Метаболомы литоральных водорослей-макрофитов Белого моря

Ильин Александр Александрович
Бесплатно
В избранное
Работа доступна по лицензии Creative Commons:«Attribution» 4.0

Водоросли литорали обитают в жёстких условиях, подвергаясь действию многочисленных абиотических факторов. В их число входят изменение солёности, оводнённости, температуры окружающей среды и освещённости. При этом на литорали обитают водоросли из различных эволюционных линий – зелёной, красной и бурой. Благодаря различному происхождению организмы разных таксонов могут иметь различные механизмы адаптации к этим экстремальным условиям, которые у прикреплённых организмов представлены изменением биохимического состава. В данной работе с помощью метаболомного анализа были исследованы водоросли 9 видов, Ulva intestinalis, Cladophora fracta, Cladophora rupestris, Palmaria palmata, Odonthalia dentata, Fucus serratus, Fucus disthicus, Ascophyllum nodosum и Pelvetia canalliculata, относящиеся к зелёным, красным и бурым линиям. С помощью различных методов кластеризации были показаны группы, в которые объединяются образцы по полученным данным, а также были выявлены метаболиты, содержание которых свойственно каждой из эволюционных групп.

Большая часть Земли покрыта морями. Условия этой среды весьма разнообразны и обеспечивают спектр экосистем с различным сочетанием солёности, интенсивности УФ излучения, температуры, давления. Одним из важнейших компонентов морских являются водоросли. Их роль состоит в продукции биомассы, кислорода, участии в пищевых сетях и образовании убежищ для других видов. По данным на начало 2010-ых годов, известно около 32000 видов водорослей (Guiry, 2012). Их число продолжает увеличиваться с каждым новым открытым видом.
Один из признаков, по которым можно разделить водоросли – прикреплённость. Часть водорослей способна к перемещению в пространстве, в то время как другая постоянно прикреплена к субстрату. Вторая группа интересна сравнительно большим количеством сформированных биохимических механизмов адаптации к изменению внешних условий, что вызвано отсутствием возможности избежать действия неблагоприятных факторов и изменить условия произрастания на более оптимальные.
Пожалуй, наибольшее число стрессовых факторов выявляется на литорали. Это связано с тем, что она находится на границе моря и периодически осушается. Из-за этого амплитуда действия многих стрессоров возрастает.
При этом водоросли вообще, и в частности водоросли-макрофиты, обитающие на литорали, являются очень разнородной группой, включающей в себя предположительно несколько эволюционных ветвей (Keeling, 2010). Благодаря различной эволюции организмы разных таксонов могут иметь различные механизмы адаптации к этим экстремальным условиям.
Исследование механизмов адаптации к абиотическим факторам весьма интересно по многим причинам. Во-первых, накапливаются знания об существующих способах переносить изменения окружающей среды. Во-вторых, сравнение близких эволюционных групп позволяет реконструировать ход эволюции. В-третьих, изучение возможных механизмов адаптационных изменений при действии экстремальных условий позволяет расширить практическое использования полученных данных при регуляции устойчивости, в том числе культурных растений. Значение исследования водорослей-макрофитов важно с прикладной точки зрения, так как многие из них используются как продукты питания благодаря их съедобности и наличию ценных питательных веществ (например, полиненасыщенных жирных кислот), содержат различные потенциально применимые в фармацевтике или исследованиях вещества (к примеру, фукоксантин и каиновая кислота). Всё это ведёт к росту числа исследований, посвящённых метаболическим адаптациям к абиотическим условиям среды водорослей(Jørgensen& Olesen, 2018).

Poolman, M. G., Miguet, L., Sweetlove, L. J., & Fell, D. A. (2009). A Genome-Scale Metabolic Model of Arabidopsis and Some of Its Properties. Plant Physiology, 151(3), 1570–1581. https://doi.org/10.1104/pp.109.141267
Förster, J., Famili, I., Palsson, B. O., & Nielsen, J. (2003). Large-scale evaluation of in silico gene deletions in Saccharomyces cerevisiae. Omics : A Journal of Integrative Biology, 7(2), 193–202. https://doi.org/10.1089/153623103322246584
Edwards, J. S., & Palsson, B. O. (2000). Robustness Analysis of the Escherichia coli Metabolic Network, 927–939.
Prigent, S., Collet, G., Dittami, S. M., Delage, L., Ethis de Corny, F., Dameron, O., … Tonon, T. (2014). The genome-scale metabolic network of Ectocarpus siliculosus (EctoGEM): a resource to study brown algal physiology and beyond. The Plant Journal, 80(2), 367–381. https://doi.org/10.1111/tpj.12627
Coyer, J. A., Hoarau, G., Pearson, G., Mota, C., Jüterbock, A., Alpermann, T., … Olsen, J. L. (2011). Genomic scans detect signatures of selection along a salinity gradient in populations of the intertidal seaweed Fucus serratus on a 12km scale. Marine Genomics, 4(1), 41–49.
Groisillier, A., Shao, Z., Michel, G., Goulitquer, S., Bonin, P., Krahulec, S., … Tonon, T. (2014). Mannitol metabolism in brown algae involves a new phosphatase family. Journal of Experimental Botany, 65(2), 559–570.
Tarver, J. E., Cormier, A., Pinzón, N., Taylor, R. S., Carré, W., Strittmatter, M., … Cock, J. M. (2015). microRNAs and the evolution of complex multicellularity: Identification of a large, diverse complement of microRNAs in the brown alga Ectocarpus. Nucleic Acids Research, 43(13), 6384–6398.
Brawley, S. H., Blouin, N. A., Ficko-Blean, E., Wheeler, G. L., Lohr, M., Goodson, H. V., … Prochnik, S. E. (2017). Insights into the red algae and eukaryotic evolution from the genome of Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta). Proceedings of the National Academy of Sciences, 114(31), E6361–E6370. https://doi.org/10.1073/pnas.1703088114
Rahelivao, M. P., Gruner, M., Andriamanantoanina, H., Andriamihaja, B., Bauer, I., & Knölker, H. J. (2015). Red algae (Rhodophyta) from the coast of Madagascar: Preliminary bioactivity studies and isolation of natural products. Marine Drugs, 13(7), 4197–4216. https://doi.org/10.3390/md13074197
Rees, D. A., & Conway, E. (1962). The structure and biosynthesis of porphyran: a comparison of some samples. The Biochemical Journal, 84(1), 411–416.
Keeling, P. J. (2010). The endosymbiotic origin , diversification and fate of plastids, 729–748.
Sagert, S., & Schubert, H. (1995). Acclimation of the Photosynthetic Apparatus of Palmaria Palmata (Rhodophyta) To Light Qualities That Preferentially Excite Photosystem I or Photosystem Ii1. Journal of Phycology, 31(4), 547–554.
Holzinger, A., Lütz, C., Karsten, U., & Wiencke, C. (2004). The effect of ultraviolet radiation on ultrastructure and photosynthesis in the red macroalgae Palmaria palmata and Odonthalia dentata from arctic waters. Plant Biology, 6(5), 568–577.
Sturm, S., Engelken, J., Gruber, A., Vugrinec, S., Kroth, P. G., Adamska, I., & Lavaud, J. (2013). A novel type of light-harvesting antenna protein of red algal origin in algae with secondary plastids.
Cock, J. M., Sterck, L., Rouzé, P., Scornet, D., Allen, A. E., Amoutzias, G., … Wincker, P. (2010). The Ectocarpus genome and the independent evolution of multicellularity in brown algae. Nature, 465(7298), 617–621.
Škaloud, P., Kalina, T., Nemjová, K., De Clerck, O., & Leliaert, F. (2013). Morphology and Phylogenetic Position of the Freshwater Green Microalgae Chlorochytrium (Chlorophyceae) and Scotinosphaera (Scotinosphaerales, ord. nov., Ulvophyceae). Journal of Phycology, 49(1), 115–129.
Arriola, M. B., Velmurugan, N., Zhang, Y., Plunkett, M. H., Hondzo, H., & Barney, B. M. (2018). Genome sequences of Chlorella sorokiniana UTEX 1602 and Micractinium conductrix SAG 241.80: implications to maltose excretion by a green alga. The Plant Journal, 93(3), 566–586.
Bogen, C., Al-Dilaimi, A., Albersmeier, A., Wichmann, J., Grundmann, M., Rupp, O., … Kruse, O. (2013). Reconstruction of the lipid metabolism for the microalga Monoraphidium neglectum from its genome sequence reveals characteristics suitable for biofuel production. BMC Genomics, 14(1).
Guiry, M. D. (2012). HOW MANY SPECIES OF ALGAE ARE THERE? Journal of Phycology, 48(5), 1057–1063. https://doi.org/10.1111/j.1529-8817.2012.01222.x
Morrow, E. H. (2004). How the sperm lost its tail : the evolution of aflagellate sperm, 795–814.
Fisher, R. A. (1938). The statistical utilization of multiple measurements. Annals of Eugenics, 8(4), 376–386.
Saul, L. K., Ave, P., Park, F., & Roweis, S. T. (n.d.). An Introduction to Locally Linear Embedding, 1–13.
Pearson, Karl (1901). On Lines and Planes of Closest Fit to Systems of Points in Space, Philosophical Magazine, 6th Series, Vol. II, pp. 559–572.
Rao, C.R. (1948) The Utilization of Multiple Measurements in Problems of Biological Classification. Journal of the Royal Statistical Society: Series B, 10, 159-203.
R. Sibson (1973). SLINK: an optimally efficient algorithm for the single-link cluster method. The Computer Journal. British Computer Society. 16 (1): 30–34.:
Ester, M., Kriegel, H., Xu, X., & Miinchen, D.-. (1996). A Density-Based Algorithm for Discovering Clusters in Large Spatial Databases with Noise.
Macqueen, J. (1967). SOME METHODS FOR CLASSIFICATION AND ANALYSIS OF MULTIVARIATE OBSERVATIONS. In 5-Th Berkeley Symposium on Mathematical Statistics and Probability, 233(233), 281–297.
Ho, T. K. (1995). Random Decision Forests Perceptron training.

Заказать новую

Лучшие эксперты сервиса ждут твоего задания

от 5 000 ₽

Не подошла эта работа?
Закажи новую работу, сделанную по твоим требованиям

    Нажимая на кнопку, я соглашаюсь на обработку персональных данных и с правилами пользования Платформой

    Хочешь уникальную работу?

    Больше 3 000 экспертов уже готовы начать работу над твоим проектом!

    Юлия К. ЮУрГУ (НИУ), г. Челябинск 2017, Институт естественных и т...
    5 (49 отзывов)
    Образование: ЮУрГУ (НИУ), Лингвистический центр, 2016 г. - диплом переводчика с английского языка (дополнительное образование); ЮУрГУ (НИУ), г. Челябинск, 2017 г. - ин... Читать все
    Образование: ЮУрГУ (НИУ), Лингвистический центр, 2016 г. - диплом переводчика с английского языка (дополнительное образование); ЮУрГУ (НИУ), г. Челябинск, 2017 г. - институт естественных и точных наук, защита диплома бакалавра по направлению элементоорганической химии; СПХФУ (СПХФА), 2020 г. - кафедра химической технологии, регулирование обращения лекарственных средств на фармацевтическом рынке, защита магистерской диссертации. При выполнении заказов на связи, отвечаю на все вопросы. Индивидуальный подход к каждому. Напишите - и мы договоримся!
    #Кандидатские #Магистерские
    55 Выполненных работ
    Вики Р.
    5 (44 отзыва)
    Наличие красного диплома УрГЮУ по специальности юрист. Опыт работы в профессии - сфера банкротства. Уровень выполняемых работ - до магистерских диссертаций. Написан... Читать все
    Наличие красного диплома УрГЮУ по специальности юрист. Опыт работы в профессии - сфера банкротства. Уровень выполняемых работ - до магистерских диссертаций. Написание письменных работ для меня в удовольствие.Всегда качественно.
    #Кандидатские #Магистерские
    60 Выполненных работ
    Ольга Б. кандидат наук, доцент
    4.8 (373 отзыва)
    Работаю на сайте четвертый год. Действующий преподаватель вуза. Основные направления: микробиология, биология и медицина. Написано несколько кандидатских, магистерских... Читать все
    Работаю на сайте четвертый год. Действующий преподаватель вуза. Основные направления: микробиология, биология и медицина. Написано несколько кандидатских, магистерских диссертаций, дипломных и курсовых работ. Слежу за новинками в медицине.
    #Кандидатские #Магистерские
    566 Выполненных работ
    Екатерина Д.
    4.8 (37 отзывов)
    Более 5 лет помогаю в написании работ от простых учебных заданий и магистерских диссертаций до реальных бизнес-планов и проектов для открытия своего дела. Имею два об... Читать все
    Более 5 лет помогаю в написании работ от простых учебных заданий и магистерских диссертаций до реальных бизнес-планов и проектов для открытия своего дела. Имею два образования: экономист-менеджер и маркетолог. Буду рада помочь и Вам.
    #Кандидатские #Магистерские
    55 Выполненных работ
    Дарья С. Томский государственный университет 2010, Юридический, в...
    4.8 (13 отзывов)
    Практикую гражданское, семейное право. Преподаю указанные дисциплины в ВУЗе. Выполняла работы на заказ в течение двух лет. Обучалась в аспирантуре, подготовила диссерт... Читать все
    Практикую гражданское, семейное право. Преподаю указанные дисциплины в ВУЗе. Выполняла работы на заказ в течение двух лет. Обучалась в аспирантуре, подготовила диссертационное исследование, которое сейчас находится на рассмотрении в совете.
    #Кандидатские #Магистерские
    18 Выполненных работ
    Катерина М. кандидат наук, доцент
    4.9 (522 отзыва)
    Кандидат технических наук. Специализируюсь на выполнении работ по метрологии и стандартизации
    Кандидат технических наук. Специализируюсь на выполнении работ по метрологии и стандартизации
    #Кандидатские #Магистерские
    836 Выполненных работ
    Александр О. Спб государственный университет 1972, мат - мех, преподав...
    4.9 (66 отзывов)
    Читаю лекции и веду занятия со студентами по матанализу, линейной алгебре и теории вероятностей. Защитил кандидатскую диссертацию по качественной теории дифференциальн... Читать все
    Читаю лекции и веду занятия со студентами по матанализу, линейной алгебре и теории вероятностей. Защитил кандидатскую диссертацию по качественной теории дифференциальных уравнений. Умею быстро и четко выполнять сложные вычислительные работ
    #Кандидатские #Магистерские
    117 Выполненных работ
    Елена С. Таганрогский институт управления и экономики Таганрогский...
    4.4 (93 отзыва)
    Высшее юридическое образование, красный диплом. Более 5 лет стажа работы в суде общей юрисдикции, большой стаж в написании студенческих работ. Специализируюсь на напис... Читать все
    Высшее юридическое образование, красный диплом. Более 5 лет стажа работы в суде общей юрисдикции, большой стаж в написании студенческих работ. Специализируюсь на написании курсовых и дипломных работ, а также диссертационных исследований.
    #Кандидатские #Магистерские
    158 Выполненных работ
    Анастасия Б.
    5 (145 отзывов)
    Опыт в написании студенческих работ (дипломные работы, магистерские диссертации, повышение уникальности текста, курсовые работы, научные статьи и т.д.) по экономическо... Читать все
    Опыт в написании студенческих работ (дипломные работы, магистерские диссертации, повышение уникальности текста, курсовые работы, научные статьи и т.д.) по экономическому и гуманитарному направлениях свыше 8 лет на различных площадках.
    #Кандидатские #Магистерские
    224 Выполненных работы

    Другие учебные работы по предмету