Разработка метода микробиом-ассоциированной экспосомики для интегральной оценки нарушений липидного и углеводного обмена у лиц пожилого возраста

Бесплатно
Работа доступна по лицензии Creative Commons:«Attribution» 4.0
Безродный Святослав Леонидович
Бесплатно
Работа доступна по лицензии Creative Commons:«Attribution» 4.0

ВВЕДЕНИЕ ………………………………………………………………………………………………………………………………………… 4
Методология и методы исследования …………………………………………………………………………………………….. 10
Материалы и методы исследования ……………………………………………………………………………………………….. 12
Основные положения диссертации, выносимые на защиту …………………………………………………………………. 21
Степень достоверности и апробация результатов исследования …………………………………………………………. 21
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ……………………………………………………………………………………………………… 23
Роль микробиоты в липидном и углеводном обмене человека ……………………………………………………………. 23
1.1. Микробные маркеры – малые молекулы микробного происхождения ………………………………………. 24
1.2. Понятие дисбиоза кишечника, причины его развития. …………………………………………………………….. 33
1.3. Дислипидемия как причина возраст-ассоциированных неинфекционных заболеваний …………….. 38
1.4. Связь нарушений липидного обмена и дисбиоза кишечника ……………………………………………………. 42
1.5. Дислипидемии при нарушениях углеводного обмена и дисбактериоз кишечника (метаболический
синдром и СД 2 типа)………………………………………………………………………………………………………………………… 44
1.6. Современные направления коррекции дислипидемий у больных с СД 2 типа. ………………………….. 46
1.7. Особенности использования метода математического моделирования в биологии и медицине …. 52
1.8. Заключение ……………………………………………………………………………………………………………………………. 61
ГЛАВА 2. Интегральная оценка нарушений углеводного и липидного обмена по концентрациям
микробных маркеров в крови …………………………………………………………………………………………………………….. 62
2.1. Определение критериев интегральной оценки состояния микробиома лиц пожилого возраста при
нарушении углеводного обмена …………………………………………………………………………………………………….. 63
2.2. Создание математических моделей предиктивной диагностики сахарного диабета 2 типа и
дислипидемии у лиц пожилого возраста…………………………………………………………………………………………. 69
2.2.1. Модель предиктивной диагностики сахарного диабета 2 типа по концентрациям малых
молекул микробного происхождения в крови …………………………………………………………………………. 70
2.2.2. Модель предиктивной диагностики сочетанной дислипидемии по концентрациям малых
молекул микробного происхождения в крови …………………………………………………………………………. 77
2.3. Изучение методом математического моделирования концентраций малых молекул микробного
происхождения в крови при разных типах ДЛП ……………………………………………………………………………… 83
2.4. Заключение по 2 главе …………………………………………………………………………………………………………….. 89
ГЛАВА 3. Интегральная оценка состояния микробиома по содержанию микробных маркеров в крови.. 90
3.1. Оценка особенностей структуры микробиома у лиц пожилого возраста при различных вариантах
нарушения липидного и углеводного обмена …………………………………………………………………………………. 90
3.2. Оценка особенностей нарушения углеводного обмена методом микробиом-ассоциированной
экспосомики у лиц пожилого возраста …………………………………………………………………………………………… 98
3.3. Оценка особенностей нарушения липидного обмена методом микробиом-ассоциированной
экспосомики у лиц пожилого возраста …………………………………………………………………………………………. 100
3.4. Компьютерная программа предиктивной диагностики сахарного диабета 2 типа по концентрациям
малых молекул микробного происхождения в крови …………………………………………………………………….. 112
3.5. Заключение по 3 главе …………………………………………………………………………………………………………… 114
Заключение …………………………………………………………………………………………………………………………………….. 116
Выводы …………………………………………………………………………………………………………………………………………… 118
Практические рекомендации ……………………………………………………………………………………………………………. 120
Перспективы дальнейшей разработки темы ……………………………………………………………………………………… 120
Список сокращений…………………………………………………………………………………………………………………………. 120
Список терминов …………………………………………………………………………………………………………………………….. 122
Список использованной литературы ………………………………………………………………………………………………… 124

Объектами исследования являлись микробных маркеров, компонентов клеточной стенки микроорганизмов (низкомолекулярные жирные кислоты, гидроксикислоты, альдегиды, стеролы), определявшиеся в крови людей пожилого возраста методом хромато- масс-спектрометрии.
Научная литература, посвященная проблеме изучения микробиоценозов и коррекции их нарушений, была проанализирована формально-логическими методами исследования. Планирование и проведение исследований, направленных на решение поставленных задач, осуществлялось на основе общенаучных и специфических методов.
Биологические образцы – венозная кровь – были получены у пациентов консультативно-диагностического центра ОСП «Российский геронтологический центр» ФГАОУ ВО РНИМУ им. Н.И. Пирогова Минздрава России.
Всего в работе было исследовано 163 человека, из них 48 (29,4%) женского и 115 (70,6%) мужского пола. Средний возраст 68,1 + 1,7 лет. В группу контроля «К» были включены пациенты без нарушений углеводного и липидного обмена в количестве 18 человек (11,0%), средний возраст – 67,4+2,1 лет.
Опытная группа состояла из 3 подгрупп: пациенты, у которых наряду с нарушением углеводного обмена по типу сахарного диабета 2 типа было установлено нарушение липидного обмена «СД2+ДЛП» – 67 человек (41,1%); пациенты с дислипидемией без сахарного диабета «ДЛП» – 39 человек (23,93%); и пациенты с сахарным диабетом 2 типа без нарушений липидного обмена «СД2» -39 человек (23,93%). Для исследования особенностей состояния микробиома при различных типах дислипидемии пациенты групп «ДЛП» и «СД2+ДЛП» были разделены на подгруппы «ГХС» – пациенты с гиперхолитериномией – 33 человека (20,2%), «ГТГ» – пациенты с триглицериномией – 23 человека (14,1%), «СЧДЛ» – пациенты с сочетанной дислипидемией -50 человек (30,6%), а в группу сравнения объединили пациентов групп «К» и «СД2» общей численностью 57 человек (35,0%).
В главе 2 диссертации «Интегральная оценка нарушений углеводного и липидного обмена по концентрациям малых молекул микробного происхождения в крови» использовались различные комбинации групп.
В разделе 2.1. «Определение критериев интегральной оценки состояния микробиома лиц пожилого возраста при нарушении углеводного обмена» для сравнения критериев использовали основную группу, состоящую из пациентов групп «СД2+ДЛП» и «СД2» численностью 106 человек (65,0%), а группа сравнения состояла из групп «К» + «ДЛП» численностью 57 человек (35,0%).
В разделе 2.2.1. «Модель предиктивной диагностики сахарного диабета 2 типа по концентрациям малых молекул микробного происхождения в крови» использовали такую же комбинацию групп, как в разделе 2.1.
В разделе 2.2.2. «Модель предиктивной диагностики сочетанной дислипидемии по концентрациям малых молекул микробного происхождения в крови» для группы сравнения были отобраны пациенты из групп «К» + «СД2» – 57 человек (35%), а в основную группу были включены пациенты из групп «ДЛП» и «СД2+ДЛП» – 106 человек (35%).
В разделе 2.3. «Изучение методом математического моделирования концентраций малых молекул микробного происхождения в крови при разных типах ДЛП» использовали
подгруппы «ГХС» – 33 человека (20,2%), «ГТГ» – 23 человека (14,1%), «СЧДЛ» 50 человек (30,6%) и группу сравнения «К» + «СД2» – 57 человек (35%).
В главе 3 диссертации «Интегральная оценка состояния микробиома по содержанию микробных маркеров в крови» в разделе 3.1. «Оценка особенностей структуры микробиома у лиц пожилого возраста при различных вариантах нарушения липидного и углеводного обмена» использовали комбинацию групп пациентов аналогично разделу 2.2.2.
В разделе 3.2. «Оценка особенностей нарушения липидного обмена методом микробиом-ассоциированной экспосомики у лиц пожилого возраста» использовали комбинацию групп пациентов аналогично разделу 2.3.
Биохимические анализы крови для оценки нарушений углеводного и липидного обмена:
Диагностику нарушений липидного и углеводного обмена проводил врач- эндокринолог на основании анализа клинико-анамнестических данных, осмотра и физикального обследования, а также на основании результатов биохимических анализов. У пациентов определяли уровни биохимических показателей – концентрации в крови: глюкозы; триглицеридов (ТГ); общего холестерина (ОХС); холестерина липопротеидов низкой плотности (ХС ЛПНП); холестерина липопротеидов высокой плотности (ХС ЛПВП). Биохимическое определение концентраций проводили на автоматической системе биохимического и иммунологического анализа «Labcell». Пробоподготовка и выполнение анализа проводились в соответствии с инструкцией производителя.
Хромато-масс-спектрометрическое определение малых молекул микробного происхождения в крови
Малые молекулы микробного происхождения в крови определяли методом хромато- масс-спектрометрического анализа с использованием стандартных протоколов пробоподготовки и последующим использованием капиллярного газового хроматографа с масс-селективным детектором высокого разрешения.
Нарисунке1приведенытипичныехроматограммыальдегидов,жирных насыщенныхи ненасыщенных кислот, гидроксикислот, кампостерола исследованных колоний микроорганизмов микробиома человека, выбранных в качестве маркеров при гликолипидемии и диабете.
10:0 – Streptomyces; Actinobacteria
Ion 87.00 (86.70 to 87.70): ASTA-21.7Da–Lactobacillus;Firmicutes
Abundance
1600000 1400000 1200000 1000000
800000 600000 400000 200000
i16:0 – Clostridium; Firmicutes 16:111 – Ruminococcus; Firmicutes
10Me16 – Rhodococcus; Actinobacteria
Time–> 015.0015.5016.0016.5017.0017.5018.0018.5019.0019.50
Abundance 1600000
Ion 75.00 (74.70 to 75.70): ASTA-2.D
Рисунок 1 – Пример фрагмента хроматограммы: хроматографические пики
Площади пиков маркеров интегрировали автоматически по программе, прилагаемой к
выбранных маркеров
1400000
1200000
1000000 800000
хроматографу. Затем эти данные вводили в программу расчета, подготовленную в
400000
600000
электронных таблицах EXCEL. Для количественного расчета использовали данные
калибровки по дейтерированной тридекановой кислоте. Ошибка количественных измерений
200000
Time–> 015.0015.5016.0016.5017.0017.5018.0018.5019.0019.50
численности микроорганизмов из-за погрешности в подготовке проб и анализа, несоответствия состава жирных кислот чистых культур банка данных и изучаемого сообщества in situ не превышала 20%.
Полученные микробные маркеры относились к 5 группам химических соединений с длиной углеродной цепи от 10 до 26 атомов углерода: насыщенные альдегиды, гидроксикислоты, стерины, насыщенные и ненасыщенные жирные кислоты Полный перечень определяемых микробных маркеров с указанием соответствующих микроорганизмов и их филотипов указан в приложении текста диссертации. Расчет представленности филотипов в микробиоценозе проводили как отношение суммы концентраций соответствующих микробных маркеров к суммарному пулу микробных маркеров.
Оценку структуры микробиома проводили по соотношениям филотипов микроорганизмов, отношению B/F, суммарной концентрации всего определяемого пула микробных маркеров, концентрации плазмалогена и эндотоксина микробного происхождения.
Суммарный пул микробных маркеров определяли суммированием всех концентраций определяемых газовой хроматографией – масс-спектрометрией. Представленность филотипов Actinobacteria, Bacteroidetes, Proteobacteria, Firmicutes и Fungi определяли суммированием значений представленности всех микроорганизмов, относящихся к соответствующим филотипам. Полученные значения представленности Bacteroidetes делили на представленность Firmicutes и получали показатель B/F.
Концентрацию плазмалогена (мкг/мл) определяли по концентрации октадеценового альдегида (18:1а), который входит в состав клеточной стенки микроорганизмов, представителей индигенной нормобиоты, родов Bifidobacterium и Eubacterium.
Для определения концентрации эндотоксина в крови суммировали концентрации компонентов липида А – гидроксикислот: 3h12, 2h12, hi13, 3h13, 3h14, 2h14, 2hi15, 3hi15, h16, 3hi17, h18, h15, ЛПС клеточной стенки грамотрицательных бактерий: Acinetobacter, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia, Bacteroides hypermegas, Fusobacterium, Haemophylus, Sphingomonas, Flavobacterium, Porphyromonas, Prevotella, Bacteroides fragilis, Helicobacter pylory.
Математико-статистические методы.
В работе использованы методы вариационной статистики с вычислением средней арифметической и ее стандартной ошибки (М±SE) с использованием параметрических (t- критерий Фишера-Стьюдента) и непараметрических (U-критерий Вилкоксона) методов. Значимыми считали различия при р <0,05. Для оценки соответствия полученных результатов теоретической гипотезе использовали критерий согласия Пирсона - χ2. Расчеты проводились с использованием компьютерных программ Microsoft Office Excel 2010 и Statistica 8.0.» Для оценки прогностической точности и определения пороговых значений использовали ROC-анализ с помощью пакета программ автоматическое построение искусственных нейронных сетей программы Statistica 8.0. Оценку внутригрупповой изменчивости и взаимных корреляций использовали факторный анализ с помощью пакета программа Факторный анализ программы Statistica 8.0. Построение линейной дискриминантной функции концентраций МММП проводили с помощью пакета Discriminant Analysis программы Statistica 8.0. Оценку корреляционно ковариационной независимости переменных, отношение меры внутригрупповой изменчивости к мере общей изменчивости (лямбда Уилкса), классификацию результатов анализов исследуемых групп проводили с помощью решающих правил линейных дискриминантных функций. Положения, выносимые на защиту: 1. Для интегральной оценки состояния микробиома человека при нарушениях углеводного и липидного обмена необходимо использовать интегральные критерии, рассчитанные по соотношению концентраций микробных маркеров в крови. 2. Подходы микробиом-ассоциированной экспосомики позволяют количественно охарактеризовать состояние микробиома человека в зависимости от степени тяжести нарушений углеводного и липидного обмена у лиц пожилого возраста. 3. Между показателями нарушений липидного, углеводного обмена и показателями микробиом-ассоциированной экспосомики обнаруживаются разнонаправленные корреляции, указывающие на взаимосвязь состояния макроорганизма и микробиома. 4. Микробиом-ассоциированная экспосомика позволяет проводить скрининговую диагностику сахарного диабета 2 типа и дислипидемии у лиц пожилого возраста. Личное участие автора Автор участвовал в организации всех этапов исследования; выборе объекта, разработке методологии проведения данного научного исследования, включающего на первоначальных этапах биохимическое, хромато-масс-спектрометрическое исследование крови с последующей разработкой системы интегральной оценки микробиома на основе математического моделирования и статистической обработки результатов, обосновании выводов и практических рекомендаций. Хромато-масс-спектрометрические исследования выполнялись совместно с сотрудниками ФБУН МНИИЭМ им. Г.Н. Габричевского Роспотребнадзора д.б.н. Амерхановой А.М., и д.б.н. Затеваловым А.М. (математическое моделирование) Степень достоверности и апробация результатов исследования: О достоверности результатов работы свидетельствует достаточный объем исследований с применением современных высокочувствительных и специфичных методик, средств математического моделирования, адекватных методов статистической обработки полученных данных. Диссертация апробирована на заседании Ученого Совета ЗАО «ЭКОлаб». Основные положения диссертации доложены на: III Международном конгрессе «Профилактика и лечение метаболических нарушений и сосудистых заболеваний. Междисциплинарный подход», (Москва 2015 г.) VII Всероссийской научно-практической конференции молодых ученых и специалистов Роспотребнадзора «Современные проблемы эпидемиологии и гигиены», (Санкт-Петербург, 2015г.); XVII Всероссийский съезд дерматовенерологов и косметологов (Москва 2017 г.) VI Международном конгрессе «Профилактика и лечение метаболических нарушений и сосудистых заболеваний. Междисциплинарный подход», (Москва, 2018) Круглом столе "25 лет Геронтологическому обществу. Итоги и перспективы", организуемом совместно Московским отделением Геронтологического общества при РАН и Секцией Геронтологии МОИП МГУ (Москва, 2019); IV (XXVII) Национальном конгрессе эндокринологов «Инновационные технологии в эндокринологии» (Москва, 2021); DII (502-ом) Заседание Секции Геронтологии МОИП МГУ (Москва, 2021); IX Всероссийской научно-практической конференции с международным участием (on-line) «Микробиологические аспекты диагностики инфекционных заболеваний» (Ростов-на-Дону, 2021), VIII Всероссийская научно-практическая конфкренция с международным участием «Перспективы внедрения инновационных технологий в медицине и фармации»(Орехово-Зуево,2021). По материалам диссертации опубликовано 8 научных работ, в том числе 3 статьи в рецензируемыхизданиях,рекомендованных ВАК, всборникахнаучныхтрудовиматериалах конференций -5,изобретений-2. Объем и структура диссертации Материалы диссертации изложены на 150 страницах машинописного текста, иллюстрированы 31 таблицами, 16 рисунками. Диссертационная работа включает обзор литературы, материалы и методы исследования, две главы собственных исследований, заключение, выводы, практические рекомендации, список литературы, содержащий 46 отечественных и 171 зарубежных источника. ОСНОВНОЕ СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ Использование концентраций малых молекул микробного происхождения в крови для интегральной оценки нарушений углеводного и липидного обмена Использование концентраций микробных маркеров в крови для интегральной оценки нарушений углеводного и липидного обмена Интегральную оценку нарушений углеводного (СД2) и липидного (ДЛП) обмена пациентов характеризовали общими изменениями системы макроорганизм-микробиота. Для интегральной оценки структуры микробиома человека использовано определение концентрации бактериального плазмалогена и эндотоксина в крови. На основании проведенного исследования соотношения распространенности филотипов и в соответствии с данными литературы исследовали прогностическую точность показателя B/F и концентраций плазмалогена и эндотоксина в крови. Таблица 1 – Интегральные показатели состояния микробиома человека при нарушениях углеводного и липидного обмена Показатели Молекулярные маркеры бактериального плазмалогена Молекулярные маркеры бактериального эндотоксина Соотношение B/F Контроль 10[7,2-15,4] 0,3[0,2-0,5] 0,083 [0,076-0,103] Дислипидемия 14,4[8,6-16,6] 0,4[0,3-0,6] 0,098 [0,058-0,134] Сахарный диабет 2 типа 31,4[15,8-36,8]* 0,6[0,5-0,9]* 0,023 [0,012-0,107]* Сочетание дислипидемии и сахарного диабета 2 типа 20,7[12,4-39,6]* 0,5[0,3-0,6]* 0,019 [0,012-0,07]* Примечание: * отмечены значения, которые статистически значимо отличаются от группы контроля (p<0,05). В таблице 1 показано, что статистически значимое изменение концентраций эндотоксина и плазмалогена, а также показателя B/F были характерны только для группы СД2 и СД2+ДЛП. Для сравнения прогностической точности интегральных показателей сравнивали, результаты ROC-анализа концентрации плазмалогена, эндотоксина и B/F. Результаты ROC-анализа для концентраций бактериального эндотоксина и плазмалогена в крови пациентов представлены в таблице 2. Таблица 2 - Результаты ROC-анализа для концентраций бактериального плазмалогена и эндотоксина в крови пациентов с СД2 и группы сравнения Параметр AUC (Площадь ограниченная ROC-кривой) CutOff (Порог отсечения) Пороговая концентрация Чувствительность, % Специфичность, % Прогностическая точность,% плазмалогена 0,74 0,39 20,66 мкг/мл 89,4 54,9 68,5 Значения для эндотоксина 0,75 0,46 0,48 нмоль/мл 80,5 52,8 65,5 B/F 0,80 0,46 0,049 ед. 78,3 50,9 68,7 В таблице 2 показано, что значения AUC для представленных параметров выше 0,5. Это указывает на возможность диагностики сахарного диабета 2 типа в данной возрастной группе по значениям концентраций бактериального плазмалогена, эндотоксина в крови и показателя B/F, используя пороговые значения 20,66 мкг/мл плазмалогена в крови, 0,48 нмоль/мл эндотоксина и 0,049 ед. показателя B/F. Концентрации бактериального плазмалогена и эндотоксина в крови обладают одинаковой прогностической точностью, а показатель B/F немного выше. Расчет качественных характеристик моделей, представленный в таблице 2, показал, что все исследуемые показатели имеют прогностическую точность, чувствительность и специфичность на одном уровне. Незначительно выше чувствительность и специфичность для показателя концентрация плазмалогена. Создание математических моделей предиктивной диагностики сахарного диабета 2 типа и дислипидемий по концентрациям малых молекул микробного происхождения в крови Были созданы модели предиктивной диагностики сахарного диабета 2 типа и сочетанной дислипидемии по концентрациям малых молекул микробного происхождения в крови. Для этого использовали метод линейного дискриминантного анализа с группировкой по комбинации групп, соответствующих задачи классификации модели. Для расчета уникального соотношения концентраций малых молекул микробного происхождения использовали все концентрации микробных маркеров с последующим исключением из модели согласно алгоритму дискриминантного анализа. Математическая модель СД2 была построена методом линейного дискриминантного анализа при помощи алгоритма пошагового исключения компонентов с анализом сопряженности. Основная группа состояла из групп «СД2» + «СД2+ДЛП» численностью 106 человек. Группа сравнения состояла из групп «К» + «ДЛП» численностью 57 человек. В результате проведенного алгоритма исключения компонентов модель включала компоненты: 3h14, 10Me16, i19, i17:1d9, Cholestendiol, 16:1d9t, 2h24. Модель СД2 имела 85,89 % прогностической точности, при 80,35 % специфичности и 88,78 % чувствительности. Дискриминантная функция представлена уравнением: Root = -18,3297*3h14 - 2,1188*10Me16 + 0,1034*i19 - 9,8878*i17:1d9 - 0,0956*Cholestendiol + 0,5773*16:1d9t - 0,4458*2h24 + 1,2555. Координаты центроидов: группа сравнения=1,128949, основная группа = -0,607077. Квадрат расстояний Махалонобиса между центроидами равен 3,014 (p= 3,46.10-15), что указывает на статистическую значимость показателей, полученных при использовании модели. Математическая модель СЧДЛ так же была построена методом линейного дискриминантного анализа при помощи алгоритма пошагового исключения компонентов с анализом сопряженности. Основная группа состояла из подгруппы «СЧДЛ» численностью 57 человек. Группа сравнения состояла из групп «К» + «СД2» численностью 40 человек. В результате проведенного алгоритма исключения компонентов модель включала компоненты: 9-изогептадеценовой кислоты (17:1d9); 11-эйкозеновой кислоты (20:1d11); изомиристинового альдегида (i14a). Модель «СЧДЛ» имела 75,26 % прогностической точности, при 78,94 % специфичности и 78,95 % ,чувствительности. Дискриминантная функция представлена уравнением: D = - 4,12882*17:1d9+0,62329*20:1d11-0,68546*i14+1,74258. Координаты центроидов: группа сравнения=0,74619, основная группа = -0,52364. Квадрат расстояний Махалонобиса между центроидами равен 1,6124 (p= 0,000001), что указывает на статистическую значимость показателей, полученных при использовании модели. Математическая модель ДЛП. так же была построена методом линейного дискриминантного анализа при помощи алгоритма пошагового исключения компонентов с анализом сопряженности. Пациенты с дислипидемией (ДЛП) были разделены на 3 группы гиперхолестеринемия (ГХС) – 38 человек, гипертриглицеридемия (ГТГ) – 27 человек и сочетанная дислипидемия (СЧДЛ) – 57 человек в соответствии с классификацией Фредриксона. Пациенты без ДЛП были определены в группу «норма» - 40 человек. В результате проведенного алгоритма исключения компонентов модель включала компоненты: i16:1d9, 16:1d7, 10h18, изомиристинового альдегида (i14a). В группе сравнения 50% объектов классифицированы корректно. В группах ГХС корректность классификации составляет – 15,8%, СЧДЛ – 70,2%, ГТГ – 18,5%. По результатам качественных характеристик модели отмечается что 43,8% случаев имеют правильную классификацию. Прогностическая точность модели «ДЛП» 43,8%, чувствительность – 51,5%, специфичность – 31,7%. Для оценки степени и направленности изменений состояния микробиома при различных видах дислипидемии оценивали расположение их центроидов в дискриминантном пространстве и статистическую значимость расстояний Махалонобиса между центроидами. Каждый результат анализа можно представить в виде точки в координатах дискриминантного пространства, которые рассчитываются по 3 дискриминантным уравнениям (Root1, Root2, Root3) Расположение центроидов исследуемых групп представлено на рисунке 2: ГТГ Н ГХС СЧДЛ Рисунок 2– 3D график, иллюстрирующий расположение центроидов для исследуемых групп с различными видами дислипидемии в дискриминантном пространстве. 08 6 , , 5 0 R o1 o t 0 ,, , -0 , 0 - 02 01 4 03 0 , 0, 0,1 4, - , , 0 2 - , 0 - , t , , oo 6 0, 5 , , , -, R 0 - t 2 0 , , , - 00 1 , 2 03 0 o2 o -, , , , - 3 - , R Примечание: В овал, обозначенный пунктирной линией, заключены центроиды групп, между которыми нет статистически значимой разницы (p <0,05). На рисунке 2 показано, что группа ГХС находится ближе всех к группе «норма», а соотношения концентраций малых молекул микробного происхождения для этих пациентов не имеют статистически значимых отличий от пациентов из этой группы. Группа ГТГ находится дальше всех от нормы, что указывает на максимальные изменения соотношений концентраций исследуемых веществ в крови у пациентов этой группы. Изменения концентраций в группе СЧДЛ практически равноудалены от группы «норма» и ГТГ, что указывает на специфичность изменений, не похожую на норму или ГТГ. Нарушения липидного обмена по типу ГХС в пожилом возрасте наблюдаются как результат системного воспаления, в котором могут участвовать метаболиты микробного происхождения в частности эндотоксин. В результате локального воспаления на стенке сосудов откладываются макрофагами эфиры холестерола, которые затем преобразуются в моногидраты холестерина. Образующаяся бляшка приводит к окклюзии сосудов. Накопление холестерола в интиме при ГХС может быть реакцией на атерогенез сосудистой стенки. Патогенные явления атерогенеза связаны с дисфункцией и активацией эндотелия, адгезией, активацией и миграцией моноцитов/макрофагов, локальным окислительным стрессом, отложением липидов, синтезом внеклеточного матрикса (ЕСМ), миграцией гладкомышечных клеток (ГМК) и пролиферацией и неоваскуляризацией бляшки. По этой причине изменения в микробиоме не имеют статистически значимых различий с нормой. ГХС характеризуется увеличением концентрации ЛПНП в крови, которые являются конечным продуктом процессинга ЛП в крови. Гипертриглицеридемия является одним из наиболее тяжелых форм нарушения липидного обмена. Она вызвана накоплением ЛПОНП, что указывает на нарушения процессинга ЛП на первом этапе. Это может быть обусловлено патологией печени (жировое перерождение) или дисфункцией жировой ткани. Для гипертриглицеридемии характерно сочетание неблагоприятных факторов (курение, нерациональное питание, алкоголизм и старение населения), которое приводит к необратимому нарушению липидного обмена, выражающемуся в увеличении уровня триглицеридов в крови. Функциональная активность микробиома статистически значимо изменяется, что мы наблюдаем на рисунке 2. Сочетанная дислипидемия является самой тяжелой формой дислипидемии. Она вызвана накоплением в крови липопротеидов промежуточной плотности (ЛППП), что указывает на нарушения процессинга, связанного либо с дисфункцией жировой ткани, либо с нарушением функции ЛПВП. Большое расстояние между ГТГ и СЧДЛ показывает высокую степень влияния микробных маркеров на системный метаболизм энергетических субстратов (глюкозы и ЖК), приводящих к одновременному проявлению увеличения концентраций холестерина и триглицеридов. Таким образом, методом математического моделирования были определены значимые МММП, которые могут являться предиктивными критериями развития ДЛП разного типа в возрастной группе 45-90 лет. Оценка особенностей нарушения углеводного и липидного обмена с использованием микробиом-ассоциированной экспосомики у лиц пожилого возраста Для характеристики структуры микробиома при нарушениях углеводного и липидного обмена провели сравнение показателей представленности по филотипам микробиома. Результаты представлены в таблице 3. Таблица 3 - Распространенность филотипов микробиома при разных вариантах сочетаний состояния углеводного и липидного обмена у лиц пожилого возраста Показатели Контроль Дислипидемия Сахарный диабет 2 типа Сочетание дислипидемии и сахарного диабета 2 типа Actinobacteria Bacteroidetes Proteobacteria Firmicutes Fungi Суммарная микробных маркеров в крови 9,1[8,5-9,5] 5,9[5,4-7] 70,2[69,1-73,2] 34,4[28,8-38,6] 20,9[18,7-22,5] 105[85,1-165] 11,1[8,7-12,3]* 6,7[4,3-8,5] 65,7[62,6-70,9]* 29,4[26,7-35,6]* 23,8[20,3-26] 149,8[99,3-195,6] 9,9[8,8-11,7] 1,3[0,8-7]* 66,5[63,7-70,8]* 25,3[22,7-28,5]* 22,5[21-26,9]* 208,6[150,9-243,9]* 10,1[8,8-11,8]* 1,1[0,8-4,9]* 66,3[62,1-69,9]* 26,7[21,4-30,9]* 24,2[21,1-28,3]* 176,2[121,9-220,8]* концентрация Примечание: * отмечены значения, которые статистически значимо отличаются от группы контроля (p<0,05). В таблице 3 показано, что микроорганизмы филотипа Actinobacteria увеличивают свою представленность при дислипидемии, в том числе ассоциированную с сахарным диабетом 2 типа. Bacteroidetes снижают представленность при сахарном диабете 2 типа, в том числе ассоциированным с дислипидемией. Филотипы Proteobacteria и Firmicutes снижают представленность при нарушениях липидного, углеводного обмена и при их сочетании, а царство Fungi увеличивает представительность при нарушении углеводного обмена. Установлено, что при нарушении углеводного обмена наблюдается значимое увеличение компонентов малых молекул микробного происхождения в крови, что может быть связано с нарушением проницаемости кишечной стенки. Таким образом, нарушения липидного обмена связаны с ростом численности Actinobacteria, а нарушения углеводного обмена - со снижением Bacteroidetes. С помощью факторного анализа определяли корреляции показателей представленности филотипов микробиома при разных вариантах сочетаний состояния углеводного и липидного обмена. Proteobacteria Firmicutes Bacteroidetes 1,0 0,5 0,0 -0,5 -1,0 Fungi Actinobacteria K ДЛП СД2 СД2+ДЛП Рисунок 3 – Результаты факторного анализа представленности филотипов микробиоценоза при различных вариантах сочетаний состояния углеводного и липидного обмена На рисунке 3 показано, что филотипы Actinobacteria и Fungi имеют высокие показатели прямой корреляции с фактором 1, а Proteobacteria имеют высокие показатели обратной корреляции с фактором 1 во всех исследуемых группах. Коэффициент корреляции Bacteroidetes снижается в ряду К – ДЛП – СД2 – ДЛП+СД2. Коэффициент корреляции филотипа Firmicutes изменяется в группах в области статистически не значимых значений. Таким образом, соотношение распространенности Bacteroidetes к Firmicutes наиболее перспективно для интегральной оценки структуры микробиома человека при метаболических нарушениях. Таблица 4 - Частота встречаемости показателей вне нормы у пациентов с нарушением углеводного и липидного обмена Группы Показатели Микробные маркеры бактериального плазмалогена Микробные маркеры бактериального эндотоксина Соотношение B/F Примечание: * отмечены значения, которые статистически значимо отличаются от группы контроля (p<0,05). Из анализа частоты встречаемости показателей вне нормы (Таблица 4) можно отметить что при нарушении углеводного обмена статистически значимо увеличивается число пациентов с показателями вне нормы для концентрации плазмалогена, эндотоксина и соотношения B/F. А при нарушении липидного обмена статистически значимо увеличивается число пациентов с соотношением B/F вне нормы. Рост концентрации плазмалогена и эндотоксина в крови может быть связан с нарушением проницаемости кишечной стенки, что подтверждается аналогичным увеличение концентрации компонентов клеточной стенки микроорганизмов в крови при нарушении углеводного обмена. Изменение структуры микробиома описываемое соотношением B/F более чувствительно к изменениям в макроорганизме. Исследование корреляционной связи между концентрациями биохимических показателей нарушений углеводного и липидного обмена с представленностью филотипов микроорганизмов представлено в таблице 5. Таблица5- Результатыкорреляционногоанализаконцентрацийбиохимическихпоказателей нарушений углеводного и липидного обмена с представленностью филотипов микроорганизмов Конт- роль Дисли- пидемия Сахарный диабет 2 типа Сочетание дисли-пидемии и сахарного диабета 2 типа 11,1 15,4 69,2* 33,3 33,3 69,2* 5,6 15,4* 56,4* 50,7* 53,7* 68,7* Показатель ОХС ТГ ХС ХС Глюко ЛПНП ЛПВП за Контроль ОХС ТГ ХС ХС Глюко ЛПНП ЛПВП за Дислипидемия B/F 0,12 -0,47 0,15 0,18 0,63 0,02 0,10 Actinobacteria 0,21 -0,42 0,29 -0,02 0,55 0,13 0,15 Bacteroidetes 0,09 -0,46 0,14 0,15 0,64 0,02 0,13 Proteobacteria -0,14 0,37 -0,15 -0,22 -0,62 0,02 0,07 Firmicutes 0,04 0,23 0,03 -0,23 -0,91 -0,19 0,06 Fungi 0,10 -0,32 0,09 0,27 0,57 -0,08 -0,18 0,14 -0,20 0,21 0,10 0,01 -0,15 0,15 -0,23 0,26 -0,04 0,02 0,30 -0,16 -0,22 0,35 0,02 0,00 -0,34 15 Показатель ОХС ТГ ХС ХС Глюко ЛПНП ЛПВП за Сахарный диабет 2 типа B/F 0,01 0,44 B/F 0,01 0,44 Actinobacteria -0,26 0,10 -0,28 -0,16 0,02 Bacteroidetes 0,03 0,45 -0,20 0,11 -0,29 Proteobacteria 0,18 -0,13 0,29 0,04 0,05 Firmicutes 0,14 0,04 -0,24 -0,07 -0,39 Fungi -0,13 0,12 -0,27 0,01 -0,05 Продолжение таблицы 5 ОХС ТГ ХС ХС Глюко ЛПНП ЛПВП за Сахарный диабет 2 типа при дислипидемии B/F 0,01 0,07 0,12 0,08 -0,11 -0,06 -0,08 0,03 -0,04 0,02 0,06 0,44 B/F 0,01 -0,04 0,22 0,18 0,00 -0,10 -0,31 0,06 -0,23 -0,06 0,07 -0,10 -0,20 -0,07 0,18 0,02 Примечание: Полужирным курсивом выделены коэффициенты корреляции Пирсона, имеющие статистическую значимость (p<0,05). По данным, представленным в таблице 5 можно отметить, что при сахарном диабете 2 типа есть прямая корреляционная связь между уровнем триглицеридов и представленностью Bacteroidetes. Отмечается обратная сильная корреляционная связь в группе сравнения между уровнем глюкозы и представленностью Firmicutes. Обратная корреляционная связь, но меньшей силы отмечается между этими параметрами в группе сахарный диабет 2 типа. Это может быть связано с разнородностью филотипа Firmicutes, который имеет в своем составе микроорганизмы с различными метаболическими путями, обеспечивающими быстрое переключение микробного пищеварения с одного субстрата на другой. При дислипидемии корреляционные связи не обнаруживаются. Для оценки зависимости состояния микробиом-ассоциированного экспосома по показателю коэффициентов уникальности моделей СД2 и СЧДЛ и уровня основных биохимических показателей проанализированы результаты корреляционного анализа, представленные в таблице 6. Таблица 6 - Коэффициенты корреляции основных показателей углеводного и липидного обмена и коэффициентов уникальности моделей СЧДЛ и СД2 Коэффициент уникальности модели СЧДЛ Коэффициент уникальности модели СД2 ГС ДЛП СД2 СД2+ДЛП 0,153 0,119 -0,015 0,031 0,114 -0,050 0,120 -0,238 0,228 0,107 0,034 0,161 0,220 0,240 0,151 -0,092 0,269 -0,503 0,388 0,323 ГС ОХС -0,180 ТГ -0,132 ХС ЛПНП -0,168 ХС ЛПВП 0,149 Глюкоза 0,706 ДЛП 0,057 0,368 -0,060 0,416 -0,185 СД2 0,250 0,364 0,063 -0,012 -0,371 СД2+ДЛП 0,196 0,400 0,041 -0,145 -0,255 Примечание: Полужирным курсивом выделены коэффициенты корреляции Пирсона, имеющие статистическую значимость (p<0,05). В таблице 6 показано, что коэффициент уникальности СЧДЛ, характеризующий степень тяжести нарушений липидного обмена, связан прямой корреляционной связью с уровнем триглицеридов, которая прослеживается и при нарушении углеводного обмена, и при сочетании нарушений углеводного и липидного обмена. При дислипидемии также имеется прямая корреляционная связь с уровнем холестерина липидов высокой плотности. Которая не прослеживается при нарушении углеводного обмена, в том числе в сочетании с нарушением липидного обмена. Наблюдается слабая обратная корреляционная связь с уровнем глюкозы при сахарном диабете 2 типа, которая не прослеживается при присоединении дислипидемии. Коэффициент уникальности СД2, характеризующий степень тяжести нарушений углеводного обмена, связан обратной корреляционной связью с уровнем глюкозы при дислипидемии, и прямой корреляционной связью при сахарном диабете 2 типа. На основании представленных данных можно утверждать, что нарушения углеводного обмена сопровождаются эндотоксемией, связанной с нарушением проницаемости кишечной стенки, что приводит к увеличению содержания в крови общего пула компонентов клеточной стенки микроорганизмов, бактериального плазмалогена, и эндотоксина. Нарушения углеводного обмена сопровождаются подавлением роста в первую очередь Bacteroidetes, а также Proteobacteria и Firmicutes. При сахарном диабете снижается показатель соотношения B/F. Отмечается прямая корреляция уровня глюкозы и коэффициента уникальности модели СД2 при сахарном диабете 2 типа и обратная корреляция при дислипидемии. Нарушения липидного обмена характеризуются увеличением представленности Actinobacteria и снижением показателя соотношения B/F. Отмечаются корреляции состояния микробиома, характерного для сочетанной дислипидемии с большинством биохимических показателей нарушения липидного обмена и с уровнем глюкозы. Оценка особенностей нарушения липидного обмена у лиц пожилого возраста с использованием подходов микробиом-ассоциированной экспосомики Для характеристики структуры микробиома при различных проявлениях нарушений липидного обмена провели сравнение показателей представленности по филотипам микробиома. Результаты представлены в таблице 7. Таблица 7 – Распространенность филотипов микробиома при разных проявлениях липидного обмена у лиц пожилого возраста Показатели Контроль Дислипидемия Сахарный диабет 2 типа Сочетание дислипидемии и сахарного диабета 2 типа Actinobacteria Bacteroidetes Proteobacteria Firmicutes Fungi 9,4[8,5-10] 4,4[0,8-6,7] 69,6[65,1-72,2] 27,3[23,1-35,5] 21,7[19,4-25,9] 10,4[9,4-12,3]* 4,3[1,1-7,7] 64,1[60,4-70,5]* 27,4[22,6-33,6] 25,5[20,7-28,2] 10,2[8,9-11,8] 1,4[0,8-7,1] 65,9[63,3-69,3] 28,3[23,3-30,2] 24,1[21,7-27,4] 10,3[8,6-11,8]* 4,2[0,9-6,2] 67[62,8-70,3] 28,2[22,5-30,3] 23,8[20,8-26,1] Суммарная концентрация микробных маркеров в крови 146[107,5-208,6] 131,1[88,2-200,5] 186,3[165,8-209,8] 184,1[145,5-244,7]* Примечание: * отмечены значения, которые статистически значимо отличаются от группы контроля (p<0,05). В таблице 7 показано, что микроорганизмы филотипа Actinobacteria увеличивают свою представленность при гиперхолестиринемии и сочетанной дислипидемии. Филотип Proteobacteria снижает представленность при гиперхолестиринемии. Статистически значимое увеличение компонентов клеточной стенки в крови наблюдается при сочетанной дислипидемии. Таблица 8 - Частота встречаемости показателей вне нормы у пациентов с нарушением углеводного и липидного обмена Группы гипер- триглице- ринемия Микробные маркеры бактериального плазмалогена Микробные маркеры бактериального эндотоксина Соотношение B/F Примечание: * отмечены значения, которые статистически значимо отличаются от группы контроля (p<0,05). Показатели Конт- роль гипер- холести- ринемия сочетанной дисли- пидемия 41,5 26,3 43,9 34,2 46,3 42,1 51,9 * 49,1 66,7 * 57,9 48,1 47,4 17 Из анализа частоты встречаемости показателей вне нормы (Таблица 8) можно отметить, что при гипертриглицеринемии статистически значимо увеличивается число пациентов с показателями вне нормы для концентрации плазмалогена, эндотоксина. Исследование корреляционной связи между концентрациями биохимических показателей нарушений липидного обмена с представленностью филотипов микроорганизмов представлено в таблице 6. Таблица 9 - Результаты корреляционного анализа концентраций биохимических показателей нарушений липидного обмена с представленностью филотипов микроорганизмов ОХС ТГ ХС ХС Глю- ОХС ЛПНП ЛПВП коза ТГ ХС ХС Глю- коза -0,331 -0,110 -0,346 -0,013 -0,036 0,085 -0,518 0,178 -0,531 В таблице 9 показано, что уровень глюкозы в группе контроль имеет обратную корреляцию с Bacteroidetes, Firmicutes, а также с соотношением B/F. В группе Гипертриглицериномия наблюдается обратная корреляция уровня глюкозы с Firmicutes, а при сочетанной дислипидемии с Bacteroidetes. Холестерин липидов низкой плотности имеет прямую корреляцию с представленностью Proteobacteria и обратную корреляцию с Fungi. Для холестерина липидов высокой плотности наблюдается зеркальная картина обратной корреляции с представленностью Proteobacteria и прямая корреляция с Fungi. В группе Сочетанная дислипидемия уровень триглицеридов имеет обратную корреляцию с Proteobacteria и прямую с Fungi. Таким образом, наблюдается обратная корреляционная связь во всех группах кроме группы Гиперхолистериномии между уровнем глюкозы и представленностью Bacteroidetes и Firmicutes, а представленностью Proteobacteria и Fungi связано с уровнями триглицеридами и липидов низкой и высокой плотности. Для оценки зависимости состояния микробиом-ассоциированного экспосома по показателю коэффициентов уникальности моделей СД2 и СЧДЛ и уровня основных биохимических показателей проанализированы результаты корреляционного анализа, представленные в таблице 10. ЛПНП ЛПВП Гиперхолестиринемия B/F Actinobacteria Bacteroidetes Proteobacteria Firmicutes Fungi B/F Actinobacteria Bacteroidetes Proteobacteria Firmicutes Fungi -0,008 -0,148 -0,009 0,066 0,034 -0,034 Контроль -0,105 -0,056 -0,004 -0,160 -0,088 -0,055 -0,009 0,172 0,245 -0,081 0,006 -0,154 -0,155 -0,493 -0,038 0,186 -0,188 -0,526 -0,121 -0,124 -0,287 -0,550 0,178 0,138 0,056 0,129 0,044 -0,115 -0,125 0,091 0,222 0,030 0,235 0,046 0,127 -0,094 -0,091 -0,067 0,123 0,215 -0,117 0,230 -0,066 0,090 -0,020 0,216 -0,068 -0,171 0,067 -0,030 -0,137 0,181 -0,084 Гипертриглицеридемия Сочетанная дислипидемия 0,119 -0,222 0,163 0,263 0,219 -0,254 0,056 0,083 0,049 0,204 -0,148 -0,237 -0,366 -0,194 0,532 0,179 -0,211 -0,084 0,327 0,206 -0,244 -0,102 -0,565 -0,081 -0,310 -0,558 -0,191 0,236 -0,217 -0,327 -0,078 0,324 0,158 -0,031 0,167 0,139 0,105 -0,189 0,002 0,195 -0,013 -0,143 -0,028 0,058 -0,089 -0,319 0,044 0,600 0,042 -0,113 Примечание: Полужирным курсивом выделены коэффициенты корреляции Пирсона, имеющие -0,314 -0,535 статистическую значимость (p<0,05). Таблица 10 - Коэффициенты корреляции основных показателей углеводного и липидного обмена и коэффициентов уникальности СЧДЛ и СД2 при нарушении липидного обмена у лиц пожилого возраста КУ СЧДЛ КУ СД2 ГС ОХС -0,146 ТГ -0,048 ХС ЛПНП -0,102 ХС ЛПВП -0,035 Глюкоза 0,054 ГХС -0,005 0,076 -0,289 0,336 -0,324 СЧДЛ 0,049 0,195 -0,111 -0,021 -0,326 ГТГ -0,338 0,364 -0,324 0,063 0,060 ГС -0,174 0,023 -0,075 0,284 0,580 ГХС 0,167 0,115 0,085 0,126 0,421 СЧДЛ ГТГ -0,263 -0,499 0,148 0,040 -0,193 -0,199 -0,034 0,414 0,411 0,255 Примечание: Полужирным курсивом выделены коэффициенты корреляции Пирсона, имеющие статистическую значимость (p<0,05). Значения коэффициентов, приведённых в таблице 10, показывают, что при нарушении липидного обмена в группе сравнения и группе СЧДЛ увеличение содержания глюкозы приводит к увеличению коэффициента уникальности СД2, что соответствует современным представлениям. Увеличение коэффициента уникальности СД2 при снижении ОХС может быть связано с тем, что ОХС является препятствующим фактором для развития сахарного диабета при ГТГ и СЧДЛ. Компьютерная программа предиктивной диагностики сахарного диабета 2 типа по концентрациям малых молекул микробного происхождения в крови Полученные в результате математического моделирования классификационные уравнения имеют диагностическую ценность, так как по состоянию экспосома указывают на наличие сахарного диабета 2 типа и сочетанной дислипидемии. Для внедрения в работу исследователей, использующих предиктивную диагностику в своей практике, были написаны программы для ЭВМ «Дислипидемия-скрин» и «Диабет-скрин». Программа «Дислипидемия – скрин» предназначена для определения принадлежности пациента к группе риска нарушений липидного обмена по концентрациям микробных маркеров в крови. Исходными данными для программы являются концентрации 9- изогептадеценовой кислоты (17:1d9); 11-эйкозеновой кислоты (20:1d11); изомиристинового альдегида (i14a) в крови. Полученный результат с прогностической точностью 75,26% укажет принадлежность пациента к группе риска нарушений липидного обмена. Программа "Диабет - скрин" предназначена для предиктивного анализа состояния здоровья пожилого человека, в результате которого определяется принадлежность пациента к группе риска развития сахарного диабета 2 типа. Исходными данными для предиктивного анализа являются концентрации малых молекул микробного происхождения в крови, определяемые методом газожидкостной хроматографии и масс-спектрометрии. Исходными данными для предиктивного анализа являются концентрации 3-гидроксимиристиновой, 10- метил-гексадекановой, изононадекановой, 9-изогептатадеценовой, транс-9-гексадеценовой, 2- гидрокситетракозановой кислот и холестендиола в крови. Полученный результат с прогностической точностью 85,89% укажет принадлежность пациента к группе риска нарушений липидного обмена. Программа реализована в виде приложения MS Windows 10, имеет дружественный и интуитивно понятный интерфейс. Заключение. По концентрациям микробных маркеров в крови исследована система взаимодействия макроорганизм – микробиом человека у пожилых людей с нарушениями углеводного и липидного обмена. В результате исследований были выбраны критерии интегральной оценки микробиома по концентрациям микробных маркеров микроорганизмов в крови, а именно концентрация бактериального плазмалогена и эндотоксина в крови, а также соотношение Bacteroidetes/Firmicutes (B/F) характеризующее структуру микробиома. В результате проведенных исследований получены критические значения для концентрации бактериального плазмалогена (20,66 мкг/мл), эндотоксина (0,48 нмоль/мл) и соотношения B/F (0,049 ед.), рассчитанные на основании определения концентраций малых молекул микробного происхождения в крови, превышение которых с высокой степенью достоверности свидетельствует о структурных изменениях микробиома, характерных для развития сахарного диабета 2 типа. Используя подходы микробиом-ассоциированной экспосомики, были получены классификационные уравнения линейного дискриминантного анализа для предиктивной диагностики риска развития сахарного диабета 2 типа и риска развития сочетанной дислипидемии. Получены критерии оценки степени изменения микробиома при сахарном диабете 2 типа и при сочетанной дислипидемии, которые называются коэффициентами уникальности и позволяют количественно оценить динамику заболевания. Полученные математические модели имеют высокие прогностические показатели: модель «СД2» - 85,89 % прогностической точности; модель «СЧДЛ» - 75,26 % прогностической точности. Прогностическая точность интегральных критериев оценки микробиома не превышала 69%. С помощью линейного дискриминантного анализа была построена модель «ДЛП», позволяющая по концентрациям микробных маркеров в крови определить степень и направленность изменения микробиома при различных вариантах нарушений липидного обмена. С помощью модели «ДЛП» выявлено статистически незначимое изменение соотношений микробных маркеров при гиперхолестиринемии по отношению к норме, при одинаковой степени и различной направленности изменений состояния микробиома при гипертриглицеринемии и сочетанной дислипидемии. Исследование представленности филотипов микробиома человека по концентрациям микробных маркеров в крови выявило различное изменение структуры при нарушениях липидного и углеводного обмена. Нарушение липидного обмена характеризуется увеличением представленности Actinobacteria, а нарушения углеводного обмена подавлением Bacteroidetes. При нарушении углеводного обмена за счет увеличения проницаемости кишечной стенки увеличивается суммарное количество компонентов клеточной стенки микроорганизмов в крови, количество бактериального плазмалогена и эндотоксина. С помощью корреляционного анализа обнаружена обратная корреляционная связь между уровнем глюкозы и представленностью Firmicutes в норме и при сахарном диабете 2 типа. При дислипидемии корреляционная связь не обнаруживается, что указывает на высокую поливалентность Firmicutes при выборе субстрата. При сахарном диабете 2 типа выявлена прямая корреляционная связь между уровнем триглицеридов в крови и представленностью Bacteroidetes. Коэффициент уникальности модели СЧДЛ показал разнонаправленные корреляции с биохимическими показателями липидного обмена при дислипидемии и сахарном диабете 2 типа, что указывает на его высокую информативность. Коэффициент уникальности модели СД2 показал прямую корреляцию с уровнем глюкозы при сахарном диабете 2 типа и обратную при дислипидемии. Исследование представленности филотипов микроорганизмов при различных проявлениях дислипидемии показало увеличение представленности Actinobacteria и снижение Proteobacteria при гиперхолистеринемии. Корреляции представленности филотипов микроорганизмов и показателей нарушения липидного и углеводного обмена выявил разнонаправленные корреляции Proteobacteria и Fungi при гипертриглицеринемии в отношении уровня холестерина низкой и высокой плотности, а при сочетанной дислипидемии в отношении триглицеридов. Уровень глюкозы имеет обратную корреляцию с Firmicutes при гипертриглицериномии и с Bacteroidetes при сочетанной дислипидемии. Коэффициент уникальности модели СЧДЛ не имел корреляций ни с одним из биохимических показателей углеродного и липидного обмена. Коэффициент уникальности модели СД2 показал прямую корреляцию с уровнем глюкозы и обратную с общим холестериновым числом при гипертриглицеринемии и сочетанной дислипидемии. Для внедрения полученных результатов в сферу практического здравоохранения разработана программа для ЭВМ. Программа позволяет использовать результаты предиктивного анализа для диагностики сахарного диабета 2 типа по состоянию микробиома пациентов. Выводы 1. С помощью концентраций микробных маркеров в крови определены критерии структуры микробиома человека, а именно представленность Actinobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes, Proteobacterium, Fungi соотношение B/F, суммарная концентрация микробных маркеров в крови, концентрация бактериального плазмалогена и бактериального эндотоксина. 2. Интегральной характеристикой состояния микробиома человека при нарушении углеводного обмена являются концентрации бактериального эндотоксина и плазмалогена в крови. Определены пороговые значения концентраций бактериального плазмалогена и эндотоксина в крови, а также показателя B/F (20,66 мкг/мл, 0,48 нмоль/мл и 0,049 ед. при AUC=0,74, 0,75 и 0,8 соответственно), изменения уровня которых в сравнении с референсными значениями указывают на высокий риск развития СД2. 3. С помощью линейного дискриминантного анализа концентраций микробных маркеров в крови созданы математические модели для микробиом-ассоциированной экспосомики, характеризующие нарушения углеводного обмена («СД2»), нарушения липидного обмена («СЧДЛ») и оценки состояния микрорбиома при различных типах дислипидемии («ДЛП»). Модели СД2, СЧДЛ, ДЛП имеют высокие прогностические показатели - 85,89%, 75,26% и 43,8% прогностической точности, 80,35%, 70% и 31,7% специфичности и 88,78%, 78,95% и 51,5% чувствительности соответственно. 4. Нарушения углеводного обмена у лиц пожилого возраста характеризуются увеличением суммарной концентрации микробных маркеров, бактериального плазмалогена и бактериального эндотоксина в крови, снижением представленности Bacteroidetes в микробиоме и снижением критерия структуры микробиома B/F. Увеличение уровня глюкозы в крови при нарушении углеводного обмена связано с изменениями структуры экспосома характерного для сахарного диабета 2 типа (R=0,388; р <0,05). 5. Нарушения липидного обмена у лиц пожилого возраста характеризуются увеличением представленности Actinobacteriа. При различных типах нарушений липидного обмена установленнаякорреляционнаясвязьТГ, ХСЛПНПиХСЛПВПспредставленностью филотипов Proteobacteria и Fungi. Уровень глюкозы связан обратной корреляцией с представленностью Bacteroidetes и Firmicutes при нарушениях липидного обмена и в группе сравнения. 6. Для скрининговой диагностики сахарного диабета 2 типа и сочетанной дислипидемии разработан алгоритм расчета, реализованный в программах «Дислипидемия-скрин» и «Диабет-скрин», позволяющий с высокой прогностической точностью устанавливать диагноз СД2 и сочетанной дислипидемии. Практические рекомендации: 1.Оценка степени нарушений углеводного и липидного обмена должна проводиться с учетом концентрации бактериального плазмалогена и эндотоксина в крови: для бактериального плазмалогена 20,66 мкг/мл и ниже; для бактериального эндотоксина 0,48 нмоль/мл и ниже. 2 Для скрининговых исследований сахарного диабета 2 типа и сочетанной дислипидемии можно использовать предиктивную диагностику, основанную на определении специфического соотношения малых молекул микробного происхождения в крови, реализованную в программе «Диабет-скрин» Перспективы дальнейшей разработки темы Полученные результаты могут быть с успехом использоваться современной физико- химической биотехнологии, в практическом здравоохранении и являются частью персонифицированной медицины, которая эффективна за счет выявления групп риска и прогноза развития заболеваний для коррекции профилактических или лечебных мер с учетом индивидуальных особенностей здоровья пациента, ранней диагностики диабета 2 и 3 типа (в том числе болезни Альцгеймера), нарушении липидного метаболизма, атеросклероза и др.

Актуальность темы исследования
Персонифицированная медицина является перспективным направлением
медицинской науки, развивающимся, за счет широкого использования подходов
системной биологии и медицины, а также использования профилактики и
предиктивной диагностики [15,93,101]. Ядром предиктивной диагностики
являются ОМИК-технологии, которые за счет использования систем
распознавания образов и многомерной статистики могут успешно обрабатывать
большие массивы данных, извлекая, необходимую информацию [137,188].
ОМИК-технологии на сегодняшний момент динамично развиваются и
применяются в диагностике неизлечимых или трудноизлечимых заболеваний со
сложной, стертой симптоматикой или протекающих бессимптомно за счет
выявления новых критериев и установления, решающих правил. Динамично
расширяется как спектр диагностируемых заболеваний, так и спектр химических
соединений, которые до сих пор не имели диагностической значимости в рамках
диагностики, используемой, в реактивной медицине [105,112,162,201,214].
Микробиом, рассматриваемый как отдельный орган человека, в
существенной степени влияет на регуляцию генов и индивидуальное развитие
макроорганизма, имеет рещающее значение для его иммунологического,
гормонального и метаболического гомеостаза [17]. В процессе симбиотической
деятельности макро- и микроорганизмов в кровь непрерывно поступают
жизненно необходимые биологически активные молекулы, образованные как в
процессе переработки поступающей пищи, так и жизнедеятельности бесконечно
огромного числа самых разнообразных бактерий, архей, грибов, вирусов [45].
Качество и количество поступающих молекул определяют характер развития и
жизнеспособность макроорганизма на всем этапе его жизненного цикла.
Патологический синдром, связанный, например, с нарушением обмена
низкомолекулярных составляющих липидов и липопротеидов, т.е. изменением
соотношения их концентрации в крови, является одним из главных факторов
риска атеросклероз зависимых заболеваний [6,20]. Дефицит или избыток
углеводов – к различным видам диабета. Развитию гипергликемии предшествует
развитие дислипидемии [11, 12,13, 98,95,186,203].
Огромное количество факторов, влияющих на качественный и
количественный состав генерируемых микробиотой низкомолекулярных
соединений и их генетическая связь с продуцентом диктует необходимость
разработки технологии микробиом-ассоциированной экспосомики, способной
описать совокупность факторов окружающей среды, влияющих на регуляцию
генов и индивидуальное развитие организмов [175]. «Хотя экспосом, в отличие от
генома, не является внутри- или межклеточным параметром, учет вклада
окружающей среды необходим для прогнозирования фенотипа организма, а также
ранней диагностики и индивидуализированного подбора лечения [53,211,143,200].
Таким образом, получение методом высокоэффективной хромато-масс-
спектрометрии и линейного дискриминационного анализа прецизионных
качественных и количественных критериев экспосома, связанных с продукцией и
регистрацией в крови низкомолекулярных компонентов крови, жирные кислоты,
спирты, альдегиды, стерины), продуцируемых бактериями микробиоты
желудочно-кишечного тракта с последующим выбором молекул-маркеров,
ответсвенных за патологический процесс макроорганизма на примере диабета и
сочетанной дислипидемии у пациентов пожилого возраста и создание с
применением многомерной статистики, систем распознавания образов и «омик-
технологий», технологии микробиом-ассоциированной экспосомики для
интегральной оценки нарушений липидного и углеводного обмена по
химическому составу выбранных маркеров [4,14] является актуальным.
Применение микробиом-ассоциированной экспосомики, как методики
интегральной оценки микробно-тканевого комплекса силизистой оболочки ЖКТ
может быть особенно эффективно при нарушении обмена веществ, а именно при

Заказать новую

Лучшие эксперты сервиса ждут твоего задания

от 5 000 ₽

Не подошла эта работа?
Закажи новую работу, сделанную по твоим требованиям

    Нажимая на кнопку, я соглашаюсь на обработку персональных данных и с правилами пользования Платформой

    Читать

    Читать «Разработка метода микробиом-ассоциированной экспосомики для интегральной оценки нарушений липидного и углеводного обмена у лиц пожилого возраста»

    Публикации автора в научных журналах

    Оценка степени тяжести сахарного диабета 2 типа методом микробиом-ассоциированной экспосомики у пациентов с нарушениями углеводного и липидного обмена
    А.М. Затевалов, С.Л. Безродный, С. Г. Марданлы, А. Ю. Миронов, В. В.Помазанов//ИзвестияГГТУ-Медицина*Фармация,Орехово-Зуево,РИОГГТУ.– 2– Т.008,No– С.7-Безродный, С.Л. Возможности применения пробиотиков в антивозрастном аспекте // Попова Е.Н., Орлова А.С., Пономарев А.Б., Суворов А.Н., Безродный С.Л., Шендеров Б.А. В книге: микробиота. под редакцией Е.Л. Никонова и Е.Н. Поповой. Москва. – 2– С. 198

    Помогаем с подготовкой сопроводительных документов

    Совместно разработаем индивидуальный план и выберем тему работы Подробнее
    Помощь в подготовке к кандидатскому экзамену и допуске к нему Подробнее
    Поможем в написании научных статей для публикации в журналах ВАК Подробнее
    Структурируем работу и напишем автореферат Подробнее

    Хочешь уникальную работу?

    Больше 3 000 экспертов уже готовы начать работу над твоим проектом!

    Кормчий В.
    4.3 (248 отзывов)
    Специализация: диссертации; дипломные и курсовые работы; научные статьи.
    Специализация: диссертации; дипломные и курсовые работы; научные статьи.
    #Кандидатские #Магистерские
    335 Выполненных работ
    Александр Р. ВоГТУ 2003, Экономический, преподаватель, кандидат наук
    4.5 (80 отзывов)
    Специальность "Государственное и муниципальное управление" Кандидатскую диссертацию защитил в 2006 г. Дополнительное образование: Оценка стоимости (бизнеса) и госфин... Читать все
    Специальность "Государственное и муниципальное управление" Кандидатскую диссертацию защитил в 2006 г. Дополнительное образование: Оценка стоимости (бизнеса) и госфинансы (Казначейство). Работаю в финансовой сфере более 10 лет. Банки,риски
    #Кандидатские #Магистерские
    123 Выполненных работы
    Оксана М. Восточноукраинский национальный университет, студент 4 - ...
    4.9 (37 отзывов)
    Возможно выполнение работ по правоведению и политологии. Имею высшее образование менеджера ВЭД и правоведа, защитила кандидатскую и докторскую диссертации по политоло... Читать все
    Возможно выполнение работ по правоведению и политологии. Имею высшее образование менеджера ВЭД и правоведа, защитила кандидатскую и докторскую диссертации по политологии.
    #Кандидатские #Магистерские
    68 Выполненных работ
    Андрей С. Тверской государственный университет 2011, математический...
    4.7 (82 отзыва)
    Учился на мат.факе ТвГУ. Любовь к математике там привили на столько, что я, похоже, никогда не перестану этим заниматься! Сейчас работаю в IT и пытаюсь найти время на... Читать все
    Учился на мат.факе ТвГУ. Любовь к математике там привили на столько, что я, похоже, никогда не перестану этим заниматься! Сейчас работаю в IT и пытаюсь найти время на продолжение диссертационной работы... Всегда готов помочь! ;)
    #Кандидатские #Магистерские
    164 Выполненных работы
    Алёна В. ВГПУ 2013, исторический, преподаватель
    4.2 (5 отзывов)
    Пишу дипломы, курсовые, диссертации по праву, а также истории и педагогике. Закончила исторический факультет ВГПУ. Имею высшее историческое и дополнительное юридическо... Читать все
    Пишу дипломы, курсовые, диссертации по праву, а также истории и педагогике. Закончила исторический факультет ВГПУ. Имею высшее историческое и дополнительное юридическое образование. В данный момент работаю преподавателем.
    #Кандидатские #Магистерские
    25 Выполненных работ
    Мария М. УГНТУ 2017, ТФ, преподаватель
    5 (14 отзывов)
    Имею 3 высших образования в сфере Экологии и техносферной безопасности (бакалавриат, магистратура, аспирантура), работаю на кафедре экологии одного из опорных ВУЗов РФ... Читать все
    Имею 3 высших образования в сфере Экологии и техносферной безопасности (бакалавриат, магистратура, аспирантура), работаю на кафедре экологии одного из опорных ВУЗов РФ. Большой опыт в написании курсовых, дипломов, диссертаций.
    #Кандидатские #Магистерские
    27 Выполненных работ
    Дмитрий М. БГАТУ 2001, электрификации, выпускник
    4.8 (17 отзывов)
    Помогаю с выполнением курсовых проектов и контрольных работ по электроснабжению, электроосвещению, электрическим машинам, электротехнике. Занимался наукой, писал стать... Читать все
    Помогаю с выполнением курсовых проектов и контрольных работ по электроснабжению, электроосвещению, электрическим машинам, электротехнике. Занимался наукой, писал статьи, патенты, кандидатскую диссертацию, преподавал. Занимаюсь этим с 2003.
    #Кандидатские #Магистерские
    19 Выполненных работ
    Вики Р.
    5 (44 отзыва)
    Наличие красного диплома УрГЮУ по специальности юрист. Опыт работы в профессии - сфера банкротства. Уровень выполняемых работ - до магистерских диссертаций. Написан... Читать все
    Наличие красного диплома УрГЮУ по специальности юрист. Опыт работы в профессии - сфера банкротства. Уровень выполняемых работ - до магистерских диссертаций. Написание письменных работ для меня в удовольствие.Всегда качественно.
    #Кандидатские #Магистерские
    60 Выполненных работ
    Рима С.
    5 (18 отзывов)
    Берусь за решение юридических задач, за написание серьезных научных статей, магистерских диссертаций и дипломных работ. Окончила Кемеровский государственный универси... Читать все
    Берусь за решение юридических задач, за написание серьезных научных статей, магистерских диссертаций и дипломных работ. Окончила Кемеровский государственный университет, являюсь бакалавром, магистром юриспруденции (с отличием)
    #Кандидатские #Магистерские
    38 Выполненных работ

    Последние выполненные заказы

    Другие учебные работы по предмету

    Анализ формирования и микроструктуры биопленок Azospirillum baldaniorum
    📅 2022 год
    🏢 ФБУН «Государственный научный центр прикладной микробиологии и биотехнологии»
    Сульфатредуцирующие и нефтеокисляющие бактерии донных отложений северной части Японского моря
    📅 2022 год
    🏢 ФГБУН Пермский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
    Гены-регуляторы синтеза экзополисахаридов в формировании биопленок Rhizobium leguminosarum
    📅 2022 год
    🏢 ФГБУН Пермский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
    Поиск новых свойств эндофитных бактерий Bacillus subtilis Cohn.
    📅 2021 год
    🏢 ФГБУН Пермский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
    Молекулярно-генетический и биоинформационный скрининг вирулентных бактериофагов Staphylococcus aureus на основе анализа CRISPR/Cas-системы бактерии
    📅 2021 год
    🏢 ФГБУН Пермский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
    Конъюгативный перенос производной F-плазмиды в клетки штаммов экстраинтестинальной Escherichia coli
    📅 2021 год
    🏢 ФГБУН Пермский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
    Новые рекомбинантные белки – антигены TREPONEMA PALLIDUM для серологической диагностики сифилиса
    📅 2021 год
    🏢 ФГБУ «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации
    Оптимизация микробиологической диагностики инфекционных осложнений, вызванных нетуберкулезными микобактериями, у пациентов с муковисцидозом
    📅 2022 год
    🏢 ФГБОУ ВО «Южно-Уральский государственный медицинский университет» Министерства здравоохранения Российской Федерации
    Оценка свойств пробиотических и аутопробиотических штаммов лактобацилл разными методами
    📅 2022 год
    🏢 ФГБНУ «Научно-исследовательский институт вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова»