной амплитуды, составляет около 100-130 нм), что вероятнее всего свидетельствует о полидисперсности полученных УНС в одном синтезе.
Для увеличения интенсивности люминесценции и стабильности УНС варьировали время ГТ обработки в автоклаве. Показано, что при небольших временах обработки (1-2 часа) не достигается оптимальная интенсивность люминесценции продукта реакции, что может быть связано с неполной конверсией исходного ДСН в люминесцентный продукт, а нагрев более 3 часов приводит к формированию большого количества сажи в продукте реакции (рис. 2).
В результате проведенных экспериментов установлено, что оптимальным временем для получения УНС с максимальной интенсивностью люминесценции является 3 часа
Рисунок 2. График зависимости интенсивности люминесценции УНС от времени ГТ синтеза
при температуре 220oС.
Типичным признаком УНС является зависимость длины волны испускания от длины волны возбуждения, что связано с одновременным присутствием различных люминесцентных центров в их структуре. Характеристичные спектры люминесценции УНС, синтезированных из ДСН при оптимальных условиях, приведены на рис. 3А. Снимки с ПЭМ коррелируют со спектральными данными и демонстрируют смесь структур, средний диаметр УНС ~ 20 нм, среди которых максимальный размер ~ 42 нм, а наиболее мелкие наноструктуры – 3,5-5 нм (рис. 3Б).
Для получения информации о структуре УНС использовали данные спектра КР . Спектр КР содержит характеристичные для углеродных соединений пики D (~1300 см-1) и G (~1600 см-1),
Рисунок 3. Спектры люминесценции (А) и снимок ПЭМ (Б) коллоидного раствора УНС
уширенный
профиль которых предоставляет
информацию об уровне разупорядочения структуры и /или кластеризации в УНС. Полоса D обычно демонстрирует присутствие ароматических колец в структуре. Смещенное положение полосы G (1620 см-1) относительно графита (1580 см-1) и соотношение интенсивностей пиков I (D)/I(G) указывают на небольшой размер структур. Для получения информации о структурных фрагментах и функциональных группах в составе УНС использовали данные ИК спектроскопии. Асимметричные колебания сульфогрупп ν(as. S=O.), входящих в состав ДСН, имеют несколько полос в области 1200-1260 см-1, что также подтверждается деформационными колебаниями δ(S-O-C) при 870 см-1. Пик в области 1720 см-1 соответствует валентным колебаниям группы ν(C=О). В области 1150-1060 см-1 имеются полосы средней интенсивности, соответствующие колебаниям углеродного скелета. В диапазоне 3011-2800 см-1 имеются некоторые пики, соответствующие асимметричным и симметричным колебаниям -СН2- алифатических фрагментов. В высокочастотной области имеются пики связанных OH-групп.
Показано, что при оптимальных параметрах ГТ синтеза (220oС, 3 часа) был получен полидисперсный продукт, содержащий несколько испускающих центров, что требует дальнейшего фракционирования перед оценкой возможности его применения.
С целью разделения полученной смеси УНС по размерам и выделения фракций со схожими физико-химическими характеристиками проводили фракционирование коллоидного раствора УНС с применением метода эксклюзионной хроматографии. Этот метод позволяет получать настраиваемое количество фракций УНС для дальнейших исследований. В результате проведенных экспериментов были получены 48 фракций УНС, которые обладали различными люминесцентными свойствами (Рис. 4).
Рисунок 4. Спектры люминесценции для фракций c различным удерживаемым объемом: А- 7 мл (фр. 10); Б- 10,5 мл (фр. 15); В- 16,1 мл (фр. 23); Г- 25,9 мл (фр. 37); Д- 27,3 мл (фр. 39)
Во фракциях были идентифицированы 3 типа испускающих центров с максимумами люминесценции в областях: 410-420 нм (тип 1), 490 нм (тип 2) и 530 нм (тип 3). Наибольшую интенсивность люминесценции имел первый тип испускающих центров при оптимальном возбуждении 340 нм (фракции 8-15) (рис. 4А, Б). Во фракциях 10-20 присутствовал второй тип испускающих центров с наименьшей интенсивностью люминесценции, а также примеси структур типа 1 и 3 (рис. 4Б – Г). Третий тип испускающих центров (тип 3) характеризовался длинноволновым максимумом испускания ~530 нм (рис. 4Г, Д), максимальная интенсивность люминесценции (λвозб. = 500 нм) типа 3 достигалась во фракции 39. Отличительной особенностью спектра люминесценции третьего типа является отсутствие сдвига длин волн испускания при увеличении длин волн возбуждения. Это, вероятно, связано с наличием люминесцентных центров аналогичного типа.
Для того, чтобы соотнести данные люминесценции с лежащей в основе структурой и морфологией УНС, были проанализированы спектры КР (рис. 5А) и снимки ПЭМ (рис. 5Б – Д). Ширина полос D (~1330 см-1) и G (~1590 см-1) указывает на высокий уровень разупорядочения в структуре УНС. При этом полоса G (1590 см-1) смещена по сравнению с графитом, что является показателем малого размера частиц и согласуется с данными ПЭМ. Согласно данным ПЭМ, средние размеры частиц для фракций 5, 15 и 23 оказались равными 2,3; 1,9 и 1,1 нм соответственно. Размер частиц из фракции 38 трудно оценить из-за еще меньшего размера частиц и плохой контрастности на изображениях.
Таким образом, нами было
продемонстрировано, что ГТ синтез приводит к
получению полидисперсных УНС из ДСН с
различными люминесцентными свойствами. В
ходе исследований был разработан подход для разделения смеси наноструктур на индивидуальные фракции с использованием метода эксклюзионной хроматографии. Однако, стоит отметить существенную проблему данного типа УНС – низкие значения КВ люминесценции как для общей смеси, так и для отдельных фракций. Необходимо рассмотреть альтернативный подход для увеличения интенсивности люминесценции – использование низкомолекулярных соединений для синтеза УНС.
10
Рисунок 5. Спектры КР (А) и изображения ПЭМ для различных фракций УНС: 5 (Б), 15 (В), 23 (Г) и 38 (Д)
Глава 4 посвящена разработке
подходов к синтезу УНС на основе
низкомолекулярных соединений с
высоким КВ люминесценции. В
качестве исходных соединений для
синтеза УНС были выбраны
лимонная кислота и 1,2-
этилендиамин, так как ранее было показано, что они способны образовывать органический флуорофор ИПКК, который обеспечивает интенсивную люминесценцию УНС на их основе (рис. 6). Для синтеза УНС из ЛК и ЭДА
(мольное соотношение = 1:2) применяли метод нагрева водного раствора исходных соединений при атмосферном давлении при 100oС в течение нескольких часов, так как этот подход обеспечивает мягкие условия синтеза и позволяет контролировать физико-химические свойства реакционной смеси на каждом этапе синтеза. Все полученные образцы имели максимум люминесценции в области 450 нм при возбуждении от 300 до 400 нм, увеличение длины волны возбуждающего света (420-500 нм) приводило к смещению
полос испускания в область больших длин волн, что, вероятно, связано с полидисперсностью продукта (рис. 7Б). Более длительное нагревание (более 6
часов) приводило к потемнению реакционной смеси и сокращению интенсивности люминесценции (рис. 7В). Максимальный КВ ~ 89% был достигнут через 6 часов синтеза. При детальном исследовании люминесцентного продукта с помощью ЯМР 1Н спектроскопии было показано, что он содержит сигналы исходных соединений – ЛК (дублеты метиленовых звеньев 2.83 и 3.05 м.д.) и ЭДА (сигнал метиленовых фрагментов при 2.99 м.д.) и очень слабые сигналы ИПКК (два триплета метиленовых звеньев алифатического фрагмента – 3.79 м.д. и 4.16 м.д., сигналы протонов пиридинового кольца – 6, 01 м.д. и 6,05 м.д., уширенный синглет протона в –NH группы при 8,0 м.д.).
Рисунок 7. Спектры поглощения (А) и спектры люминесценции УНС, полученных через 6 часов синтеза (Б), значения КВ образцов (В) и их вид в УФ излучении
Рисунок 6. Схема образования ИПКК
Для большей конверсии исходных соединений в продукт и повышения выхода реакции был применен ГТ метод синтеза при температуре 200oС в течение 3 часов. Изучение различных мольных соотношений ЛК:ЭДА = 1:0,5, 1:1, 1:1,5, 1:2, 1:3, 1:4, 1:6 показало, что максимум поглощения для всех образцов наблюдался в области ~ 350 нм (рис. 8А), а максимум люминесценции располагался в области 450 нм (рис. 8Б). УНС также имели схожие значения квантовых выходов (рис. 8В), что косвенно может свидетельствовать о присутствии в структуре УНС единого люминесцентного центра. Полученные данные демонстрируют, что оптимальное соотношение ЛК:ЭДА для формирования люминесцентных продуктов находится в интервале от 1:1 до 1:2. Для дальнейшего детального изучения физико-химических свойств был выбран образец с мольным соотношением реагентов 1:1,5. Для подтверждения структуры полученного образца проводили исследование с помощью спектроскопии ЯМР 1Н и 13С (Таблица 1). В спектре ЯМР 1Н присутствуют сигналы при 3,5–2,0 м.д., которые, предположительно, коррелируют с полиамидом лимонной кислоты, а также
сигналы неидентифицированных примесей.
Таблица 1. ЯМР 1Н и 13С спектры образца с мольным соотношением 1:1,5
Рисунок 8. Оптические характеристики УНС, полученных из ЛК и ЭДА с различными мольными соотношениями: спектры поглощения (А), спектры люминесценции (Б), и значения КВ (В)
Спектр
Растворитель
δ, м.д.
3,79 (т., 2H, J = 9.1 Hz, СН2), 4,16 (т., 2H, J = 9.1 Hz, СН2), 5,94 (с., 1H, СH), 6,05 (с., 1H, СH), 7,75 (уш.с., 1H, NH)
172,48 (c., 1C, СOOH), 45,03 (c., 1C, CH2), 47,60 (c., 1C, CH2), 89,16; 105,03; 149,92; 157,15; 164, 87 (с., пиридин. кольцо)
ЯМР 1H
ЯМР 13С D2O
Для разделения смеси продуктов и установления их структуры проводили детальное исследование с использованием метода горизонтального гель- электрофореза смеси ЛК:ЭДА = 1:1,5. В результате разделения были получены 4 индивидуальные фракции образца в положительной (фр. 1-2) и отрицательной (фр. 3-4) областях (рис. 9).
Фракции 1-3 имели интенсивную коричневую окраску, в отличие от фракции 4. При возбуждении ультрафиолетовым светом (λвозб. = 365 нм) все фракции имели схожий максимум испускания в области 450 нм. Полоса 3
обладала
люминесценции,
перепоглощения
интенсивностью
соотношением
прозрачная в белом свете фракция 4 (КВ> 80%). Согласно данным ЯМР 1Н, эта фракция была идентифицирована как чистый флуорофор ИПКК. Существенным отличием фракции 4 является отсутствие зависимости положения максимума люминесценции от возбуждения, что
также характерно для молекулярного флуорофора. При этом природа коричневых частиц (фракции 1- 3) может быть охарактеризована как избыток
сложных полимерных структур на основе лимонной кислоты и этилендиамина с включением ИПКК, характеризующийся люминесценцией при 450 нм.
Так как фракция 4 представляет собой яркий органический флуорофор ИПКК, содержащий различные функциональные группы, нами были реализованы подходы для его конъюгации со вторичными кроличьими антимышиными антителами. Для создания ковалентной связи между карбоксильной группой в составе ИПКК и первичной аминогруппой в составе антитела был использован метод активированных эфиров.
В качестве линкеров для формирования амидной связи были использованы 1-этил-3-(3-диметил-амино-пропил)-карбодиимид гидрохлорид (ЭДК) и натриевая соль N-гидроксисульфосукцинимида (сульфо-ГСС). Для получения конъюгатов ИПКК со вторичными АТ подбирали оптимальные условия путем варьирования основных компонентов реакции: концентрации вторичных АТ, линкеров, времени и температуры перемешивания. Диапазоны исследуемых концентраций веществ и параметров представлены в таблице 2.
Таблица 2. Варьируемые параметры для синтеза конъюгатов ИПКК с АТ
низкой вероятно,
интенсивностью из-за эффекта Наибольшей люминесценции и заряда к массе обладала
фотонов.
Рисунок 9. Результат гель- электрофоретического разделения УНС из ЛК:ЭДА в дневном свете (А), в УФ свете (Б)
No параметра 1
3
5
Параметр
Концентрация АТ, моль/л Концентрация ЭДК, моль/л Концентрация сульфо-ГСС, моль/л Время перемешивания, час Температура перемешивания, oС
Варьируемый диапазон
2*10-5– 1*10-7 1*10-3 – 5*10-7 1*10-3 – 5*10-7 2 – 24
4, 25, 37
13
Метод горизонтального гель-электрофореза был использован для оценки связывания ИПКК со вторичными АТ. В результате исследования, установлено, что полученный конъюгат имел меньшую подвижность в геле благодаря большему отношению массы к заряду (рис 10, линия 1). Кроме того,
интенсивность люминесценции конъюгата была значительно ниже, чем интенсивность исходного флуорофора (сокращение интенсивности на ~ 65% при мольном соотношении линкеров 1:2). Флуорофор, связанный с линкерами, и свободный флуорофор имели схожую электрофоретическую подвижность (рис 10, линии 2-3). Полученные результаты
предположительно можно объяснить возможным гашением возбужденного синглетного состояния за счет присутствия в составе антител сопряженной аминокислоты триптофана посредством фотоиндуцированного переноса электронов.
Таким образом, установлено, что в результате конъюгации происходит значительное тушение люминесценции ИПКК в составе конъюгата, что существенно ограничивает возможность применения конъюгата в любых вариантах иммуноанализа.
Так как было установлено, что УНС, полученные на основе различных соединений, представляют собой сложную смесь структур, а также продемонстрированы весомые ограничения для их применения в качестве меток в иммуноанализе, то необходима разработка альтернативных систем для создания эффективных меток. В качестве таких систем были выбраны ЗНЧ, которые обладают рядом преимуществ, таких как простой синтез, высокая коллоидная стабильность, различная функционализация поверхности и превосходные оптические свойства. В главе 5 описан подход для одностадийного синтеза биотинилированных ЗНЧ, а также разработка иммунохимического анализа для количественного обнаружения СРБ в плазме крови человека как основного белка острой фазы воспаления.
Для синтеза ЗНЧ, функционализированных биотином, был разработан подход прямого восстановления тетрахлороаурата (III) водорода биотином при нагревании в щелочной среде (pН = 10). Согласно проведенным исследованиям, на данный момент в литературе не описаны подходы одностадийного синтеза функционализированных биотином ЗНЧ для их последующего применения в иммуноанализе. Для улучшения оптических свойств и стабильности ЗНЧ,
Рисунок 10. Электрофореграмма полученных образцов: 1 – конъюгат ИПКК со вторичными антителами, 2 – ИПКК с линкерами ЭДК и сульфо-ГСС в ФСБ, 3 – ИПКК в ФСБ
функционализированных биотином, мы изучили свойства продукта, полученного при различных мольных соотношениях Au:биотин – 1:2,7; 1:8 и 1:13 (где CAu3+ = 0,75 ммоль/л и Cбиотина = 2, 6 и 10 ммоль/л). Формирование ЗНЧ контролировали
за счет возникновения плазмонной полосы на спектрах поглощения и данных изображений ПЭМ (рис. 11). Более низкая концентрация биотина (2 ммоль/л, соотношение Au:биотин 1:2,7) привела к получению размытого спектра поглощения и низкой концентрации наночастиц с большим распределением по размеру 35±21 нм (рис. 11А(а), Б). Типичная полоса ППР сферических наночастиц при 526 нм появляется при соотношении Au:биотин = 1:8 (рис. 11A(б)).
Рисунок 11. (А) – Спектры поглощения ЗНЧ@биотин с различными мольными соотношениями Au:биотин: (а)- 1:2,7; (б)- 1:8; (в)- 1:13. ПЭМ-изображения ЗНЧ@биотин с мольными соотношениями Au:биотин (Б) – 1:2.7; (В) – 1:8, (Г) – 1:13
ПЭМ формирование состоящих из множества ЗНЧ небольшого размера (3,7±0,7 нм), а не отдельных наночастиц (рис. 11В). Максимальное значение оптической плотности при 521 нм было достигнуто при соотношении Au:биотин 1:13 (рис. 11(в)). Значительный избыток биотина приводил к стабилизации ЗНЧ со средним размером 9±3 нм (рис. 11Г). ЗНЧ@биотин с оптимальным соотношением 1:13 очищали с помощью двойного центрифугирования для удаления возможного избытка биотина. С целью формирования метки на основе ЗНЧ@биотин проводили их взаимодействие со стрептавидином. Разработанная метка будет обладать рядом ценных преимуществ, таких как интенсивный оптический сигнал, отсутствие трудоемких этапов конъюгации и очистки, образование устойчивого к физико-химическим воздействиям комплекса ЗНЧ@биотин:стрептавидин и возможность взаимодействия с различными биотинилированными соединениями, что делает данную метку привлекательной для иммунохимических методов. Стрептавидин представляет собой белок с тетрамерной структурой (Mw = 55 кДа), полученный из актинобактерий Streptomyces avidinii. Он может взаимодействовать с четырьмя молекулами биотина с высоким сродством. Способность ЗНЧ@биотин взаимодействовать со стрептавидином оценивали методом горизонтального гель- электрофореза. В результате эксперимента было установлено, что свободные
Изображения демонстрируют «кластеров»,
ЗНЧ@биотин и комплекс, полученный в результате взаимодействия ЗНЧ@биотин со стрептавидином, перемещались в агарозном геле с различной скоростью. Комплекс ЗНЧ@биотин:стрептавидин имел меньшую подвижность и, следовательно, большее отношение массы к заряду по сравнению с ЗНЧ@биотин. В целях повышения эффективности взаимодействия ЗНЧ@биотин со стрептавидином и формирования стабильной метки варьировали их мольные
соотношения. Были проанализированы четыре мольных соотношения ЗНЧ@биотин к стрептавидину, такие как 1:9, 1:1, 2:1 и 4:1. Избыток стрептавидина по отношению к ЗНЧ@биотин (мольное соотношение ЗНЧ@ биотин:стрептавидин = 1:9) приводил к образованию комплекса со сдвигом максимума оптической плотности до 540 нм, что указывает на сшивание между биотинилированными ЗНЧ и стрептавидином (рис. 12А). Изменение оптической плотности образовавшегося комплекса в сторону более длинных волн является результатом коллективных колебаний электронов нескольких ЗНЧ. При соотношениях ЗНЧ@биотин:стрептавидин = 1:1, 2:1 и 4:1 показан слабый сдвиг плазмонного максимума, что указывает на недостаток белка для образования стабильного комплекса с наночастицами (рис. 12А). Плотность иммобилизованных в лунках антител влияет на их способность взаимодействовать с антигеном. Чтобы контролировать плотность иммобилизации антител и избежать снижения их функциональной активности, сравнивали различные концентрации биотинилированных антител, такие как 2, 4, 8, 16, 35 и 70 мкг/мл (рис. 12Б). Антитела
иммобилизовали в лунках полистирольного микропланшета и добавляли комплексы ЗНЧ@биотин:стрептавидин с описанными выше соотношениями 1:9, 1:1, 2:1 и 4:1. Наилучший результат (наивысшая оптическая плотность) был получен для соотношения ЗНЧ@биотин:стрептавидин (1:9) и концентрации биотинилированных антител 8 мкг/мл.
Рисунок 12. (A) Нормированные спектры поглощения ЗНЧ@биотин (красный) и комплексов ЗНЧ@биотин:стрептавидин с различными мольными соотношениями: 1:9 (синий), 1:1 (зеленый), 2:1 (серый), 4:1 (оранжевый). (Б) Зависимость нормированной оптической плотности комплексов ЗНЧ@биотин:стрептавидин от концентрации АТ (n = 3)
Поскольку комплекс
ЗНЧ@биотин:стрептавидин с
мольным соотношением 1:9
продемонстрировал лучший
оптический сигнал со
специфическими антителами, мы
подробно изучили кинетику
образования комплекса и
проанализировали максимумы
поглощения
ЗНЧ@биотин:стрептавидин, их
средние размеры (методами
динамического светорассеяния и
ПЭМ), индексы
полидисперсности (ИП) и
значения ꝣ-потенциала через 0,
15, 30, 60, 90 и 120 минут
взаимодействия (рис. 13).
Средний гидродинамический
диаметр исходных ЗНЧ@биотин составлял 17 нм с ИП 0,11 ± 0,03, а ꝣ-потенциал был равен -36±7 мВ. После добавления раствора стрептавидина средний размер комплекса сразу увеличивался до 224 нм (ИП 0,33) со смещением максимума ППР до 531 нм (рис. 13А). Изображения ПЭМ демонстрируют образование комплекса ЗНЧ@биотин:стрептавидин и большой избыток стрептавидина (темные пятна вокруг образованных комплексов) (рис. 13Б). Дальнейшее увеличение времени взаимодействия приводит к увеличению размера комплексов, что отражается в смещении максимума поглощения (рис. 13А). Изображения ПЭМ подтверждают расходование свободного стрептавидина на образование более крупных агломератов, содержащих плотноупакованные ЗНЧ@биотин (рис.13Б, В, Г). После 60 минут взаимодействия образовывались комплексы размером ~ 1 мкм и ƺ-потенциалом -9±2 мВ (рис. 13А). Вероятно, стрептавидин блокирует все доступные молекулы биотина и ограничивает дальнейший процесс образования комплекса. Время образования комплекса не должно превышать один час для сохранения свободных биотин-связывающих сайтов стрептавидина для связывания с биотинилированными антителами в анализе. Разработанная метка была применена для детектирования СРБ в плазме крови человека иммунохимическим методом. СРБ является одним из основных белков острой фазы, концентрация которого быстро увеличивается в ответ на травму, воспаление или инфекцию, поэтому он широко применяется в качестве маркера.
Рисунок 13. (А) Зависимость размера (синие столбцы) и положения максимумов поглощения (оранжевые точки) от времени образования комплекса. ПЭМ-изображения комплексов ЗНЧ@биотин:стрептавидин после различного времени взаимодействия (мин): (Б) – 0, (В) – 15, (Г) – 60
Он представляет собой пентамерный белок, который состоит из пяти нековалентно связанных и негликозилированных идентичных субъединиц по 206 аминокислот в каждой, которые образуют дискообразный пятиугольник. Для разработки иммунохимического анализа был выбран «сэндвич» формат иммуноанализа, который обеспечивает определение высокомолекулярных антигенов с высокой чувствительностью и специфичностью. Данный формат включает пару специфических антител к пространственно удаленным эпитопам исследуемого антигена, различные концентрации СРБ, а также разработанную метку на основе ЗНЧ@биотин:стрептавидин (рис. 14).
Рисунок 14. Схематическое изображение разработанного иммуноанализа для обнаружения СРБ
В результате анализа появление характерной розовой окраски ЗНЧ@биотин свидетельствует о присутствии аналита в пробе. Интенсивность окрашивания характеризует количество антигена (СРБ) в образце. Оптимизацию данного анализа с целью улучшения аналитических характеристик проводили путем варьирования различных параметров: концентрации покровных АТ, буферов для иммобилизации АТ, блокировочных агентов и промывок микропланшета, концентрации детекторных биотинилированных АТ, мольного соотношения компонентов метки и времени инкубации (Таблица 3).
18
Таблица 3. Варьируемые и оптимальные параметры иммунохроматографического анализа
для проведения
Оптимальный параметр
БСА 0,5%
ФСБ+0.1% Твин 20
8 1:9
1 2
4
5 6 7
Параметр
Концентрация покровных антител, мкг/мл
Блокирующий буфер
Промывающий буфер
Концентрация детекторных антител, мкг/мл
Мольное соотношение ЗНЧ@биотин:стрептавидин
Время инкубации метки, мин
Варьируемый показатель
2, 4, 8, 16, 35, 70
Казеин 0,5-3% БСА 0,5-3% ПЭГ-ОН 1-3% ФСБ
ФСБ + 0.05% Твин 20 ФСБ+0.1% Твин 20
8, 10, 15
1:9, 1:1, 2:1, 4:1
0, 15, 30, 60
Буфер для иммобилизации покровных антител
ФСБ (pH = 7,2), ФСБ+NaCl (pH = 7,3), ФСБ+БСА (pH = 7,3), ББ (pH = 9,7)
ФСБ (рН 7.2)
В соответствии с разработанными оптимальными параметрами проводили определение СРБ в буферном растворе ФСБ (рН = 7,2) с использованием различных концентраций СРБ (1, 3, 10, 30, 100, 300 и 1000 нг/мл). Результаты определения приведены на рисунке 15. Как видно из полученных данных, линейный диапазон определения составляет от 3 до 100 нг/мл.
Предел обнаружения (ПО) для разработанного анализа составляет 1,5 нг/мл. Разработанный иммунохимический анализ был апробирован на образцах плазмы крови
Рисунок 15. Калибровочная кривая и соответствующий линейный диапазон (вставка сверху) обнаружения CРБ в буфере ФСБ (pH=7.2) (n = 3)
человека (рис. 16). Для этого в образцы плазмы крови вносили стандартные растворы СРБ с получением конечных концентраций аналита 1, 3, 10, 30, 100, 300 и 1000 нг/мл. Неразбавленная плазма крови приводит к сильному матричному эффекту и нечетким оптическим сигналам. Чтобы уменьшить матричный эффект, плазму разбавляли в 2, 4, 10, 50 и 100 раз. Отсутствие матричных эффектов достигали при 50-кратном и 100-кратном разбавлении.
Введено СРБ, нг/мл
Найдено СРБ, нг/мл Sr
Меньшие разбавления (2, 4 и 10 раз) приводили к высоким неспецифическим сигналам (рис. 16). При оптимальном разбавлении плазмы крови 1/50 ПО составлял 1,2 нг/мл, а предел количественного
Линейный аналогично растворе, составил 3-100 нг/мл. В таблице 4 систематизированы данные по определению
определения динамический определению
– 3,9 нг/мл. диапазон,
в стандартном СРБ разработанным методом.
Рисунок 16. Калибровочные кривые и соответствующие линейные диапазоны (вставка сверху) обнаружения CРБ в плазме крови, разбавленной в: 10 (серый), 50 (оранжевый) и 100 (синий) раз (n = 3)
Таблица 4. Иммунохимическое определение СРБ в образцах плазмы крови человека методом «введено-найдено»
1 1,05±0,08
3 3,30±0,32 10 10,6±0,74 30 31,4±2,7
100 103±5
300 310±13 1000 1049±56
0,07 0,09 0,07 0,08
0,05 0,04 0,05
Селективность иммунохимического
измерения перекрестной реактивности с другими белками острой фазы воспаления: прокальцитонином (ПКТ) и сывороточным амилоидом А (САА1). В результате эксперимента показано, что не происходит неспецифического взаимодействия антител против СРБ с ПКТ и CAA1, что подтверждает отсутствие перекрестной реактивности.
Таким образом, разработан одностадийный метод получения функционализированных биотином ЗНЧ, а также проведена оптимизация методики синтеза с целью получения наночастиц, обладающих высокой стабильностью и функционалом биотина. Показана эффективность взаимодействия ЗНЧ@биотин со стрептавидином и моноклональными биотинилированными антителами против СРБ посредством нековалентного взаимодействия. Проведена работа по разработке иммунохимического метода определения СРБ в плазме крови человека, который соответствует современным тенденциям аналитической и клинической практики для определения хронических уровней СРБ в плазме крови человека с целью мониторинга течения воспалительного процесса.
анализа
подтверждали
путем
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
1. Разработаны одностадийные подходы к получению люминесцентных меток на основе декстран сульфата натрия, лимонной кислоты, а также плазмонных меток на основе модифицированных биотином и стрептавидином наночастиц золота, изучены закономерности их свойств, продемонстрирована возможность практического применения метки на основе биотинилированных наночастиц золота и стрептавидина в иммуноанализе для определения маркера воспаления – С-реактивного белка человека.
2. Синтезированы углеродные наноструктуры на основе декстран сульфата натрия, лимонной кислоты и 1,2-этилендиамина методами нагревания при атмосферном и повышенном давлении в автоклаве. Установлены закономерности изменения их свойств, показано влияние времени и температуры синтеза, мольных соотношений реагентов на люминесцентные свойства.
3. Продемонстрированы подходы тонкого разделения смесей углеродных наноструктур на дискретные компоненты по размеру и соотношению массы к заряду. Методом эксклюзионной хроматографии из гидротермально обработанного декстран сульфата натрия выделены компоненты с различными оптическими характеристиками. Определены условия гель- электрофоретического разделения люминесцентных продуктов из лимонной кислоты и 1,2–этилендиамина, выделен флуорофор 5-оксо-1,2,3,5- тетрагидроимидазо[1,2-α]пиридин-7-карбоновая кислота, обладающий КВ более 80%. Изучены возможности и ограничения конъюгации флуорофора с антителами. Показано, что конъюгирование приводит к значительному снижению люминесценции флуорофора.
4. Разработан новый одноэтапный метод синтеза биофункционализированных биотином наночастиц золота. Установлены оптимальные условия получения яркой, стабильной метки на основе функционализированных биотином наночастиц золота и стрептавидина: мольное соотношение Au:биотин – 1:13, ЗНЧ@биотин:стрептавидин – 1:9. Показано, что размер и функционал метки может быть легко настроен путем варьирования условий инкубации компонентов.
5. Показана возможность количественного определения СРБ человека иммунохимическим методом с использованием метки на основе функционализированных биотином наночастиц золота и стрептавидина. Успешно проведена апробация метода на образцах плазмы крови человека. Установлено, что разбавление плазмы крови в 50 раз нивелирует матричный эффект. Разработанный анализ характеризовался пределом обнаружения 1,2 нг/мл, что соответствует современным тенденциям аналитической и клинической практики для определения хронических уровней СРБ.
Актуальность исследования. Современные достижения в области нанотехнологий играют ключевую роль в разработке новых улучшенных подходов для качественного и количественного определения различных целевых аналитов. В настоящее время существует интерес к разработке, изучению и применению новых типов меток, которые объединяют достоинства имеющихся меток и элиминируют их недостатки. В частности, люминесцентные углеродные наноструктуры (УНС) вызывают значительный интерес у многих научных групп с целью их применения в качестве меток в различных типах анализов. С момента их открытия в 2004 году до настоящего момента ведутся дискуссии об их строении и природе люминесценции. Представленные в научной литературе данные позволяют предположить дефектную структуру, содержащую нанофрагменты графена с большим количеством гетероатомов, однако существуют относительно новые данные, подтверждающие наличие в структуре УНС органических флуорофоров, которые приводят к люминесценции в сине-зеленой области спектра с высокими значениями квантового выхода (КВ). В связи с этим актуальной задачей является не только определение структурных особенностей УНС и происхождения их люминесцентных свойств, но и практическое применение УНС в качестве люминесцентных меток в анализе.
При этом одними из наиболее распространённых нанометок как для научных исследований, так и для клинической практики остаются наночастицы золота (ЗНЧ). Во многом их популярность связана с уникальными свойствами, вызванными локализованным поверхностным плазмонным резонансом (ППР). Свойства ЗНЧ зависят от их состава, морфологии, размера, формы и молекул на поверхности. ЗНЧ широко используются в качестве меток в различных форматах иммуноанализа благодаря выраженным плазмонным свойствам простоте синтеза, высокой коллоидной стабильности, широким возможностям функционализации поверхности. Зачастую предложенные подходы требуют сложных модификаций меток, а разработанные аналитические методики не всегда обладают достаточной чувствительностью. Принимая во внимание достигнутые успехи в этом направлении, разработка новых подходов с целью улучшения и упрощения традиционных методик является актуальной задачей.
Цель диссертационной работы состояла в поиске новых подходов к получению перспективных люминесцентных и плазмонных меток, изучении закономерностей их синтеза и свойств, а также применении в иммуноанализе. Для достижения поставленной цели были решены следующие задачи:
• Осуществить гидротермальную (ГТ) обработку природного модифицированного полисахарида и разработать методику фракционирования полученных УНС для выделения соединений с различными испускающими центрами;
• Разработать подход для получения УНС с высоким КВ из низкомолекулярных соединений, охарактеризовать их морфологию и люминесцентные свойства, а также установить особенности и ограничения конъюгации УНС с антителами (АТ);
• Разработать подход для одностадийного синтеза ЗНЧ, модифицированных молекулами биотина; установить закономерности формирования метки на основе биотинилированных ЗНЧ (ЗНЧ@биотин) и стрептавидина, их взаимодействия с АТ;
• Разработать иммунохимический метод анализа для детектирования С- реактивного белка (СРБ) в плазме крови человека с использованием метки на основе ЗНЧ@биотин и стрептавидина (ЗНЧ@биотин:стрептавидин).
Методы исследования. Для решения поставленных в работе задач применяли комплекс физико-химических методов исследования (люминесцентная спектроскопия, спектрофотометрия, инфракрасная (ИК) спектроскопия, спектроскопия комбинационного рассеяния (КР), спектроскопия ядерного магнитного резонанса (ЯМР), просвечивающая
электронная микроскопия (ПЭМ), метод динамического рассеяния света, гель- электрофорез, эксклюзионная хроматография) и иммунохимических методов (иммуноанализ «сэндвич» – типа в полистирольных микропланшетах).
Научная новизна исследования состоит в следующем:
• Разработан и применен подход для разделения полидисперсных УНС на основе декстран сульфата натрия (ДСН) методом гель-эксклюзионной хроматографии, установлены физико-химические характеристики фракций, показано присутствие различных люминесцентных центров.
• Установлена возможность фракционирования УНС на основе лимонной кислоты (ЛК) и 1,2-этилендиамина (ЭДА) по соотношению массы к заряду методом горизонтального гель-электрофореза; показано, что основной вклад в люминесценцию УНС вносит органический флуорофор 5-оксо-1,2,3,5- тетрагидроимидазо[1,2-α]пиридин-7-карбоновая кислота (ИПКК).
• Разработан и оптимизирован одностадийный подход для функционализации ЗНЧ молекулами биотина и последующего контролируемого образования метки при взаимодействии со стрептавидином и биотинилированными антителами для детектирования СРБ в плазме крови человека.
Практическая значимость работы:
Показана возможность применения гель-эксклюзионного фракционирования гидротермально обработанных органических соединений, препаративного выделения отдельных фракций и изучения их свойств.
Произведено разделение смеси УНС из ЛК и ЭДА методом горизонтального гель-электрофореза на индивидуальные фракции, доказано присутствие молекулярного флуорофора ИПКК в качестве основного люминесцентного компонента.
Разработан эффективный подход одностадийного получения биотинилированных ЗНЧ прямым восстановлением тетрахлороаурата (III) водорода биотином, установлены закономерности взаимодействия биотинилированных ЗНЧ со стрептавидином и биотинилированными антителами.
Продемонстрирована возможность количественного иммунохимического определения СРБ в плазме крови человека с использованием меток на основе ЗНЧ@биотин:стрептавидин.
На защиту автор выносит:
1. Результаты исследования некоторых свойств УНС на основе ДСН и их фракционирования методом гель-эксклюзионной хроматографии с целью установления физико-химических характеристик отдельных фракций.
2. Сравнительное изучение зависимости оптических характеристик УНС из ЛК и ЭДА от методов и параметров синтеза. Разработанную методику для разделения и выделения индивидуальных фракций методом горизонтального гель-электрофореза, установление их структуры и результаты конъюгирования с антителами.
3. Оптимизированную методику синтеза биотинилированных ЗНЧ, подходы для формирования меток со стрептавидином и их применение для количественного иммунохимического детектирования СРБ в плазме крови человека.
Личный вклад соискателя заключается в постановке задач исследования, выборе методов синтеза и исходных реагентов для получения УНС, разработке методик их фракционирования, осуществлении подхода к функционализации ЗНЧ биотином и разработке иммунохимического метода для определения СРБ в плазме крови человека, а также в непосредственном проведении экспериментов, обобщении и анализе полученных результатов, формулировании выводов, представлении результатов исследований на всероссийских и международных конференциях, написании научных публикаций. Публикации. По материалам диссертации опубликовано 11 работ, входящих в перечень ВАК и библиографические базы данных Web of Science и Scopus.
Достоверность полученных результатов подтверждается применением современных физико-химических и аналитических методов исследования, соответствием между полученными результатами, а также отсутствием противоречий с литературными данными, апробацией полученных данных на всероссийских и международных конференциях, публикацией основных положений диссертационного исследования в профильных высокорейтинговых реферируемых журналах.
Апробация работы. Основные результаты диссертационного исследования были доложены на всероссийских и международных конференциях: IX Международный конгресс «Биотехнология: состояние и перспективы развития» (Россия, Москва, 2017), Saratov Fall Meeting-17, 18, 19, 20: «International Symposium optics and Biophotonics» (Россия, Саратов, 2017, 2018, 2019 и 2020); XVIII Международная конференция «Оптика лазеров» (Россия, Санкт-Петербург, 2018), Международный форум «Биотехнология: состояние и перспективы развития» (Россия, Москва, 2019); XI Международная конференция молодых учёных по химии «Менделеев-2019» (Россия, Санкт-Петербург, 2019), II Всероссийская конференция «Химия биологически активных веществ» с международным участием «ХимБиоАктив-2019» (Россия, Саратов, 2019).
Структура и объем работы. Диссертация состоит из введения, обзора литературных данных, экспериментальной части, изложения полученных результатов и их обсуждения (3 главы), выводов и списка цитируемой литературы. В тексте содержатся таблицы, схемы, диаграммы и графические иллюстрации. Работа представлена на 134 страницах, включает 55 рисунков и 4 таблицы. Финансовая поддержка работы осуществлялась в рамках следующих грантов: Российского фонда фундаментальных исследований «Разработка высокочувствительных методов экспрессного определения маркеров воспаления на основе многофункциональных люминесцентных и плазмонных наноструктур» (No 19-33-90159, Аспиранты); Российского научного фонда «Углеродные наночастицы и материалы на их основе» (No 16-13-10195) и «Разработка высокочувствительных мультиплексных тест-систем биомаркеров воспаления на основе нового поколения люминесцентных и плазмонных наночастиц» (No 20-33-7007).
Помогаем с подготовкой сопроводительных документов
Хочешь уникальную работу?
Больше 3 000 экспертов уже готовы начать работу над твоим проектом!